Information

Vad är bilagan efter detta gennamn, efter kommatecken: SULF1, hCG18956?

Vad är bilagan efter detta gennamn, efter kommatecken: SULF1, hCG18956?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Vad betyder den här delen: hCG18956? Är det en alternativ namnkonvention för gener? Jag försöker läsa in en lista över gennamn med R, men jag har ingen omfattande biologibakgrund.

Det finns några rader där gennamn inte är listade. Bara något sånt här: hCG1809003. Betyder det att det inte finns något lämpligt gennamn?


Här står hCG för "human Celera Genome". hCG-prefixerade protein- och gendeskriptorer används som en sista utväg för gener som bara finns i Celeras databas.

Se till exempel http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/119619226 , genen du kallade "hCG1809003". Som det står i posten lämnades detta in av Celera 2005 som en förmodad gen, efter att ha hittats genom "konceptuell översättning", det vill säga genom att skanna data från Genome Project efter start- och stoppkodon. Det är troligt att den här genen ännu inte har hittats som RNA eller protein - eftersom de enda referenserna för den genen är Celeras inlämning och Genome Project paper. Ändå letar Celeras sekvensering (och mikroarray!) programvara och chips fortfarande efter det.

Dina två exempelgener kom så småningom till GenBank. Det första exemplet har till och med ett eget namn och en funktion tilldelad - sulfatas 1. Många gener finns kvar i hCG-limbo.


Resultat och diskussion kan antingen kombineras eller behandlas separat. Resultaten ska presenteras kortfattat med hjälp av tabeller och figurer. Samma data får inte användas i båda. Lämpliga statistiska uppgifter bör ges.
Diskussionen måste utvecklas logiskt i rätt ordning och bör täcka konsekvenserna och konsekvenserna, inte bara rekapitulera resultaten. Slutsatser kan slås samman med diskussion eller tillhandahållas separat.

Författarnas bidrag

Tänkte och designade experimenten:

Utförde experimenten:

Bidragit material/analys/verktyg:

Erkännanden

Människor som hjälpte till i denna studie men som inte uppfyller standardkriterierna för författarskap och finansieringsorganen med sina bidrag bör inkluderas i detta avsnitt. Du måste ha deras samtycke för att nämna deras namn.

Enligt PAB-policyn är endast publicerade och artiklar i pressen (online först) acceptabla som referenser. Numreringssystemet för referenser ska användas i texten. Referenser bör numreras, ordnas sekventiellt (stigande ordning) som de visas i texten som [1, 2, 3, 4] genom hela manuskriptet. Om citatet innehåller mer än ett verk bör referensnumren visas inom en uppsättning parenteser, separerade med kommatecken: t.ex. [2, 5].

Alla referenser ska anges under rubriken "Referenser" i slutet, bredvid Acknowledgements och numreras i den ordning som de förekommer i texten.

Referenser måste formateras i APA-stil med följande ändringar:

    1. Efter-/efternamn på författare(r) följt av för- och mellannamnsinitialer (versaler) och författarnamn separerade med kommatecken måste användas.t.ex. Baloch IA, Malik MK, Zhang B.
    2. Utgivningsår ska finnas alldeles bredvid namnet på senaste författare inom parentes, t.ex. (2020).
    3. Fullständig titel bredvid utgivningsåret måste anges.
    4. Tidskriftsnamn ska förkortas enligt ISI Web of Sciences förkortning.
    5. Journalvolymnummer följt av sidnummer måste anges för varje referens.

    Tidskriftsartiklar
    1. Baloch IA & Din M (2020). Bioinformatisk jakt på mikroRNA. Pure Appl Biol 3(1): 2523-2532.

    Böcker
    2. Awan JA (2002). Livsmedelsbearbetning och konservering. 1:a upplagan. Unitech Communications Faisalabad (Pakistan). 135 sid
    Om staden är välkänd behöver du inte ange landet, annars ska land skrivas inom parentes efter staden.

    Kapitel i böcker

    3. Hansen B (1991). New York City-epidemier och historia för allmänheten. I: Harden VA, Risse GB, redaktörer. AIDS och historikern. Bethesda: National Institutes of Health. s. 21-28.

    Avhandlingar eller rapporter
    4. Qaisrani TB (1998). Användning av konstgjorda sötningsmedel i Kinnow-dryck. M.Sc. avhandling. Avd. of Food Tech., Univ. Agri., Faisalabad

    Förfaranden

    5. Ahmad, MT & MA Khan (2003). Proc. Pak. Assoc. Sci., 12:59.

    Figurer och tabeller

    Alla illustrationer såsom fotografier, ritningar, skisser, grafer och etc betraktas som figurer. Färgfigurerna uppmuntras till inlämning. Figurer ska numreras fortlöpande utifrån deras utseende i texten, t.ex. Figur 1. Bildtexten/legenden ska beskriva figurens huvudtema och måste bestå av en titel på 15 eller färre ord med en detaljerad självbeskrivning som gör att läsarna kan förstå den utan att hänvisa till texten.

    Tabeller – Nummertabeller i följd genom hela manuskriptet på deras utseende i texten, t.ex. Tabell 1. Alla numrerade tabeller ska hänvisas till i texten. Tabellen bör vara få till antalet, noggrant utformad, uncrowded innehålla endast väsentliga data. Håll kolumnrubriker och beskrivande saker korta och använd inte vertikala regler mellan kolumner. Endast tabeller som kompletterar texten, snarare som duplicerar den, kommer att accepteras. Håll borden i en rimlig storlek. Stora bord bör delas in i komponenter. Tabelltiteln måste vara kortfattad och självförklarande. Fotnoter kan användas för att förklara förkortningar. Citat bör inkluderas med samma mönster som beskrivs ovan.

    Alla figurer och tabeller med deras bildtexter/legender måste tillhandahållas i slutet av manuskriptet bredvid Referenser.

    Tillträdesnummer

    Alla lämpliga datauppsättningar, bilder och information bör deponeras i relevanta offentliga resurser. De relevanta åtkomstnumren tillsammans med versionsnumret (om tillämpligt) ska anges inom parentes efter enheten vid första användningen. Föreslagna databaser inkluderar, men är inte begränsade till:

    Akronymer måste definieras vid första omnämnandet i texten. Använd standardförkortningar.
    Enheter och valutor – Använd metriska/SI-enheter (System international) genom hela manuskriptet. Om icke-SI-enheter måste användas, vänligen konvertera till rätt SI-enhet.

    Formatera stil

    Creative Common License

    Artiklarna publiceras i PAB som artiklar med öppen tillgång som distribueras under villkoren för Creative Commons Attribution (CC-BY)-licensen (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).

    Publikationsavgift

    Publikationsavgift: PKR. 12 000/= (för lokal författare) och 300 US$ (för internationell författare) kommer att debiteras som publiceringsavgift efter godkännande av papper. Det tillkommer inga avgifter för manuskriptbehandling innan godkännande.

    Publikationsavgiften kan betalas med check, bankväxel eller Swift Telex Transfer.

    Publikationsavgiften ska skickas till

    Bank A/C Titel. Ren och tillämpad biologi

    Gren-kod. 0873

    Bank A/C nr 0873-79006511-03
    Bankens namn och adress: Habib Bank Limited, University of Balochistan Branch, Quetta, Pakistan.
    International Bank A/C nr. PK21 HABB 0008 7379 0065 1103

    Alla artiklar avsedda för publicering i tidskriften ska adresseras och e-postas i dokumentformat till:


    Fallstudie: Hur man överlever en koleraepidemi

    • Bidragit av Shannan Muskopf
    • Biologiinstruktör på gymnasiet vid Granite City School District
    • Kommer från Biology Corner

    Del I &ndash Det&rsquos i vattnet!

    Byborna var inte obekanta med den säsongsbetonade sjukdomen som skulle komma med regnet, även om de flesta inte förstod den bakomliggande orsaken. Symtomen var alltid desamma, ett snabbt insättande av mycket vattnig diarré. Så mycket som en liter vatten skulle förloras varje timme och personen skulle bli uttorkad, ögonen sjunkna och oförmögen att äta. Det fanns till och med ett namn för denna specifika typ av diarré, &ldquorice-vattenavföring&rdquo, eftersom det liknade vatten som ris hade sköljts i. Barn var de mest sårbara, och många skulle dö varje år av denna fruktade sjukdom: kolera.

    Av desperation skulle många bybor bära masker eller undvika kontakt med sjuka, men sådana ansträngningar var ofta ineffektiva, de skulle fortfarande bli sjuka. I år var annorlunda, i år kom en grupp forskare från Europa för att hjälpa till. De sa till byborna att ge de sjuka en blandning av vatten, socker och salt. De undersökte den gemensamma brunnen som var den huvudsakliga vattenkällan.

    Byborna blev förvånade när forskarna hällde någon sorts vätska i brunnen, som de sa var medicin. Några av byborna var rädda och vägrade att dricka vattnet, istället hämtade de från en närliggande brunn, de tömde till och med den ursprungliga brunnen som utlänningarna hade lagt till behandlingen. Européerna återvände och upptäckte att byborna använde vatten från andra närliggande obehandlade brunnar, så de placerade också kemikalien i dessa, och till andra brunnar hällde de ett lila färgämne för att avskräcka människor från att dricka vattnet där. Byborna tvingades dricka ur den behandlade brunnen.

    Efter några dagar slutade folk i byn att bli sjuka. Bidrog kemikalien som hälldes i brunnen till att stoppa spridningen av sjukdomen?

    * Notera: Detta fall är fiktivt, men liknande händelser ägde rum i Indien 1926 (Hausler, 2006, s. 84&ndash85)

    1. Överväg åtgärder som vidtagits av en utländsk enhet på byn. Vilka etiska frågor väcker det att påtvinga byborna en behandling utan deras samtycke? Vilka åtgärder kunde de ha tagit som skulle ha gjort situationen mer acceptabel?
    2. När är det lämpligt att tvinga på en befolkning? Kom ihåg att i Nordamerika sätter många städer fluor i vattnet för att förhindra karies.

    Vad finns i vattnet?

    Kolera orsakas av en bakterie: Vibrio cholerae är en kommaformad bakterie med ett enda flagellum, och klassificeras som gramnegativ. Det är typiskt för de flesta prokaryoter strukturellt. Inte alla V. cholerae orsaka sjukdom, men de som gör det kan orsaka allvarlig diarré och kräkningar timmar efter injektionen. Under infektion koloniserar bakterierna tunntarmen och använder sina pili för att fästa vid värdcellerna. Alla som blir smittade blir inte sjuka, och vissa får bara lindriga symtom

    3. Märk bakterien (pili, nukleoid, ribosomer, flagellum, cellmembran, cellvägg)

    Koleratoxinet är ett protein byggt av en specifik DNA-sekvens som finns på patogena kolerabakterier. Toxinet, även känt som koleragen eller CTX, består av sex proteinsubenheter, en av dessa proteiner, CTB, binder till receptorer på cellerna i tunntarmen och aktiverar cyklisk AMP, som är en budbärarmolekyl. Aktiveringen av cyklisk AMP gör att kloridjonkanaler öppnas och rör sig ut ur cellen och in i lumen. Dessa extra kloridjoner drar till sig natriumjoner, vilket ökar antalet joner i lumen. Detta sänker vattenpotentialen, vilket gör att vatten rör sig ner i koncentrationsgradienten och lämnar cellerna, en process som du kanske känner till: osmos. Denna massiva förlust av vatten visar sig hos patienten som vattnig diarré.

    4. Läs beskrivningen ovan som beskriver hur CTX fungerar. Biologer skapar ofta modeller för att hjälpa dem att förstå processer som är svåra att visualisera. Skapa en modell (skiss) som visar hur V. cholerae orsakar diarré. Modellen ska vara detaljerad och kan innehålla kommentarer. Ditt mål är att hjälpa någon annan att förstå vad som händer.

    Hur behandlar man de smittade?

    Behandling av kolera innebär att de förlorade vätskorna och jonerna ersätts. Vårdpersonal kan använda IV&rsquos för att administrera vätskor eller uppmuntra patienten att dricka vatten blandat med glukos och salt. Glukos kan hjälpa till att ge energi till offer som inte har kunnat hålla nere maten, och saltet hjälper cellerna att återställa sin homeostas.

    5. Fräscha upp minnet om matsmältningssystemet. På bilden, identifiera vart och ett av följande och sätt ett X i området som är associerat med symtomen på kolera.

    • Mage
    • Tjocktarm
    • Tunntarm (duodenum)
    • Tunntarmen (jejunum)
    • Bilaga

    Vissa människor kan utsättas för kolera och inte bli smittade. Skillnader i patogenicitet kan vara relaterade till cellmembranet och kanalerna som tillåter förflyttning av klorid- och natriumjoner. De med variationer i dessa transportproteiner kan vara resistenta mot effekterna av toxinet. Faktum är att en mutation i en gen som kodar för ett membrantransportprotein (CFTR) är ansvarig för den genetiska sjukdomen cystisk fibros. Hos människor orsakar denna sjukdom slem att byggas upp i lungorna, vilket gör det svårt att andas. Vissa forskare tyder på att mutationen kvarstår i befolkningen på grund av ett fenomen som kallas &ldquoheterozygote advantage,&rdquo, där att vara bärare av en sjukdom ger dig en fördel. Till exempel är heterozygoter för sicklecellssjukdom resistenta mot malaria, men lider inte av sjukdomens effekter.

    6. Om heterozygotfördel uppstår med CF, i vilka populationer skulle du förvänta dig att se fler individer med CF-genen. Varför?

    7. Föreslå ett sätt att koleratoxinet kan användas som terapi för dem med CF?

    Del II &ndash Var vattnet förorenat?

    När européerna stoppade en kemikalie i brunnen, var det de försökte göra att &ldquoinfektera&rdquo kolerabakterierna. Alla levande varelser i naturen är offer för, och det inkluderar bakterier. Faktum är att bakterier har väldigt små fiender som kallas bakteriofager. Fager är inte tekniskt levande, de behöver energi och de kan reproducera sig själva. De kan invadera en bakterie och kapa cellen för att tvinga den att producera fler fager. Denna infektion är dödlig för bakterierna.

    En bakteriofag är sammansatt av genetisk information (RNA eller DNA) innesluten i en proteinkapsel. Den är formad som en månlandare och har tre distinkta regioner. Huvudet innehåller genetiskt material omgiven av en proteinkappa som kallas den kapsid. De nacke och spiralformad mantel är också sammansatt av proteiner och fungerar som en kanal för att injicera det genetiska materialet i en bakterie &ndash som en spruta. Strax under huvudet är kropp av viruset som sitter på en basplatta och har benliknande förlängningar som kallas svansfibrer används för att docka på en bakterie.

    Proteinerna som utgör basplattan och svansfibrerna har en tredimensionell form som gör var och en unik. Fager är specifika för de bakterier de infekterar eftersom proteinerna måste passa receptorer på cellytan, som ett lås och en nyckel. Anknytning av fagen uppstår när proteinerna matchar receptorerna på cellytan. Genomslag uppstår när fagens DNA kommer in i värdcellen. Väl inne i cellen, biosyntes inträffar, där fagens DNA replikerar och värdcellen producerar proteiner som kommer att användas för att bygga fler fager. I de sista stadierna är fagpartiklarna monterade och sedan frigörs från värdbakterien, en process som kallas lys som förstör värden. Nya fager kan sedan infektera nya värdar.

    8. Använd de understrukna strukturerna i första stycket för att märka bakteriofagen. Varför anses bakteriofager (och virus) inte vara levande organismer?


    9. Anteckna bilden nedan för att beskriva stegen för infektion av en fag med de understrukna orden ovan och numrera dem för att indikera rätt ordning.

    Den illustrerade cykeln kallas lytisk cykel eftersom det leder till produktion av nya virus. Ibland följer virus en annan väg, kallad lysogen cykel. I detta fall integreras det virala genomet i värd-DNA men förblir vilande. Varje gång cellen delar sig bär den med sig den där vilande biten av viralt DNA. Vid någon tidpunkt kommer det virala DNA:t att aktiveras och cellen byter till den lytiska vägen och producerar fler fager. Den lysogena cykeln förekommer också med humana virus. Till exempel kan herpes förbli vilande i din hud och sedan aktiveras, vilket ger ett munsår. Vi förstår alltid orsakerna till denna aktivering, men det brukar aldrig misslyckas att du får munsår dagen innan bilder eller bal.

    10. Skulle byborna behöva dricka upprepade gånger eller bara en gång från de behandlade brunnarna för att få en tillräcklig dos för att fungera som botemedel? Vad är grunden för ditt svar?

    11 . Borde byborna vara oroliga för att detta bakteriella virus ska vara skadligt för deras egna celler? Varför eller varför inte?

    12. Förklara skillnaden mellan den lytiska cykeln och den lysogena cykeln. Vad skulle effekten bli på behandlingen om bakteriofagen som hälldes i brunnarna antog en lysogen livscykel?

    Del III &ndash Hur är det med antibiotika?

    Fager var ett intressant fenomen som inte fick lika stor uppmärksamhet på grund av utvecklingen av antibiotika. Kolera blev lätt att behandla med antibiotika och tanken på att använda fager för att kontrollera infektion förlorade fördel. Antibiotika fungerar genom att skada delar av cellen som människor inte har, till exempel cellväggen. Vissa bakterier är naturligt resistenta mot antibiotika, vilket utgör ett problem för långvarig användning. När antibiotika används är det mer sannolikt att de bakterier som är resistenta överlever. De reproducerar och skapar en ny generation som också är motståndskraftig. Med tiden förlorar antibiotika sin effektivitet. Ökningen av antibiotikaresistenta bakteriestammar är ett stort problem för dagens vetenskapsmän.

    Grafen visar resultatet av ett experiment där tillväxten av en bakteriepopulation övervakades över tid. Tillväxt övervakades genom att mäta kulturens grumlighet (ju grumligare en kultur, desto fler celler finns närvarande). Efter 1 timme delades bakterierna upp i 4 olika kolvar. Bakterierna i var och en av dessa kolvar utsattes för olika behandling (se nedan), och bakterierna inkuberades och deras tillväxt övervakades.

    13. Vilka behandlingar var minst effektiva? Vilka var de mest effektiva?

    14. Användning av antibiotika kan förkorta sjukdomsförloppet. Patienter kan ges antibiotika oralt utöver rehydreringsprotokoll. Patienter kan börja må bättre efter en dag, men de bör fortfarande ta antibiotika. Varför?

    15. Tror du att kolera kan bli resistent mot fager? Varför eller varför inte? Tänk i ditt svar på skillnaderna mellan fagterapi och antibiotika.


    Format för artiklar

    Bidrag ska vara dubbelt spridda och skrivna på engelska (stavningar som i Oxford English Dictionary)

    Bidrag bör organiseras i ordningsföljden: titel, författare, anknytningar (plus nuvarande adresser), fetstil första stycket, huvudtext, huvudreferenser, tabeller, figurförklaringar, metoder (inklusive separata uppgifter och kodtillgänglighet), metodreferenser, erkännanden, författarbidrag, konkurrerande intresseanmälan, tilläggsinformation (innehållande kompletterande informationsrad (i förekommande fall) och motsvarande författarrad), utökad datafigur/tabellförklaringar. För att underlätta granskningsprocessen uppmuntrar vi författare att införliva manuskripttexten och figurerna tillsammans i en enda fil (Microsoft Word eller PDF, upp till 30 MB i storlek) för inledande inlämningar. Figurerna kan infogas i texten på lämpliga platser eller grupperas i slutet, och varje figurförklaring ska presenteras tillsammans med sin figur.Inkludera också radnummer i texten.

    Titlar

    Titlar överstiger inte två rader i tryck. Detta motsvarar 75 tecken (inklusive mellanslag). Titlar innehåller normalt inte siffror, akronymer, förkortningar eller skiljetecken. De bör innehålla tillräckliga detaljer för indexeringsändamål men vara tillräckligt allmänna för att läsare utanför fältet ska förstå vad tidningen handlar om.

    Text

    Artiklar bör inte fylla mer än 5 sidor Natur. En oavbruten textsida innehåller cirka 1 300 ord. En typisk artikel innehåller cirka 2 000-2 500 ord med text och dessutom 3-4 blygsamma visningsobjekt (figurer och/eller tabeller) med korta förklaringar, referenslista och metodavsnitt om tillämpligt. En sammansatt figur (med flera paneler) behöver vanligtvis ta cirka en halv sida, motsvarande cirka 600 ord, för att alla element ska vara synliga (se avsnitt 5.9 för instruktioner om storlek på figurer).

    Vid inlämnande av nya eller reviderade manuskript bör författare i ett följebrev till redaktören ange sin grova uppskattning av längden på deras uppsats i termer av ordantal och även förväntat antal sidor. Natur. Författare till bidrag som avsevärt överskrider de gränser som anges här eller specificeras av redaktören måste förkorta sina tidningar innan de accepteras, vilket oundvikligen försenar publiceringen.

    Natur kräver att författare specificerar bidraget från deras medförfattare i slutet av artikeln (se avsnitt 5.5). Om författare anser att det är viktigt att ange att två eller flera medförfattare har samma status, kan de identifieras med en asterisk med rubriken "Dessa författare har bidragit lika mycket till detta arbete" omedelbart under adresslistan. Om fler än tre medförfattare har samma status ska detta anges i författarbidragsförklaringen. Nuvarande adresser visas omedelbart under författarlistan (under fotnotsregeln längst ner på första sidan) och kan identifieras med en dolksymbol. Alla andra viktiga författarrelaterade förklaringar finns i bekräftelserna.

    Vår föredraget format för text is Microsoft Word, med stiltaggarna borttagna.

    TeX/LaTeX: Om du har förberett ditt papper med TeX/LaTeX, måste vi konvertera detta till Word efter godkännande, innan ditt papper i skrift. Allt textmaterial i uppsatsen (inklusive referenser, tabeller, bildtexter, onlinemetoder, etc.) bör inkluderas som en enda .tex-fil.

    Vi föredrar att använda ett "standard" typsnitt, helst 12-punkts Times New Roman. Använd normal text eller symboltypsnitt för matematiska symboler, grekiska bokstäver och andra specialtecken. Word Equation Editor/MathType bör endast användas för formler som inte kan skapas med normal text eller symboltypsnitt.

    Metoder

    Författaren bör inkludera avsnittet "Metoder" i slutet av texten, efter figurförklaringarna. Denna metodsektion kommer att visas i online-PDF-filen och i fulltextversionen (HTML) av tidningen online, men kommer inte att visas i det tryckta numret. Metodavsnittet bör skrivas så kortfattat som möjligt men bör innehålla alla nödvändiga element för att möjliggöra tolkning och replikering av resultaten. Som en riktlinje överstiger metodavsnitten vanligtvis inte 3 000 ord. För att öka reproducerbarheten uppmuntras författarna att deponera en detaljerad beskrivning av protokoll som används i deras studie i en protokolldelningsplattform som de väljer. Nature Researchs Protocol Exchange är en gratis och öppen tjänst utformad för att hjälpa forskare att dela experimentell kunskap. Protokoll som deponerats av författarna i Protocol Exchange kommer att länkas till avsnittet Onlinemetoder vid publicering.

    Detaljerade beskrivningar av redan publicerade metoder bör undvikas ett referensnummer kan tillhandahållas för att spara utrymme, med eventuella nya tillägg eller variationer angivna.

    Metodavsnittet bör delas in med korta feta rubriker som hänvisar till använda metoder och vi uppmuntrar införandet av specifika underavsnitt för statistik, reagenser och djurmodeller. Om ytterligare referenser ingår i det här avsnittet ska numreringen fortsätta från slutet av det sista referensnumret i resten av artikeln och listan ska åtfölja de ytterligare metoderna i slutet av artikeln.

    Ange ett separat uttalande om datatillgänglighet och kodtillgänglighet efter huvudtextsatserna och innan de utökade dataförklaringarna detaljerad vägledning finns i vår policy för datatillgänglighet och dataciteringar. Vissa datatyper måste deponeras i ett lämpligt offentligt strukturerat datadepå (detaljer finns här), och anslutningsnumren anges i manuskriptet. Full åtkomst krävs vid publicering. Om full tillgång till data krävs för referentgranskning måste författarna tillhandahålla det.

    Metodavsnittet kan inte innehålla figurer eller tabeller (viktiga visningsobjekt bör inkluderas i den utökade data).

    Referenser

    Referenser är var och en numrerad, ordnad i ordningsföljd som de visas i texten, tabeller, rutor, figurförklaringar, metoder endast online, utökade datatabeller och figurförklaringar för utökade data.

    När de citeras i texten är referensnummer upphöjda, inte inom parentes om de inte sannolikt kommer att förväxlas med ett upphöjt nummer.

    Använd inte länkade fält (producerade av EndNote och liknande program). Använd en-klick-knappen från EndNote för att ta bort EndNote-koder innan du sparar din fil.

    Som en riktlinje tillåter artiklar upp till 30 referenser i huvudtexten, men kan gå upp till 50 referenser vid behov och inom den tilldelade sidbudgeten. Endast en publikation kan listas för varje nummer.

    Endast artiklar som har publicerats eller accepterats av en namngiven publikation, eller som har laddats upp till en erkänd preprint-server (till exempel arXiv, bioRxiv), ska finnas i referenslistan. av författare (eller initialer om någon av författarna är medförfattare till detta bidrag).

    Publicerade konferenssammandrag, numrerade patent, förtryck på erkända servrar (förtryck av accepterade artiklar i referenslistan ska lämnas med manuskriptet) och forskningsdataset som har tilldelats en digital objektidentifierare kan ingå i referenslistor, men text, grant detaljer och bekräftelser kanske inte. (Ett undantag är de markerade referenserna som vi ber författare till artiklar om recensioner, perspektiv och insikter att tillhandahålla.)

    Alla författare bör inkluderas i referenslistor såvida det inte finns fler än fem, i vilket fall bör endast den första författaren anges, följt av 'et al.'.

    Följ stilen nedan i den publicerade utgåvan av Nature när du förbereder referenslistor.

    • Författare bör anges efternamn först, följt av ett kommatecken och initialer för förnamn.
    • Titlar på alla citerade artiklar krävs. Titlar på artiklar som citeras i referenslistor ska vara i upprättstående text, inte kursiv, det första ordet i titeln skrivs med stor bokstav, titeln skrivs exakt som den visas i det citerade arbetet, slutar med punkt. Boktitlar är kursiva med alla huvudord med versaler. Tidskriftstitlar är kursiv och förkortade enligt vanligt bruk. Volymnummer är fetstil. Förlaget och utgivningsstaden krävs för citerade böcker. (Se publicerade artiklar i Natur för detaljer.)
    • Forskningsdatauppsättningar kan citeras i referenslistan om de har tilldelats digitala objektidentifierare (DOI) och inkluderar författare, titel, utgivare (repository name), identifierare (DOI uttryckt som en URL). Exempel: Hao, Z., AghaKouchak, A., Nakhjiri, N. & Farahmand, A. Global Integrated Drought Monitoring and Prediction System (GIDMaPS) datauppsättningar. figshare http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.853801 (2014).
    • Erkända förtryck kan citeras i referenslistan. Exempel: Babichev, S. A., Ries, J. & Lvovsky, A. I. Kvantsax: teleportering av optiska enkelmodstillstånd med hjälp av en icke-lokal enkelfoton. Förtryck på http://arXiv.org/quant-ph/0208066 (2002).
    • Referenser till webbtidskrifter bör ange författare, artikeltitel och tidskriftsnamn enligt ovan, följt av fullständig URL - eller DOI om känt - och publiceringsår inom parentes.
    • Referenser till webbplatser bör ge författare om de är kända, titel på citerad sida, fullständig URL och år för inlägg inom parentes.

    Slutanteckningar

    Slutnoteringar är korta och följer onlinemetoderna.

    Erkännanden bör vara kortfattad och bör inte innehålla tack till anonyma referenter och redaktörer, oväsentliga ord eller översvallande kommentarer. En person kan tackas för hjälp, inte "utmärkt" hjälp, eller för kommentarer, inte "insiktsfulla" kommentarer, till exempel. Bekräftelser kan innehålla bidrags- och bidragsnummer.

    Författarbidrag: Författarna måste inkludera ett uttalande för att specificera bidragen från varje medförfattare. Uttalandet kan vara upp till flera meningar långt och beskriver enskilda författares uppgifter som hänvisas till med sina initialer. Se sidan för författarskapspolicy för ytterligare förklaring och exempel.

    Ytterligare information: Författare bör inkludera en uppsättning uttalanden i slutet av artikeln, i följande ordning:

    • Papper innehållande Kompletterande information innehålla ett uttalande:
      Kompletterande information finns tillgänglig för denna tidning.
    • En mening som lyder "Korrespondens och förfrågningar om material bör riktas till XX". Natur förväntar sig att denna identifierade författare svarar på läsarnas förfrågningar och förfrågningar om material och samordnar hanteringen av alla andra ärenden som uppstår från det publicerade bidraget, inklusive korrigeringsklagomål. Författaren som nämns som motsvarande författare är inte nödvändigtvis senior författare, och publicering av denna författares namn innebär inte senioritet. Författare kan inkludera mer än en e-postadress om nödvändigt, i vilket fall Natur kommer att kommunicera med den först listade adressen för alla frågor som uppstår efter publicering och förväntar sig att författaren samordnar sig med de andra medförfattarna.
    • Information om expertgranskning inkluderar namnen på granskare som samtycker till att bli citerade och kompletteras av Natur personal under korrektur.
    • En mening som lyder "Reprints and permissions information is available at www.nature.com/reprints".

    Riktlinjer för rapportering av biovetenskap och beteende- och samhällsvetenskap

    För att förbättra insynen i rapporteringen och reproducerbarheten av publicerade resultat måste författare till biovetenskapliga och beteendevetenskapliga och samhällsvetenskapliga forskningsartiklar tillhandahålla en komplett rapportsammanfattning som kommer att göras tillgänglig för redaktörer och granskare under manuskriptbedömningen. Rapportsammanfattningen kommer att publiceras med alla godkända manuskript.

    Observera: på grund av de avancerade funktionerna som används i dessa formulär måste du använda Adobe Reader för att öppna dokumenten och fylla i dem.

    Vägledning och resurser relaterade till användning och rapportering av statistik finns här.

    Tabeller

    Alla tabeller ska presenteras på en separat sida, stående (inte liggande) och upprätt på sidan, inte i sidled.

    Tabeller har en kort rubrik på en rad med fet text. Borden ska vara så små som möjligt. Tänk på storleken på en Natur sida som en begränsande faktor vid sammanställning av en tabell.

    Symboler och förkortningar definieras omedelbart under tabellen, följt av väsentligt beskrivande material så kortfattat som möjligt, allt i text med dubbla mellanrum.

    Standardtabellformat är tillgängliga för inlämning av kryo-EM, NMR och röntgenkristallografidata. Författare som tillhandahåller dessa data bör använda dessa standardtabeller för inkludering som utökade datatabeller.

    Figurlegender

    För första inlämningar uppmuntrar vi författare att införliva manuskripttexten och figurerna tillsammans i ett enda Word-dokument eller PDF-fil, och att varje figurförklaring presenteras tillsammans med sin figur. Men om ett papper accepteras kräver vi att figurförklaringar listas efter varandra, som en del av textdokumentet, separat från figurfilerna.

    Varje figurförklaring bör börja med en kort titel för hela figuren och fortsätta med en kort beskrivning av varje panel och de symboler som används. För bidrag med metodsektioner bör förklaringar inte innehålla några detaljer om metoder, eller överstiga 100 ord (färre än 500 ord totalt för hela uppsatsen). I bidrag utan metodavsnitt bör förklaringar vara färre än 300 ord (800 ord eller färre totalt för hela uppsatsen).

    Alla felstaplar måste definieras i figurförklaringen, som diskuterats ovan.

    Siffror

    Natur kräver siffror i elektroniskt format. Se till att alla digitala bilder överensstämmer med Natur tidskrifters policy om bildintegritet.

    Figurerna ska vara så små och enkla som är förenliga med tydlighet. Målet är att siffror ska vara begripliga för läsare inom andra eller besläktade discipliner, och hjälpa deras förståelse av tidningen. Onödiga figurer och delar (paneler) av figurer bör undvikas: data som presenteras i små tabeller eller histogram, till exempel, kan i allmänhet anges kortfattat i texten istället. Undvik onödig komplexitet, färgsättning och överdrivna detaljer.

    Figurer bör inte innehålla mer än en panel såvida inte delarna är logiskt sammankopplade varje panel i en flerdelad figur bör dimensioneras så att hela figuren kan reduceras med samma mängd och återges på den utskrivna sidan i den minsta storleken där väsentliga detaljer är synlig. Som vägledning är Natures standardstorlekar för figurer 89 mm (enkel kolumn) och 183 mm (dubbel kolumn) och hela sidans djup är 247 mm.

    Aminosyrasekvenser ska skrivas ut i Courier-typsnitt (eller annat teckensnitt med enskilt mellanrum) med enbokstavskoden på rader om 50 eller 100 tecken.

    Författare som beskriver kemiska strukturer bör använda stilguiden för kemiska strukturer i Nature Research.

    Lite kort vägledning för figurförberedelse:

    • Text i siffror (märkning av axlar och så vidare) ska skrivas med små bokstäver, med den första bokstaven versal och utan punkt.
    • Enheter bör ha ett enda mellanslag mellan talet och enheten och följa SI-nomenklaturen eller nomenklaturen som är gemensam för ett visst fält. Tusentals bör separeras med kommatecken (1 000). Ovanliga enheter eller förkortningar definieras i förklaringen.
    • Skala staplar bör användas snarare än förstoringsfaktorer.
    • Skiktning skriv direkt över skuggade eller strukturerade områden och användning av omvänd skrift (vita bokstäver på en färgad bakgrund) bör undvikas om möjligt.
    • Där det är möjligt bör text, inklusive nycklar till symboler, finnas i förklaringen snarare än på själva figuren.

    Figurkvalitet
    Vid den första inlämningen bör siffror vara av tillräckligt bra kvalitet för att bedömas av referent, helst inkorporerade med manuskripttexten i ett enda Word-dokument eller PDF, även om figurer kan tillhandahållas separat som JPEG-filer om författare inte kan inkludera dem i texten. Författare rekommenderas att följa de ursprungliga och reviderade riktlinjerna för inlämningar med avseende på storlek, upplösning och märkning.

    Observera att kvalitetssiffrorna för tryckta publikationer är stora och att det inte är användbart att ladda upp dem vid inlämningsstadiet. Även om de kommer att ladda upp på Nature submissions-webbplatsen, har många domarinstitutioner e-postsystem som inte accepterar stora bilagor. Författare kommer att tillfrågas om siffror av hög kvalitet vid tidpunkten för godkännande av deras artikel för publicering, så det är inte nödvändigt att skicka dem vid inlämningsstadiet.

    Tredje parts rättigheter
    Naturen avråder från användning eller anpassning av tidigare publicerade visningsobjekt (till exempel figurer, tabeller, bilder, videor eller textrutor). Vi inser dock att för att illustrera vissa koncept krävs användning av publicerade data och återanvändning av tidigare publicerade visningsobjekt kan vara nödvändig. Observera att vi i dessa fall kanske inte kan få de nödvändiga rättigheterna för att vissa bilder ska kunna återanvändas (som de är eller anpassade versioner) i våra artiklar. I sådana fall kommer vi att kontakta dig för att diskutera inköp av alternativt material.

    Siffra kostnader
    För att hjälpa till att täcka en del av merkostnaden för reproduktion i fyra färger, tar Nature Research ut en avgift från våra författare för trycket av deras färgfigurer. Vänligen kontakta våra kontor för exakta priser och detaljer. Oförmåga att betala denna avgift kommer inte att hindra publicering av färgfigurer som bedöms vara väsentliga av redaktionen, men detta måste överenskommas med redaktören innan godkännande.

    Siffror för produktionskvalitet

    När ett manuskript i princip accepteras för publicering kommer redaktören att be om högupplösta siffror. Skicka inte in siffror om publiceringskvalitet förrän en redaktör uppmanas att göra det. Förbered då siffror enligt dessa riktlinjer.

    Utökad data

    Utökade datasiffror och tabeller är endast online (visas i online-PDF och fulltext HTML-version av tidningen), peer-reviewed visningsobjekt som ger viktig bakgrund till artikeln men som inte ingår i den tryckta versionen av tidningen pga. till utrymmesbegränsningar eller endast av intresse för ett fåtal specialister. Maximalt tio objekt för visning av utökade data (figurer och tabeller) är tillåtna. Se forskningsuppsatsen Composition of a Nature.

    Utökade datatabeller bör formateras på samma sätt som tabeller som visas i tryckt form (se avsnitt 5.7), men huvuddelen (exklusive titel och förklaring, som ska inkluderas i slutet av Word-filen) ska skickas separat som en bild istället för som ett redigerbart format i Word, eftersom Extended Data-tabeller inte redigeras av Natures underredigeringsavdelning. Små tabeller kan också ingå som underpaneler i siffror för utökade data. Se Guide för utökad dataformatering.

    Utökade datafigurer bör förberedas enligt något annorlunda riktlinjer jämfört med figurer som visas i tryckt form, och kan ha flera paneler så länge de passar storleksreglerna (se Guide för utökad dataformatering). Utökade datasiffror är inte redigerade eller formaterade av Naturs konstavdelning av denna anledning uppmanas författare att följa Nature style så noga som möjligt när de förbereder dessa figurer. Teckenförklaringarna för utökade datafigurer bör förberedas som för tryckta figurer och bör listas efter varandra i slutet av Word-filen.

    Om utrymmet tillåter, Natur uppmuntrar författare att inkludera ett enkelt schema, som en panel i en Extended Data-figur, som sammanfattar uppsatsens huvudresultat, där så är lämpligt (till exempel för att underlätta förståelsen av komplexa detaljer i cell-, struktur- och molekylärbiologidiscipliner).

    Om ett manuskript har utökade datafigurer eller tabeller, uppmanas författare att referera till diskreta objekt på en lämplig plats i huvudtexten (till exempel Utökad Data Fig. 1 och Utökad Data Tabell 1).

    Om ytterligare referenser ingår i tabellerna för utökade data och figurförklaringar för utökade data, ska numreringen fortsätta från slutet av det sista referensnumret i huvudartikeln (eller från det sista referensnumret i avsnittet om ytterligare metoder om det finns) och listan bör läggas till i slutet av listan som medföljer avsnittet om ytterligare metoder, om det finns, eller läggas till under förklaringarna för utökade data om det inte finns några ytterligare metoder.

    Kompletterande information

    Tilläggsinformation (SI) är enbart online, peer-reviewed material som är väsentlig bakgrund till artikeln (till exempel stora datamängder, metoder, beräkningar), men som är för stort eller opraktiskt, eller av intresse endast för ett fåtal specialister , för att motivera införandet i den tryckta versionen av tidningen. Se sidan med tilläggsinformation för mer information.

    Tilläggsinformation bör inte innehålla siffror (alla siffror utöver de som visas i tryckt format bör formateras som siffror för utökade data). Tabeller kan inkluderas i tilläggsinformation, men endast om de är olämpliga för formatering som utökade datatabeller (till exempel tabeller som innehåller stora datamängder eller rådata som är bäst lämpade för Excel-filer).

    Om ett manuskript har medföljande SI, antingen vid inlämning eller som svar på ett redaktörsbrev som begär det, uppmanas författare att hänvisa till diskreta artiklar i SI (till exempel videor, tabeller) vid en lämplig punkt i huvudmanuskriptet.

    Kemiska strukturer och karakterisering av kemiska material

    För riktlinjer som beskriver Natures standarder för experimentella metoder och karakterisering av nya föreningar, se informationsbladet om karakterisering av kemiska material.

    Vi strävar efter att producera kemiska strukturer i ett konsekvent format genom hela våra artiklar. Vänligen använd Nature Research Chemical Structures Guide och ChemDraw-mallen för att säkerställa att du förbereder dina figurer i ett format som kräver minimala ändringar av våra konst- och produktionsteam. Skicka in slutliga filer till 100 % som .cdx-filer.


    Resultat

    Tidigare genetiska skärmar identifierade cirka 25 gener som krävdes för vidhäftning mellan de två lagren av Drosophila wing, en integrinberoende process (Prout et al., 1997 Walsh och Brown, 1998). I dessa screeningar producerades kloner av homozygota mutantceller i de utvecklande vingarna (och på andra ställen) av heterozygota individer och flugor som innehöll blåsor i vingen valdes ut. De flesta mutationer orsakade dödlighet när hela djuret var homozygot mutant, vilket tyder på att de också fungerar i andra processer än vingutveckling. Vi noterade vissa likheter mellan den muterade fenotypen av två av vingblåsegenerna, pio och pott, och den tidigare karakteriserade wing-blister-genen dp, vilket antydde att de kan ha en relaterad funktion. Många av flugorna innehåller pio och pott mutantkloner uppvisade gropar eller utsprång på bröstkorgen i närheten av flygmuskelfästena (data visas inte) som liknade de som sågs hos flugor som var homozygota för hypomorfa dp alleler av "virvel" och "komma" fenotypiska klasser (Metcalfe, 1971 Sandstrom och Restifo, 1999). Dessa gropar och utsprång tros vara orsakade av en störning av de vuxna muskelfästplatserna men de observerades inte hos flugor som innehöll kloner av celler som saknar integrinfunktion. Dessutom, när mutanta kloner av pio, pott eller dp genererades i vingen, dök vingblåsan upp inom några minuter efter att de vuxna flugorna hade försvunnit från puppfallet (data visas inte). Detta är cirka 60 timmar senare än det första uppkomsten av blåsor orsakade av brist på integriner, tidigt i pupputvecklingen (Brabant et al., 1996). Dessa likheter antydde det pio och pott kan ha en funktion som länkar vingcellerna till aECM, vilket hade postulerats för dp (Wilkin et al., 2000).

    Molekylär karakterisering av pio och pott

    Att upptäcka arten av proteinerna som kodas av pio och pott, karakteriserade vi dem på molekylär nivå. Att använda brister i regionen, pio kartlades till en 300 kb region. Eftersom de muterade allelerna producerades av röntgenstrålar, som ofta inducerar deletioner, skannade vi generna i det intervallet för deletioner med PCR. En deletion som tar bort de två första kodande exonerna av den förutsagda genen CG3541 (Adams et al., 2000) hittades i allelen pio V132 (Fig. 1A), vilket tyder på att denna gen motsvarar pio. För att bekräfta detta, en räddningskonstruktion som innehåller 22 kb genomiskt DNA som omfattar CG3541 transkriptionsenhet konstruerades, infördes i genomet och testades med avseende på förmågan att komplettera pio mutationer. Konstruktionen räddade helt dödligheten av pio mutationer och därför drar vi slutsatsen att CG3541 motsvarar pio.

    Vingblåsegenerna piopio och papillot kodar för ZP-domän-innehållande transmembranproteiner. Generna piopio (pio, A) och papillot (pott, B) visas med sina nära flankerande gener och deras kodade proteiner. Oöversatta områden är vitfyllda rutor och kodningsområden är svarta. Genomiska räddningskonstruktioner genererades med DNA-segmentet mellan restriktionsställena: BamHEJ för piopio och Spejag och EclXI för papillot. Positionen för borttagningen på 1,7 kb i pio V132 mutant allel, som tar bort signalpeptiden, visas i A. Schemat för proteinerna visar signalpeptider (SP) och transmembrandomäner (TM) som svarta lådor, zona pellucida (ZP)-domänerna som grå rutor och insättningspunkterna av de fluorescerande proteintaggarna (GFP och CFP). För Piopio visas sekvensen som omger det potentiella furinklyvningsstället (understruket) i slutet av ZP-domänen, liksom bevarandet av den korta cytoplasmatiska domänen, med identiska rester skuggade. För Papillote, positionen för ramförskjutningen orsakad av 13 bp-raderingen i kruka P53 mutant allel, som orsakar en trunkering av proteinet efter rest 686, indikeras. (C) Pio men inte Pot bearbetas proteolytiskt. Extrakt av puppvingar från vildtyp (wt) eller djur som uttrycker GFP, Pio-GFP eller Pot-CFP analyserades genom western blotting och sonderades med en anti-GFP-antikropp. Två distinkta band detekterades för Pio-GFP-fusionsproteinet, med skenbara molekylvikter som förutspåtts för fullängdsfusionsproteinet som saknade signalpeptiden (76 kDa), och ett C-terminalt fragment fuserat till GFP genererat genom klyvning vid potentialen furinigenkänningsställe (39 kDa), distinkt från enbart GFP (27 kDa). Däremot observerades ett enda band för Pot-CFP av den storlek som förväntades för fullängdsfusionsproteinet (131 kDa).

    Vingblåsegenerna piopio och papillot kodar för ZP-domän-innehållande transmembranproteiner. Generna piopio (pio, A) och papillot (pott, B) visas med sina nära flankerande gener och deras kodade proteiner. Oöversatta områden är vitfyllda rutor och kodningsområden är svarta. Genomiska räddningskonstruktioner genererades med DNA-segmentet mellan restriktionsställena: BamHEJ för piopio och Spejag och EclXI för papillot. Positionen för borttagningen på 1,7 kb i pio V132 mutant allel, som tar bort signalpeptiden, visas i A. Schemat för proteinerna visar signalpeptider (SP) och transmembrandomäner (TM) som svarta lådor, zona pellucida (ZP)-domänerna som grå rutor och insättningspunkterna av de fluorescerande proteintaggarna (GFP och CFP). För Piopio visas sekvensen som omger det potentiella furinklyvningsstället (understruket) i slutet av ZP-domänen, liksom bevarandet av den korta cytoplasmatiska domänen, med identiska rester skuggade. För Papillote, positionen för bildruteförskjutningen orsakad av 13 bp raderingen i kruka P53 mutant allel, som orsakar en trunkering av proteinet efter rest 686, indikeras. (C) Pio men inte Pot bearbetas proteolytiskt. Extrakt av puppvingar från vildtyp (wt) eller djur som uttrycker GFP, Pio-GFP eller Pot-CFP analyserades genom western blotting och sonderades med en anti-GFP-antikropp. Två distinkta band detekterades för Pio-GFP-fusionsproteinet, med skenbara molekylvikter som förutspåtts för fullängdsfusionsproteinet som saknade signalpeptiden (76 kDa), och ett C-terminalt fragment fusionerat till GFP genererat genom klyvning vid potentialen furinigenkänningsställe (39 kDa), skilt från enbart GFP (27 kDa). Däremot observerades ett enda band för Pot-CFP av den storlek som förväntades för fullängdsfusionsproteinet (131 kDa).

    Analys av cDNA identifierade i EST-projektet (Rubin et al., 2000) visade att olika pio transkript uppstår från alternativa startar av transkription men att alla transkript producerar samma protein. Sekvensen för Pio-proteinet med 462 aminosyror visar att det är ett transmembranprotein som innehåller en extracellulär ZP-domän och en kort cytoplasmatisk domän (Fig. 1A). ZP-domäner (Bork och Sander, 1992) identifierades först i proteinerna som utgör musen zona pellucida och har sedan dess hittats i flera proteiner som utsöndras från den apikala sidan av celler. Andra ZP-domänproteiner som har en liknande struktur som Pio, med en signalpeptid- och transmembrandomän, har visat sig klyvas av proteaser av furintyp, vilket utsöndrar den extracellulära domänen (Litscher et al., 1999). Pio-proteinet innehåller ett förmodat furinklyvningsställe (RPKR, rester 352-355) omedelbart efter ZP-domänen (aminosyrorna 66-351), vilket tyder på att dess ZP-domän kan utsöndras. Borttagningen i pio V132 allelen tar bort början av translationen såväl som signalpeptiden och därför är denna allel en nollmutation.

    De pott genen kartlades på liknande sätt till en 73 kb-region med användning av överlappande brister. Inom intervallet för genomiskt DNA innehållande pott, vi hittade det CG2467 (Adams et al., 2000) innehöll en kort radering i kruka P53 allel, vilket orsakar en ramförskjutning. Som beskrivits för piobekräftade vi att vi hade identifierat rätt kandidat genom att konstruera och testa en räddningskonstruktion som omfattar denna gen (Fig. 1B), och drar därför slutsatsen att CG2467 motsvarar pott. EST-analys visade ett enda mönster av skarvning för pott cDNA, som kodar för ett 963-aminosyraprotein med en N-terminal signalpeptid och region med svag homologi med ZP-domäner (Fig. IB). Pot-sekvensen innehåller emellertid en insatt transmembrandomän som stör regionen med ZP-domänhomologi, och graden av sekvenskonservering sjunker efter denna insättning. Vi drar därför slutsatsen att Pot innehåller en mycket divergerande, partiell ZP-domän som innehåller en välbevarad första tredjedel av denna domän, omedelbart följt av en transmembrandomän. Eftersom det inte finns några förutsägda furinklyvningsställen mellan den förmodade extracellulära delen av ZP-domänen och transmembranhelixen, är Pot förmodligen ett integrerat membranprotein. Således delar både Pio och Pot med Dp en ZP-domän, som är länkad till funktion i aECM.

    Både pio och pott är bevarade i insekter, med tydliga ortologer som kan identifieras i myggan, honungsbiet och silkemotten (data visas inte). Sekvenslikhet är särskilt uttalad inom ZP-domänerna för båda proteinerna och, i fallet med Pio, den korta cytoplasmatiska svansen (Fig. 1A). Även om andra djur har ZP-domäninnehållande proteiner, verkar det inte finnas ortologer av pio och pott, vilket antyder antingen att de fyller en insektsspecifik funktion eller att deras funktionella ekvivalenter i andra arter inte kan detekteras av deras primära sekvens.

    Apikal fördelning av Papillote och Piopio i puppvingen

    För att analysera den subcellulära lokaliseringen av Pot-protein genererade vi en CFP-märkt version genom att infoga CFP-kodningssekvensen mellan den sista aminosyran av pott och stoppkodonet i en genomisk räddningskonstruktion som innehåller transkriptionsenheten och flankerande DNA med förmodade regulatoriska element. Denna konstruktion och dess omärkta version kunde till fullo rädda allas dödlighet pott alleler, vilket visar att CFP-fusionen inte försämrar funktionen. Konfokalmikroskopi visade att i den utvecklande vingen var Pot-CFP lokaliserad till den förstorade apikala ytan av dessa celler, där den var jämnt fördelad (Fig. 2A). Vi upptäckte inte uttryck av Pot-CFP i ett tidigare skede av vingutvecklingen i larvens imaginala skiva (visas inte).

    Subcellulär lokalisering av Pio och Pot. Distribution av fluorescerande fusionsproteiner i sen puppvinge (>70 timmar efter pupariumbildning), visualiserad med konfokalmikroskopi. (A) På grund av vingens vikning visar denna konfokala sektion lokaliseringen av Pot-CFP runt omkretsen av den stellate apikala ytan (överst) och en optisk sektion genom de två bifogade lagren av celler (en cell i varje lager är markerad med en gul pil, med pilspetsen basal) (nederst). (botten) Pot-CFP är likformigt lokaliserad längs den apikala ytan (men inte inklusive vinghåren). (B,D) Däremot, i samma skede, finns ett Pio-GFP-fusionsprotein (grönt) i diskreta prickliknande strukturer, företrädesvis på den apikala sidan (D) och nära omkretsen av vingepitelcellerna som visualiserat genom differentiell interferenskontrast (höger). (C) Tubulin-GFP visar bredare men fortfarande diskreta kontaktpunkter med den apikala ytan, även berikad vid cellperiferin. Konturen av en cell är ritad i vitt i B och C. (E) Den basala positionen för integrinlimövergångar visas med integrinkopplat kinas (ILK-GFP). (F) Schematiskt diagram som visar sektionerna av vingepitelet som visas i A-E. Bar, 10 μm (gäller A-E).

    Subcellulär lokalisering av Pio och Pot. Distribution av fluorescerande fusionsproteiner i sen puppvinge (>70 timmar efter pupariumbildning), visualiserad med konfokalmikroskopi. (A) På grund av vikningen av vingen visar denna konfokala sektion lokaliseringen av Pot-CFP runt omkretsen av den stellate apikala ytan (överst) och en optisk sektion genom de två bifogade lagren av celler (en cell i varje lager är markerad med en gul pil, med pilspetsen basal) (nederst). (botten) Pot-CFP är likformigt lokaliserad längs den apikala ytan (men inte inklusive vinghåren). (B,D) Däremot, i samma skede, finns ett Pio-GFP-fusionsprotein (grönt) i diskreta prickliknande strukturer, företrädesvis på den apikala sidan (D) och nära omkretsen av vingepitelcellerna som visualiserat genom differentiell interferenskontrast (höger). (C) Tubulin-GFP visar bredare men fortfarande diskreta kontaktpunkter med den apikala ytan, även berikad vid cellperiferin. Konturen av en cell är ritad i vitt i B och C. (E) Den basala positionen för integrinlimövergångar visas med integrinkopplat kinas (ILK-GFP). (F) Schematiskt diagram som visar sektionerna av vingepitelet som visas i A-E. Bar, 10 μm (gäller A-E).

    Eftersom den pio genen är betydligt större än pott, använde vi ett cDNA för att konstruera en version av Pio som var C-terminalt taggad med GFP och uttryckte den med en UAS-promotor (UAS::pio-GFP) CY2 Gal4-drivrutinen användes för att driva uttryck av Pio-GFP i puppvingen. Liksom Pot hittades Pio vid den apikala ytan av vingepitelcellerna (Fig. 2B, D), men i punktformiga strukturer snarare än att vara jämnt fördelad. Prickarna berikas företrädesvis längs den apikolaterala omkretsen av cellerna (Fig. 2B). De transalära mikrotubulierna har en liknande fördelning när de ses från den apikala ytan (Fig. 2C, Fig. 3). Varken Pio eller Pot hittades vid de basala integrinförmedlade korsningarna, där proteiner som GFP-märkt integrinkopplat kinas är lokaliserade (Fig. 2E) (Zervas et al., 2001). Således finns både Pio och Pot på den apikala ytan, där Dp också tros fungera.

    Pio, men inte andra vingblister-genprodukter, krävs för de transalära arrayerna av mikrotubuliknippen i puppvingar. Fördelningen av tubulin i sena puppvingar (60-70 timmar efter pupariumbildning) visas i vitt eller grönt i varje panel förutom B, som visar en vuxen vinge. Alla celler uttrycker tubulin-GFP i A,C-E. I en konfokal sektion av en vildtyp vikt puppvinge (A) kan de framträdande mikrotubuliknippena som spänner över vingcellerna ses. Par av fästa celler är markerade med gula pilar, med pilspetsarna basala. (B-E) Kloner av mutanta celler är markerade med en mutation i rakad (sha), vilket stör bildandet av vinghår men inte orsakar blåsor, som visas i en ljusfältsmikrofotografi av den vuxna vingen (B). I frånvaro av Pio ses inte mikrotubuliknippena: (C) ett snitt över den apikala ytan, kombinerat med differentiell interferenskontrast, som visar frånvaron av mikrotubuli och vinghår i sha pio mutant klon (D) frånvaron av mikrotubuli buntar in sha pio mutantceller (indikerade med en vit horisontell parentes) motstående vildtypsceller verkar också överkontrakterade. Det mikrotubulibindande proteinet Shot, som lokaliseras till båda ändarna av mikrotubuliknippena som detekteras av antikroppsfärgning (F), krävs inte för att bibehålla buntarna (E) denna bild kombinerar tubulin-GFP-fluorescens och differentiell interferenskontrast, och den vita horisontell parentes visar cellerna som saknar skott (sha skott). (G-I) MARCM-tekniken användes för att uttrycka tubulin-GFP i bara de mutanta klonerna av celler. En kontrollklon av vildtyp visar mikrotubuliknippen i ett lager av vingen (G). Kloner av celler som saknar Pot (H) eller integrin-βPS-subenheten (I, mitt s) innehåller mikrotubulibuntar. Dessa buntar är oordnade i frånvaro av integriner, förmodligen på grund av separationen mellan de två cellskikten (det andra skiktet är inte synligt eftersom det inte innehåller en klon). Barer, 10 μm.

    Pio, men inte andra vingblister-genprodukter, krävs för de transalära arrayerna av mikrotubuliknippen i puppvingar. Fördelningen av tubulin i sena puppvingar (60-70 timmar efter pupariumbildning) visas i vitt eller grönt i varje panel förutom B, som visar en vuxen vinge. Alla celler uttrycker tubulin-GFP i A,C-E. I en konfokal sektion av en vildtyp vikt puppvinge (A) kan de framträdande mikrotubuliknippena som spänner över vingcellerna ses. Par av fästa celler är markerade med gula pilar, med pilspetsarna basala. (B-E) Kloner av mutanta celler är markerade med en mutation i rakad (sha), vilket stör bildandet av vinghår men inte orsakar blåsor, som visas i en ljusfältsmikrofotografi av den vuxna vingen (B).I frånvaro av Pio ses inte mikrotubuliknippena: (C) ett snitt över den apikala ytan, kombinerat med differentiell interferenskontrast, som visar frånvaron av mikrotubuli och vinghår i sha pio mutant klon (D) frånvaron av mikrotubuli buntar in sha pio mutantceller (indikerade med en vit horisontell parentes) motstående vildtypsceller verkar också överkontrakterade. Det mikrotubulibindande proteinet Shot, som lokaliseras till båda ändarna av mikrotubuliknippena som detekteras av antikroppsfärgning (F), krävs inte för att bibehålla buntarna (E) denna bild kombinerar tubulin-GFP-fluorescens och differentiell interferenskontrast, och den vita horisontell parentes visar cellerna som saknar skott (sha skott). (G-I) MARCM-tekniken användes för att uttrycka tubulin-GFP i bara de mutanta klonerna av celler. En kontrollklon av vildtyp visar mikrotubuliknippen i ett lager av vingen (G). Kloner av celler som saknar Pot (H) eller integrin-βPS-subenheten (I, mitt s) innehåller mikrotubulibuntar. Dessa buntar är oordnade i frånvaro av integriner, förmodligen på grund av separationen mellan de två cellskikten (det andra skiktet är inte synligt eftersom det inte innehåller en klon). Barer, 10 μm.

    C-terminal CFP och GFP-taggarna gjorde det möjligt för oss att bedöma bearbetningen av Pio och Pot. Som nämnts ovan har Pio, men inte Pot, ett konsensusigenkänningsställe för furinproteaser, som tros klyva andra ZP-domäninnehållande proteiner. När PioGFP undersöktes genom western blotting av puppvingelysat, detekterades band av en storlek som överensstämmer med både klyvt och oklyvt protein vid liknande nivåer (Fig. 1C). I kombination med distributionen av det GFP-märkta proteinet antyder detta att en del Pio förblir obearbetad och är associerad med de punktformiga apikala strukturerna, och att en del är klyvd. Vi kan inte bedöma fördelningen av den kluvna formen av Pio-GFP, eftersom den inte längre innehåller GFP-delen. Däremot verkar Pot-CFP inte vara klyvd alls (Fig. 1C), i överensstämmelse med avsaknaden av extracellulära furinklyvningsställen.

    Pio och pott mutanta fenotyper i vingen

    Den apikala lokaliseringen av Piopio och Papillote, tillsammans med det faktum att de innehåller ZP-domäner, antydde att de bidrar till aECM eller dess koppling till epidermis. Vingblåsorna som produceras av kloner pott eller pio mutanta vingceller kan därför bero på en separation av aECM från epitelytan snarare än en separation mellan basala ytorna av de två epiteliala arken, som ses i integrinmutantkloner (Brabant et al., 1996). För att testa detta använde vi tubulin-GFP (Grieder et al., 2000) för att märka de två epitelskikten. Transalära mikrotubuliknippen detekterades lätt i interveincellerna hos sena puppvingar av vildtypflugor (Fig. 3A). Vi markerade pio mutantkloner med en mutant i rakad som eliminerar håret som produceras av varje hårcell (Taylor et al., 1998) men inte i sig orsakar vingblåsor (Fig. 3B). Även om man använder kombinationen av tubulin-GFP och rakad misslyckades med att visa den förväntade avskiljningen mellan epitel och aECM, avslöjade det en överraskande fenotyp för pio mutationer.

    Vi hittade det pio mutantceller saknade helt de transalära mikrotubuli-arrayerna (Fig. 3C, D). Förlusten av Pio och mikrotubuli resulterade i en expansion av mutantcellen och en förkortning av vildtypscellerna i det motsatta epitelskiktet (Fig. 3D), vilket tyder på att mikrotubuli kan krävas för en balans i spänningen mellan de två lagren . Trots den dramatiska effekten på de transalära arrayerna förblev de två epitelskikten associerade och integriteten hos båda epitelen var intakt i frånvaron av Pio. Detta fynd fick oss att undersöka mikrotubulus organisation i celler mutant för skott, en vingblåsgen som kodar för ett mikrotubulibindande protein från spektraplakinfamiljen (Röper et al., 2002). Skottet är lokaliserat till de apikala och basala ändarna av mikrotubuliknippena i de embryonala sencellerna (Gregory och Brown, 1998 Strumpf och Volk, 1998) och vi fann att det har en jämförbar fördelning i ändarna av de transalära mikrotubuliknippena (Fig. 3F) . I frånvaro av Shot i embryot spräckte muskelkontraktion sencellerna och dessa celler fick sina mikrotubuli lossnade från integrinövergångar vid basalytan (Prokop et al., 1998b). Vi upptäckte dock ingen förändring av de transalära arrayerna i rakad markerade kloner av skott mutantceller i puppvingen, inte heller brast mutantcellerna eller lossnade från de motsatta vildtypscellerna under puppstadierna (Fig. 3E).

    Vi undersökte ytterligare vingblistermutanter med MARCM-tekniken (Lee och Luo, 1999) för att markera mutantklonerna, så att endast mutantceller uttrycker tubulin-GFP. I denna teknik resulterar mitotisk rekombination i kloner av celler som är homozygota för en given mutant som också har förlorat en transgen som överallt uttrycker transkriptionsrepressorn Gal80. Detta lindrar det Gal80-medierade förtrycket av Gal4-drivet uttryck av en markör under kontroll av UAS-promotorn (i detta fall UAS::tubulin-GFP) i den muterade cellklonen. Celler mutant för pott hade uppenbarligen normala transalära arrayer (Fig. 3G,H), liksom celler mutant för dp, den tredje vingblistergenen som kodar för ett ZP-domänprotein (Wilkin et al., 2000) (data visas ej). I kloner av celler som saknar βPS-integrinsubenheten (myospheroid mutant) (Brower och Jaffe, 1989), var separationen mellan cellskikten synlig men de transalära mikrotubuliknippena sträckte sig fortfarande längs den apikobasala axeln hos de fristående cellerna (Fig. 3I). Därför verkar Pio vara unikt nödvändig för bildandet eller underhållet av de transalära arrayerna. Eftersom Pio har transmembrana och cytoplasmatiska domäner, och en del Pio förblir oklyvd (Fig. 1), är en hypotes att Pio rekryterar mikrotubuli-kärnbildande maskineri till apikala korsningar. Detta överensstämmer med likheten mellan de punktformiga kontakterna av mikrotubuliknippena på den apikala ytan och den punktformiga fördelningen av Pio (Fig. 2B, C). Vi testade om den korta cytoplasmatiska domänen av Pio kunde rekrytera mikrotubuli på egen hand genom att smälta den till ett heterologt transmembranprotein. Expression av detta chimära protein i puppvingarna störde emellertid inte mikrotubulusorganisationen, och det kunde inte heller rädda förlusten av de transalära arrayerna i pio mutantceller (data visas inte).

    Som nämnts ovan, i frånvaro av integriner, uppträder vingblåsan inom puppvingen (Brabant et al., 1996). Däremot, i frånvaro av Dp, Pio eller Pot, dyker blåsan upp kort efter eclosion och vi såg ingen separation mellan cellskikten i puppvingen. Detta visar att förlusten av dessa gener inte allvarligt förändrade integrinfunktionen eftersom, om den gjorde det, skulle vi förvänta oss att se en tidig blåsa, vilket också finns när det integrinassocierade proteinet talin tas bort (Brown et al., 2002). Tyvärr såg vi inte heller bevis för den förväntade avskiljningen mellan den apikala ytan av klonen och aECM. Vi undersökte därför fenotypen i muterade embryon för att testa rollen av dessa proteiner i bildandet eller vidhäftningen av aECM.

    Avlossning av apikalt ECM från epidermis i pio, pott och dp muterade embryon

    Mutationer i var och en av vingblistergenerna som kodar för ZP-domänproteiner är embryonalt dödliga när de är homozygota. Genom att uttrycka tubulin-GFP i epidermis, var en separation mellan epidermis och nagelbandet synlig i alla tre mutantbakgrunder (Fig. 4C, D, för pio endast). I motsats till vingen såg vi inget specifikt fel i monteringen av mikrotubuli i sencellerna i pio muterade embryon (data visas inte, se ultrastrukturell analys nedan), vilket tyder på att Pio specifikt kan behövas när mikrotubuli bildas kärnor från de apikala förbindelserna i puppvingen i frånvaro av centrosomer (Tucker et al., 1986).

    Frånvaron av Pio orsakar nagelbandsavlossning och trakealdefekter. (A) I embryon av vildtyp i slutet av embryogenesen, sett med differentiell interferenskontrast, verkar den dorsala stammen på luftstrupen slät och ganska rak. (B) Homozygot pio mutanta embryon fullbordar utvecklingen men luftstruparna verkar vridna och trasiga (pilar). (C) I levande embryon av vildtyp följer epidermis (märkt med tubulin-GFP) noga konturerna av nagelbandet (sedda med differentiell interferenskontrast). (D) Hos homozygot pio mutanta embryon, lossnar nagelbandet från den GFP-märkta epidermis (pil).

    Frånvaron av Pio orsakar nagelbandsavlossning och trakealdefekter. (A) I embryon av vildtyp i slutet av embryogenesen, sett med differentiell interferenskontrast, verkar den dorsala stammen på luftstrupen slät och ganska rak. (B) Homozygot pio mutanta embryon fullbordar utvecklingen men luftstruparna verkar vridna och trasiga (pilar). (C) I levande embryon av vildtyp följer epidermis (märkt med tubulin-GFP) noga konturerna av nagelbandet (sedda med differentiell interferenskontrast). (D) Hos homozygot pio mutanta embryon, lossnar nagelbandet från den GFP-märkta epidermis (pil).

    På ultrastrukturell nivå, embryon homozygota för pio, pott eller dp mutationer visade identiska defekter (fig. 5). I varje fall observerades en separation av aECM (kutikula) från den apikala ytan av epidermis. Defekter observerades i det innersta lagret av nagelbandet, snarare än i de cellulära adhesiva strukturerna.

    Ultrastrukturell analys av mutanta fenotyper. Schematiska representationer av vildtypsnagelband (A) eller muskelfästplatser (B) på senare tid Drosophila embryon (cirka 21 timmar) och mikrofotografier av dessa strukturer i vildtyps- och mutantembryon (C-F”). Symboler och förkortningar används konsekvent i: aj eller vit pil, apikala korsningar eller böjda vita pilar, apikala tvärgående filament kapkitinskikt cu, trilaminärt kutikulinskikt dz eller svarta pilspetsar, deponeringszon edepidermal cell el, elektrongenomskinligt skikt sv eller asterisk, endokutikel ep eller svart prick, epikutikula es, extracellulärt utrymme mt eller vit pilspets, mikrotubuli mtj eller krökt svart pil, myotendinös korsning mu, muskel nu, kärna pe, fibrillär protein epikutikel tf eller vit chevron, tonofilament tn, sencell. [Nomenklatur enligt Kaznowski et al. (Kaznowski et al., 1985) och Tepass och Hartenstein (Tepass och Hartenstein, 1994).] Det karakteristiska arrangemanget av epikutikulan (svarta prickar) och den typiska förekomsten av den mörkare kutikulära avsättningszonen (dz), som associerar med epidermal mikrovilli (mv), kan ses i vildtyp (A-C"), pio V132 (D,D′), kruka P14 (E,E′) och dp 1v1 (F,F′) muterade embryon likadana. Typiska egenskaper hos epidermala senceller (tn) är deras uttalade basala korsningar med muskler (böjda svarta pilar) och apikala korsningar (vita pilar) som fäster vid tonofilament (vita chevrons) som förankras i nagelbandet. Apikala och basala förbindelser av senceller är intracellulärt sammankopplade via mikrotubuli (vita pilspetsar). Dessa karakteristiska egenskaper hos vildtypsembryon (B,C”) verkar opåverkade i pott P14 , pio V132 och dp 1v1 mutanta embryon (D“-F”), även om de är svåra att hitta och tolka på grund av epidermal avlossning från nagelbandet. Den huvudsakliga defekten av pott P14 , pio V132 och dp 1v1 mutanta embryon består i en störning av kitinlagret (kap) av endokutikula (asterisker), vilket leder till en separation av avsättningszon och epikutikula (D-F,D′-F′), och tonofilament misslyckas med att förankras i nagelbandet (D”,F”, vita chevrons). Bar, 0,5 μm (vänster och höger kolumn, C-F,C“-F”), 0,2 μm (mittkolumn, C′-F′).

    Ultrastrukturell analys av mutanta fenotyper. Schematiska representationer av vildtypsnagelband (A) eller muskelfästplatser (B) på senare tid Drosophila embryon (cirka 21 timmar) och mikrofotografier av dessa strukturer i vildtyps- och mutantembryon (C-F”). Symboler och förkortningar används konsekvent i: aj eller vit pil, apikala korsningar eller böjda vita pilar, apikala tvärgående filament kapkitinskikt cu, trilaminärt kutikulinskikt dz eller svarta pilspetsar, deponeringszon edepidermal cell el, elektrongenomskinligt skikt sv eller asterisk, endokutikel ep eller svart prick, epikutikula es, extracellulärt utrymme mt eller vit pilspets, mikrotubuli mtj eller krökt svart pil, myotendinös korsning mu, muskel nu, kärna pe, fibrillärt protein epikutikula tf eller vit chevron, tonofilament tn, sencell. [Nomenklatur enligt Kaznowski et al. (Kaznowski et al., 1985) och Tepass och Hartenstein (Tepass och Hartenstein, 1994).] Det karakteristiska arrangemanget av epikutikulan (svarta prickar) och den typiska förekomsten av den mörkare kutikulära avsättningszonen (dz), som associerar med epidermal mikrovilli (mv), kan ses i vildtyp (A-C"), pio V132 (D,D′), kruka P14 (E,E′) och dp 1v1 (F,F′) muterade embryon likadana. Typiska egenskaper hos epidermala senceller (tn) är deras uttalade basala korsningar med muskler (böjda svarta pilar) och apikala korsningar (vita pilar) som fäster vid tonofilament (vita chevrons) som förankras i nagelbandet. Apikala och basala förbindelser av senceller är intracellulärt sammankopplade via mikrotubuli (vita pilspetsar). Dessa karakteristiska egenskaper hos vildtypsembryon (B,C”) verkar opåverkade i pott P14 , pio V132 och dp 1v1 mutanta embryon (D“-F”), även om de är svåra att hitta och tolka på grund av epidermal avlossning från nagelbandet. Den huvudsakliga defekten av pott P14 , pio V132 och dp 1v1 mutanta embryon består i en störning av kitinlagret (kap) i endokutikula (asterisker), vilket leder till en separation av avsättningszon och epikutikula (D-F,D′-F′), och tonofilament misslyckas med att förankras i nagelbandet (D”,F”, vita chevrons). Bar, 0,5 μm (vänster och höger kolumn, C-F,C“-F”), 0,2 μm (mittkolumn, C′-F′).

    I vildtypsembryon (Fig. 5C), består aECM, eller nagelbandet, av en komplex, flerskiktad, till stor del proteinhaltig epikutikula som täcker den dubbelskiktade endokutikulan (Fig. 5A, B). Endokutikeln är sammansatt av ett tjockt, elektronlätt kitinskikt [innehållande kitinpolysackaridfibrillerna och associerade proteiner (Andersen, 1979)] och ett tunt, basalt, mörkare skikt som kallas avsättningszonen (Kaznowski et al., 1985). Kontakt mellan epidermis och den kutikulära avsättningszonen sker oftast i form av mikrovilli på den apikala ytan av epidermala celler. I vart och ett av de muterade embryona har kitinskiktet av endokukikeln (fig. 5D-F, asterisk) sönderfallit, särskilt mot dess basala sida. Ett elektrondens skikt, som förmodligen motsvarar en defekt avsättningszon, var svagt och diskontinuerligt jämfört med vildtypsavsättningszonen, och dess typiska täta kontakt med kitinskiktet ovanför förlorades (Fig. 5D-F′, svarta pilspetsar). På den apikala ytan av de muterade epidermala cellerna kan de typiska mikrovilli fortfarande ses, ofta fästa vid de återstående fragmenten av deponeringszonen. Alla element i den externa epikutikulan verkade vara korrekt bildade i de muterade embryona och förblev i tät kontakt med de övre skikten av endokutikeln. Således, dp, pio och pott krävs för normal bildning av det innersta lagret av aECM och dess fäste till epidermis.

    Kopplingsstrukturer i epidermala celler verkade normala i dp, pio och pott muterade embryon. På grund av störningen av de transalära arrayerna i vingceller som saknade Pio, undersökte vi noggrant den apikala anslutningen av mikrotubulierna i alla tre mutanter, men de verkade normala. Liksom i vildtypen (Fig. 5C"), var de apikala och basala förbindelserna mellan sencellerna i de muterade embryona sammankopplade med stora mikrotubuliknippen (Fig. 5D"-F", vita pilspetsar) och, på den apikala sidan, långa tonofilament sträckte sig bort in i det extracellulära utrymmet (Fig. 5D "-F", vita chevrons). Normalt förankras tonofilament i nagelbandet, men i alla tre mutantbakgrunderna verkar de ha dragits ut. I överensstämmelse med den föreslagna apikala funktionen hos dessa proteiner verkade de basala integrininnehållande adhesiva förbindelserna i sencellerna normala (svarta böjda pilar i Fig. 5C"-F"). Dessutom var fästningen av basalytan av resten av epidermala celler till basalmembranet [som inte är beroende av integriner (Prokop et al., 1998a)], inte heller att skilja från vildtypen (data visas inte). Sammanfattningsvis har den ultrastrukturella analysen bekräftat att funktionen hos de ZP-domäninnehållande proteinerna Dumpy, Piopio och Papillote är begränsad till den apikala ytan av epidermala celler, där vart och ett av proteinerna krävs för fästning till och/eller montering av det inre lagret av aECM.

    Trots likheterna mellan defekterna som observerats på EM-nivå är de embryonala mutantfenotyperna för de tre generna inte identiska. Nagelbandet av homozygot pott embryon verkade svaga efter att de inre vävnaderna lösts upp med Hoyers mountant (Walsh och Brown, 1998), vilket tyder på att aECM inte är lika resistent mot denna behandling, medan nagelbandet av pio eller dp embryon verkade normala (data visas inte). Den normalt raka huvudtrakealstammen verkade vriden och trasig på sina ställen pio (Fig. 4A,B) eller dp muterade embryon, på grund av problem med interkalatoriska rörelser under trakeal morfogenes (Jazwinska et al., 2003), men denna fenotyp hittades inte i pott muterade embryon (data visas inte). Dessa fynd, i kombination med observationen att Pio krävs för bildandet av de transalära arrayerna medan de andra inte är det, indikerade att dessa tre proteiner inte fungerar tillsammans som en enkel funktionell enhet utan att var och en har distinkta funktioner.


    Innehåll

    • .?mn - är en skräddarsydd fil gjord av Team Gastereler för att göra det enkelt att öppna .arc-filer för Nintendo som kan öppnas på PC av dessa filer. Dessa typer av filer är inte tillgängliga någonstans, eftersom de inte har släppts ännu.
    • .?F? – filer som är komprimerade, ofta av SQ-programmet. – 7-Zip komprimerad fil
    • AAPKG – ArchestrA IDE
    • AAC – Advanced Audio Coding – ACE-komprimerad fil
    • ALZ – ALZip komprimerad fil
    • APK – Android-paket: Applikationer som kan installeras i Android-paketformatet för Alpine Linux-distributionen
    • APPX – Microsoft Application Package (.appx)
    • AT3 – Sonys UMD-datakomprimering
    • .bke – BackupEarth.com datakomprimering – pre-Zip datakomprimering
    • ARC - Nintendo U8 Archive (mestadels Yaz0 komprimerad) - ARJ komprimerad fil - en undertextfil skapad av Aegisub, en videotypsättningsapplikation (även en Halo-spelmotorfil)
    • B – (B-fil) Liknar .a, men mindre komprimerad. – Scifer Archive (.ba), Scifer External Archive Type – Speciellt filkomprimeringsformat som används av Electronic Arts för att komprimera data för många av EA:s spel
    • BIN – komprimerat arkiv, kan läsas och användas av CD-ROM och Java, extraherbart med 7-zip och WINRAR
    • bjsn – Används för att lagra The Escapists sparar på Android.
    • BKF (.bkf) – Microsoft-säkerhetskopia skapad av NTBackup.c (.bz2) – – Skyscraper Simulator Building – En cabinet-fil (.cab) är ett bibliotek med komprimerade filer lagrade som en fil. Skåpfiler används för att organisera installationsfiler som kopieras till användarens system. [2]
    • c4 – JEDMICS-bildfiler, ett DOD-system
    • cals – JEDMICS-bildfiler, ett DOD-system
    • xaml – Används i program som Visual Studio för att skapa exe-filer.
    • CLIPFLAIR (.clipflair, .clipflair.zip) – ClipFlair Studio ClipFlair-komponentens sparade tillståndsfil (innehåller komponentalternativ i XML, extra/bifogade filer och kapslade komponenters tillstånd i underordnade .clipflair.zip-filer – aktiviteter är också komponenter och kan kapslas på vilket djup som helst)
    • CPT, SEA – Compact Pro (Macintosh) – Stängt format, komprimerad diskavbildning endast för Windows – Debianinstallationspaket – ett Apple-komprimerat/krypterat format
    • DDZ – en fil som endast kan användas av "daydreamer-motorn" skapad av "fever-dreamer", ett program som liknar RAGS, den används främst för att göra lite korta spel.
    • DN – Adobe Dimension CC-filformat
    • DPE – Paket med AVE-dokument gjorda med Aquafadas digitala publiceringsverktyg.
    • .egg – Alzip Egg Edition komprimerad fil
    • EGT (.egt) – EGT Universal Document som också används för att skapa komprimerade skåpfiler ersätter .ecab
    • ECAB (.ECAB, .ezip) – EGT Compressed Folder som används i avancerade system för att komprimera hela systemmappar, ersatt av EGT Universal Document – ​​Electronic Software Distribution, en komprimerad och krypterad WIM-fil
    • ESS (.ess) – EGT SmartSense-fil, upptäcker filer komprimerade med EGT-komprimeringssystemet.
    • EXE (.exe) – Windows-program
    • Blädderblocksfil (.blädderblock) – Används i PrometheanActivInspire blädderblocksprogramvara.
    • GBP – GBP filtillägg – Vad är en .gbp-fil och hur öppnar jag den? 2 typer av filer: 1. En arkiv indexfil som skapas av Genie Timeline [2]. Den innehåller referenser till de filer som användaren har valt att säkerhetskopiera referenserna kan vara till en arkivfil eller en batch av filer. Dessa filer kan öppnas med Genie-Soft Genie Timeline på Windows. 2. A datautdatafil skapad av CAD Printed Circuit Board (PCB). Den här typen av fil kan öppnas på Windows med Autodesk EAGLE EAGLE | PCB Design Software | Autodesk, Altium Designer [3], Viewplot Välkommen till Viewplot.com. För PCB-relaterad programvara. Viewplot Gerber Viewer & editor i ett. PCB Elegance ett professionellt layoutpaket till ett överkomligt pris, Gerbv gerbv – En gratis/öppen källkod Gerber Viewer på Mac med Autodesk EAGLE, Gerbv, gEDA gplEDA Hemsida och på Linux med Autodesk EAGLE, gEDA, Gerbv
    • GBS (.gbs, .ggp, .gsc) – OtterUI binär scenfil
    • GHO (.gho, .ghs) – Norton Ghost
    • GIF (.gif) – Graphics Interchange Format (.gz) – Komprimerad fil
    • HTML (.html) HTML-kodfil
    • IPG (.ipg) – Format i vilket Apple Inc. paketerar sina iPod-spel. kan extraheras genom Winrar – ZIP-fil med manifest för användning med Java-applikationer. (.Lawrence) – Lawrence Compiler Type-fil – Biblioteksfil – LBR-biblioteksfil komprimerad av SQ-programmet. (.lzh) – Lempel, Ziv, Huffman (.lz) – Komprimerad fil – Lempel–Ziv–Markov kedjealgoritm komprimerad fil
    • MBW (.mbw) – MBRWizard-arkiv
    • MHTML – Mime HTML (Hyper-Text Markup Language) kodfil Arkiv (.mpq) – Används av Blizzard Entertainment
    • BIN (.bin) – MacBinary
    • NL2PKG – NoLimits 2-paket (.nl2pkg)
    • NTH (.nth) – Nokia-tema som används av NokiaSeries 40-mobiltelefoner
    • OAR (.oar) – OAR-arkiv
    • OSK - Komprimerad osu! hudarkiv
    • OSR - Komprimerad osu! spela upp arkivet
    • OSZ – Komprimerad osu! beatmap-arkiv
    • PAK – Förbättrad typ av .ARC-arkiv
    • PAR (.par, .par2) – Parchive
    • PAF (.paf) – Bärbar applikationsfil
    • PEA (.pea) – PeaZip-arkivfil
    • PHP (.php) – PHP-kodfil
    • PYK (.pyk) – Komprimerad fil
    • PK3 (.pk3) – Quake 3-arkiv (se anmärkning om Doom³)
    • PK4 (.pk4) – Doom³-arkiv (öppnar på samma sätt som ett zip-arkiv.)
    • py / pyw – Python-kodfil (.rar) – Rar-arkiv, för arkiv med flera filer (rar till .r01-.r99 till s01 och så vidare)
    • RAG, RAGS – Spelfil, ett spel som kan spelas i RAGS-spelmotorn, ett gratisprogram som både låter människor skapa spel och spela spel, skapade spel har formatet "RAG-spelfil"
    • RaX – Arkivfil skapad av RaX
    • RBXL – Roblox Studio platsfil
    • RBXLX – Roblox Studio XML-platsfil
    • RBXM - Roblox studio skriptfil
    • RPM – Red Hat-paket/installationsprogram för Fedora, RHEL och liknande system.
    • sb – Scratch-fil
    • sb2 – Scratch 2.0-fil
    • sb3 - Scratch 3.0-fil
    • SEN – Scifer Archive (.sen) – Scifer Internal Archive Type (.sitx) – StuffIt (Macintosh) /SISX – Symbian Application Package
    • SKB – Google SketchUp backup-fil
    • SQ (.sq) – Squish Compressed Archive
    • SWM – Delad WIM-fil, vanligtvis på OEMRecovery Partition för att lagra förinstallerad Windows-avbildning och för att göra återställningssäkerhetskopiering (till USB-enhet) enklare (på grund av FAT32-begränsningar)
    • SZS – Nintendo Yaz0 Compressed Archive – grupp av filer, paketerade som en fil
    • TGZ (.tar.gz) – gzippad tar-fil
    • TB (.tb) – Tabbery Virtual Desktop Tab-fil (.tib) – Acronis True Image backup
    • UHA – Ultra High Archive Compression
    • UUE (.uue) – unified utility engine – det generiska och standardformatet för allt som är relaterat till UUe.
    • VIV – Arkivformat som används för att komprimera data för flera videospel, inklusive Need For Speed: High Stakes.
    • VOL – datapaket för videospel.
    • VSA – Altiris Virtual Software Archive
    • WAX – Wavexpress – Ett ZIP-alternativ optimerat för paket som innehåller video, vilket gör att flera paketerade filer kan levereras allt-eller-ingen med nästan omedelbar uppackning via NTFS-filsystemmanipulation. – En komprimerad diskavbildning för installation av Windows Vista eller senare, Windows Fundamentals for Legacy PC eller återställning av en systemavbildning gjord från Säkerhetskopiering och återställning (Windows Vista/7)
    • XAP – Windows Phone Application Package
    • xz – xz komprimerade filer, baserade på LZMA/LZMA2-algoritmen
    • Z – Unixcompress-fil – baserad på LZW – populärt komprimeringsformat

    Arkivering av fysiska inspelningsbara media Redigera

      – Det generiska formatet för de flesta optiska medier, inklusive CD-ROM, DVD-ROM, Blu-ray Disc, HD DVD och UMD. – Det egenutvecklade optiska mediearkivformatet som används av Nero-program.
    • IMG – För arkivering av DOS-formaterade disketter, större optiska media och hårddiskar.
    • ADF – Amiga diskformat, för arkivering av Amiga-disketter
      • ADZ – Den GZip-komprimerade versionen av ADF.
      • DMS – Disk Masher System, ett diskarkiveringssystem som är inbyggt i Amiga.

      (MPEG-1 finns i en .DAT-fil på en video-CD.)

        – DiscJuggler-bildfil – CDRWrite CUE-bildfil – Easy CD Creator .cif-format – Roxio-WinOnCD .c2d-format – PowerISO .daa-format – BlindWrite 6-bildfil – BlindWrite 5-bildfil – BlindWrite 4-bildfil
    • FFPKG - FreeFire-profilexportpaket
    • Datorstödd är ett prefix för flera kategorier av verktyg (t.ex. design, tillverkning, ingenjörskonst) som hjälper yrkesverksamma inom sina respektive områden (t.ex. bearbetning, arkitektur, scheman).

      Datorstödd design (CAD) Redigera

      Programvara för datorstödd design (CAD) hjälper ingenjörer, arkitekter och andra designproffs i projektdesign.

        – Dassault Systemes grafisk representation – Microsoft 3D Manufacturing Format [3]
      • ACP – VA Software VA – Virtual Architecture CAD-fil
      • AMF – Additive Manufacturing File Format
      • AEC – DataCAD-ritningsformat [4]
      • AR – Ashlar-Vellum Argon – 3D-modellering
      • ART – ArtCAM-modell
      • ASC – BRL-CAD Geometry File (gammalt ASCII-format)
      • ASM – Solidedge Assembly, Pro/ENGINEER Assembly
      • BIN, BIM – Data Design System DDS-CAD
      • BREP – Open CASCADE 3D-modell (form)
      • C3D – C3D Toolkit-filformat
      • CCC – CopyCAD-kurvor
      • CCM – CopyCAD-modell
      • CCS – CopyCAD-session
      • CAD – CadStd
      • CATDrawing – CATIA V5 Ritningsdokument
      • CATPart – CATIA V5 deldokument
      • CATProduct – CATIA V5 Monteringsdokument
      • CATProcess – CATIA V5 Tillverkningsdokument
      • cgr – CATIA V5 grafisk representationsfil
      • ckd – KeyCreator CAD-modellering
      • ckt – KeyCreator CAD-modellering
      • CO – Ashlar-Vellum Cobalt – parametrisk ritning och 3D-modellering
      • DRW – Caddy Tidig version av Caddy-ritning – Innan Caddy byter till DWG
      • DFT – Solidedge Draft – MicroStation designfil
      • DGK – Delcam Geometry
      • DMT – Delcam bearbetningstrianglar
      • DXF – ASCII Drawing Interchange filformat, AutoCAD
      • DWB – VariCAD ritfil
      • DWF – Autodesks webbdesignformat AutoCAD & Revit kan publicera till detta format som liknar PDF-filer.
      • EASM – SolidWorks eDrawings monteringsfil
      • EDRW – eDrawings ritfil
      • EMB – Wilcom ES Designer Embroidery CAD-fil
      • EPRT – eDrawings delfil
      • EscPcb – "esCAD pcb" datafil av Electro-System (Japan)
      • EscSch – "esCAD sch" datafil av Electro-System (Japan)
      • ESW – AGTEK-format
      • EXCELLON – Excellon-fil
      • EXP – Drawing Express-format
      • F3D – Autodesk Fusion 360 arkivfil [5]
      • FCStd – Inbyggt filformat för FreeCADCAD/CAM-paketet
      • FM – FeatureCAM Part File
      • FMZ – FormZ Project-fil
      • G – BRL-CAD geometrifil
      • GBR – Gerber-fil
      • GLM – KernelCAD-modell
      • GRB – T-FLEX CAD-fil
      • GTC – GRAITEC Advance-format
      • IAM – Autodesk Inventor Assembly-fil
      • ICD – IronCAD 2D CAD-fil
      • IDW – Autodesk Inventor Ritningsfil – buildingSMART för delning av AEC- och FM-data – Initial Graphics Exchange Specification – Intergraph
      • IO – Stud.io 3d-modell
      • IPN – Autodesk Inventor Presentationsfil
      • IPT – Autodesk Inventor Part file – Jupiter Tesselation
      • MCD – Monu-CAD (Monument/Headstone Ritningsfil)
      • MDG – Modell av digital geometrisk kärna
      • modell – CATIA V4 deldokument
      • OCD – Orienteering Computer Aided Design (OCAD) fil
      • PAR – Solidedge Part
      • PIPE – PIPE-FLO Professionell designfil för rörsystem
      • PLN – ArchiCad-projekt
      • PRT – NX (nyligen känt som Unigraphics), Pro/ENGINEER-del, CADKEY-del
      • PSM – Solidedge Sheet
      • PSMODEL – PowerSHAPE-modell
      • PWI – PowerINSPECT-fil
      • PYT – Pythagoras-fil
      • SKP – SketchUp-modell
      • RLF – ArtCAM Relief
      • RVM – AVEVAPDMS 3D Review-modell
      • RVT – Autodesk Revit-projektfiler
      • RFA – Autodesk Revit familjefiler
      • S12 – Spirit fil, av Softtech
      • SCAD – OpenSCAD 3D delmodell
      • SCDOC – SpaceClaim 3D-del/montering
      • SLDASM – SolidWorks Assembly ritning
      • SLDDRW – SolidWorks 2D-ritning
      • SLDPRT – SolidWorks 3D-delmodell – För Softimage – Standard för utbyte av produktmodelldata – Stereolitografiskt dataformat som används av olika CAD-system och stereolitografiska tryckmaskiner.
      • STD – Power Vision Plus – Elmätardata (Circutor)
      • TCT – TurboCAD ritmall
      • TCW – TurboCAD för Windows 2D- och 3D-ritning
      • UNV – I-DEAS I-DEAS (Integrated Design and Engineering Analysis Software)
      • VC6 – Ashlar-Vellum Graphite – 2D- och 3D-ritning
      • VLM – Ashlar-Vellum Vellum, Vellum 2D, Vellum Draft, Vellum 3D, DrawingBoard
      • VS – Ashlar-Vellum Vellum Solids – Liknar STL, men inkluderar färg. Används av olika CAD-system och snabba prototypmaskiner för 3D-utskrift. Används även för VRML-modeller på webben.
      • X_B – Parasolids binärt format
      • X_T – Parasolider
      • XE – Ashlar-Vellum Xenon – för associativ 3D-modellering
      • ZOFZPROJ – ZofzPCB 3D PCB-modell, som innehåller mesh, nätlist och BOM

      Elektronisk designautomation (EDA) Redigera

      Elektronisk designautomation (EDA), eller elektronisk datorstödd design (ECAD), är specifik för området elektroteknik.

      • BRD – Board-fil för EAGLE Layout Editor, ett kommersiellt PCB-designverktyg – Beskrivningsspråk för testning genom JTAG
      • CDL – Transistor-nivå nätlistformat för IC-design – Power-domänspecifikation i system-on-a-chip (SoC) implementering (se även UPF) – Gate-nivå layout – Detaljerad standard parasitformat, Analog-nivå parasiter av sammankopplingar i IC-design – Leverantörsneutral gate-nivå nätlistformat
      • FSDB – Analogvågformsformat (se även Waveform viewer) – Format för PCB och layout av integrerade kretsar – ASCII-kodat binärt format för minnesdumpar
      • LEF – Library Exchange Format, fysiskt sammandrag av celler för IC-design – biblioteksmodelleringsformat (funktion, timing).
      • MS12 – NI Multisim-fil
      • OASIS – Open Artwork System Interchange Standard – Designa databasformat med API:er
      • PSF – Cadence proprietärt format för att lagra simuleringsresultat/vågformer (2 GB gräns)
      • PSFXL – Patentskyddat kadensformat för att lagra simuleringsresultat/vågformer
      • SDC – Synopsys Design Constraints, format för syntesrestriktioner – Standard för gate-nivå timings – Standardformat för parasiter av sammankopplingar i IC-design
      • SPI, CIR – SPICE Netlist, nätlista på enhetsnivå och kommandon för simulering, S19 – S-record, ASCII-kodat format för minnesdumpar
      • SST2 – Patentskyddat kadensformat för att lagra simuleringsresultat/vågformer för blandade signaler
      • STIL – Standard Test Interface Language, IEEE1450-1999 standard för testmönster för IC
      • SV – SystemVerilog källfil
      • S*P – Touchstone/EEsof Scattering parameterdatafil – multi-port blackbox-prestanda, mätning eller simulerad – Innehåller timing och logisk information om en samling celler (kretselement) – Standard för Power-domänspecifikation i SoC-implementering
      • V – Verilog källfil – Standardformat för digital simuleringsvågform
      • VHD, VHDL – VHDL-källfil
      • WGL – Waveform Generation Language, format för testmönster för IC

      Testteknik Redigera

      Filer som matas ut från automatisk testutrustning eller efterbehandlas från sådan.

      • 4DB – 4D databas Strukturfil
      • 4DD – 4D databas Datafil
      • 4DIndy – 4D databas strukturindexfil
      • 4DIndx – 4D-databas Data Index-fil
      • 4DR – 4D-databas Dataresursfil (i gamla 4D-versioner)
      • ACCDB – Microsoft Database (Microsoft Office Access 2007 och senare)
      • ACCDE – Kompilerad Microsoft-databas (Microsoft Office Access 2007 och senare)
      • ADT – Sybase Advantage Database Server (ADS)
      • APR – Lotus Approach-datainmatning och rapporter
      • BOX – Lotus Notes Post Office e-postdirigeringsdatabas
      • CHML – Krasbit Technologies Krypterad databasfil för integration med 1 klick mellan programvara för kontakthantering och chameleon(tm)-linjen av arbetsflödeslösningar för bildbehandling
      • DAF – Digital Anchor datafil
      • DAT – DOS Basic
      • DAT – Intersystems Caché-databasfil
      • DB – Paradox
      • DB – SQLite
      • DBF – db/dbase II,III,IV och V, Clipper, Harbour/xHarbour, Fox/FoxPro, Oracle
      • DTA – Sage Sterling databasfil
      • EGT – EGT Universal Document, som används för att komprimera sql-databaser till mindre filer, kan innehålla original EGT-databasstil.
      • ESS – EGT SmartSense är en databas med filer och dess komprimeringsstil. Specifik för EGT SmartSense
      • EAP – Enterprise Architect Project
      • FDB – Firebird-databaser
      • FDB – Navision databasfil
      • FP, FP3, FP5 och FP7 – FileMaker Pro
      • FRM – MySQL-tabelldefinition
      • GDB – Borland InterBase Databases
      • GTABLE – Google DriveFusion-tabell
      • KEXI – Kexi databasfil (SQLite-baserad)
      • KEXIC – genväg till en databasanslutning för en Kexi-databaser på en server
      • KEXIS – genväg till en Kexi-databas
      • LDB – Tillfällig databasfil, existerar endast när databasen är öppen
      • LIRS - Laered jagntagerSatt rasa. Lagrar intag med tecken som semikolon för att skapa listor med data.
      • MDA – Tilläggsfil för Microsoft Access
      • MDB – Microsoft Access-databas
      • ADP – Microsoft Access-projekt (används för att komma åt databaser på en server)
      • MDE – kompilerad Microsoft-databas (åtkomst)
      • MDF – Microsoft SQL Server Database
      • MYD – MySQL MyISAM-tabelldata
      • MYI – MySQL MyISAM-tabellindex
      • NCF – Lotus Notes-konfigurationsfil
      • NSF – Lotus Notes-databas
      • NTF – Designmall för Lotus Notes-databas
      • NV2 – QW Page NewViews objektorienterad redovisningsdatabas
      • ODB – LibreOffice Base eller OpenOffice Base-databas
      • ORA – Oracle tablespace-filer får ibland detta tillägg (används även för konfigurationsfiler)
      • PCONTACT – WinIM-kontaktfil
      • PDB – Palm OS Database
      • PDI – Portable Database Image
      • PDX – Corel Paradox databashantering
      • PRC – Palm OS resursdatabas – buntade SQL-frågor
      • REC – GNU återupptar databas
      • REL – Sage Hämta 4GL-datafil
      • RIN – Sage Hämta 4GL indexfil
      • SDB – StarOffices StarBase
      • SDF – SQL Compact Database-fil
      • sqlite – SQLite
      • UDL – Universal Data Link
      • waData – Wakanda (programvara) databas Datafil
      • waIndx – Wakanda (programvara) databas Indexfil
      • waModel – Wakanda (programvara) databas Modellfil
      • waJournal – Wakanda (programvara) databas Journalfil
      • WDB – Microsoft Works Database
      • WMDB – Windows Media Database-fil – CurrentDatabase_360.wmdb-filen kan innehålla filnamn, filegenskaper, musik, video, foto och spellistinformation.
      • Avro - Dataformat lämpligt för inmatning av postbaserade attribut. Utmärkande kännetecken är att schemat lagras på varje rad vilket möjliggör schemautveckling.
      • Parkett - Kolumndatalagring. Det används vanligtvis inom Hadoop-ekosystemet.
      • ORC - Liknar Parquet, men har bättre datakomprimering och hantering av schemautveckling.
      • AI – Adobe Illustrator
      • AVE / ZAVE – Aquafadas
      • CDR – CorelDRAW
      • CHP / pub / STY / CAP / CIF / VGR / FRM – Ventura Publisher – Xerox (DOS / GEM)
      • CPT – Corel Photo-Paint
      • DTP – Greenstreet Publisher, GST PressWorks
      • FM – Adobe FrameMaker
      • GDRAW – Google Drive Drawing
      • ILDOC – Broadvision Quicksilver-dokument
      • INDD – Adobe InDesign
      • MCF – FotoInsight Designer
      • PDF – Adobe Acrobat eller Adobe Reader
      • PMD – Adobe PageMaker
      • PPP – Serif PagePlus
      • PSD – Adobe Photoshop
      • PUB – Microsoft Publisher
      • QXD – QuarkXPress
      • SLA / SCD – Scribus – Filformat som används av GIMP, såväl som andra program
      • 0 – Vanligt textdokument, används normalt för licensiering
      • 1ST – Vanligt textdokument, normalt föregås av orden "README" (README.1ST)
      • 600 – Vanligt textdokument, används i UNZIP-historikloggen
      • 602 – Text602-dokument
      • ABW – AbiWord-dokument
      • ACL – MS Word AutoCorrect List
      • AFP – Advanced Function Presentation – IBc
      • AMI – Lotus Ami Pro
      • ANS – American National Standards Institute (ANSI) text
      • ASC – ASCII-text
      • AWW – Ability Write
      • CCF – Color Chat 1.0
      • CSV – ASCII-text som kommaseparerade värden, används i kalkylblad och databashanteringssystem
      • CWK – ClarisWorks-AppleWorks-dokument
      • DBK – DocBook XML-underformat
      • DITA – Darwin Information Typing Architecture-dokument – ​​Microsoft Word-dokument
      • DOCM – Microsoft Word makroaktiverat dokument
      • DOCX – Office Open XML-dokument
      • DOT – Microsoft Word-dokumentmall
      • DOTX – Office Open XML textdokumentmall
      • DWD – DavkaWriter Heb/Eng ordbehandlingsfil
      • EGT – EGT Universal Document
      • EPUB – EPUB öppen standard för e-böcker
      • EZW – Reagency Systems easyOFFER-dokument [6]
      • FDX – Final Draft
      • FTM – Fielded Text Meta
      • FTX – Fälttext (deklarerad)
      • GDOC – Google Drive Document – ​​HyperText Markup Language (.html, .htm)
      • HWP – Haansoft (Hancom) Hangul ordbehandlare dokument
      • HWPML – Haansoft (Hancom) Hangul Word Processor Markup Language-dokument
      • LOG – Textloggfil
      • LWP – Lotus Word Pro
      • MBP – metadata för Mobipocket-dokument
      • MD – Markdown textdokument
      • ME – Vanligt textdokument som normalt föregås av ordet "READ" (READ.ME)
      • MCW – Microsoft Word för Macintosh (version 4.0–5.1)
      • Mobi – Mobipocket-dokument
      • OBS – Mathematica Notebook
      • nb – Nota Bene Document (Academic Writing Software)
      • NBP – Mathematica Player Notebook
      • NEIS – 학교생활기록부 작성 프로그램 (Student Record Writing Program) Dokument
      • NT – N-TriplesRDF-behållare (.nt)
      • NQ – N-QuadsRDF-behållare (.nq)
      • ODM – OpenDocument huvuddokument
      • ODOC – Synology Drive Office-dokument
      • ODT – OpenDocument-textdokument
      • OSHEET – Synology Drive Office-kalkylblad
      • OTT – OpenDocument textdokumentmall
      • OMM – OmmWriter textdokument
      • PAGES – Apple Pages-dokument
      • PAP – Papyrus ordbehandlare dokument
      • PDAX – Portable Document Archive (PDA) dokumentindexfil
      • PDF – Portable Document Format
      • QUOX – Question Object File Format för Quobject Designer eller Quobject Explorer – Rich Text-dokument
      • RPT – Crystal Reports
      • SDW – StarWriter-textdokument, som används i tidigare versioner av StarOffice
      • SE – Shuttle Document
      • STW – OpenOffice.org XML (föråldrad) textdokumentmall
      • Sxw – OpenOffice.org XML (föråldrat) textdokument – ​​TeX
      • INFO – Texinfo – ASCII eller Unicodeplain textfil
      • UOF – Uniform Office Format
      • UOML – Unique Object Markup Language
      • VIA – Revoware VIA Document Project File
      • WPD – WordPerfect-dokument
      • WPS – Microsoft Works-dokument
      • WPT – Microsoft Works dokumentmall
      • WRD – WordIt! dokumentera
      • WRF – ThinkFree Write
      • WRI – Microsoft Write-dokument (xhtml, xht) – eXtensible HyperText Markup Language – eXtensible Markup Language – Open XML Paper Specification
      • MYO – MYOB Limited (Windows) fil
      • MYOB – MYOB Limited (Mac) fil
      • TAX – TurboTax-fil
      • YNAB – Du behöver en budgetfil (YNAB).

      Finansiell dataöverföringsformat Redigera

      • Interactive Financial Exchange (IFX) – XML-baserad specifikation för olika former av finansiella transaktioner (.ofx) – öppen standard som stöds av CheckFree och Microsoft och delvis av Intuit SGML och senare XML-baserat – proprietärt betalformat som endast används av Intuit (. qif) – öppen standard som tidigare stöddes av Intuit
      • ABF – Adobe Binary Screen Font
      • AFM – Adobe Font Metrics
      • BDF – Bitmap Distribution Format
      • BMF – ByteMap Font Format
      • BRFNT - Binary Revolution Font Format
      • FNT – Bitmapped Font – Graphics Environment Manager (GEM)
      • FON – Bitmapped Font – Microsoft Windows
      • MGF – MicroGrafx Font
      • OTF – OpenType Font
      • PCF – Portable Compiled Format Font – Typ 1, Typ 2
        • PFA – Printer Font ASCII
        • PFB – Printer Font Binary – Adobe
        • PFM – Printer Font Metrics – Adobe
        • AFM – Adobe Font Metrics
        • FOND – Font Description-resurs – Mac OS
        • ASC – ASCII-punkt av intresse (POI) textfil
        • APR – ESRI ArcView 3.3 och tidigare projektfil
        • DEM – USGS DEM filformat
        • E00 – ARC/INFO utbytesfilformat –Geografiskt placerade data i objektnotation – Geografiskt placerade rasterdata
        • GML – Geography Markup Language-fil [7] – XML-baserat utbytesformat – TomTom Itinerary-format
        • MXD – ESRI ArcGIS projektfil, 8.0 och högre
        • NTF – National Transfer Format-fil
        • OV2 – TomTom POI-överlagringsfil
        • SHP – ESRI shapefile
        • TAB – MapInfo Table-filformat
        • World TIFF – Geografiskt placerade rasterdata: textfil som ger hörnkoordinater, rasterceller per enhet och rotation – Digital Terrain Elevation Data – Keyhole Markup Language, XML-baserat
          – 3D Topicscape, databasen där metadata för ett 3D Topicscape finns, det är en form av 3D-konceptkarta (som en 3D-mind-map) som används för att organisera idéer, information och datorfiler – 3D Topicscape-fil, produceras när en associationstyp exporteras används för att tillåta tur och retur (exportera Topicscape, ändra filer och mappar efter önskemål, återimport till 3D Topicscape) – Linjärt referenssystem – 3D Topicscape-fil, produceras när en fillös förekomst i 3D Topicscape exporteras till Windows. Används för att tillåta tur och retur (exportera Topicscape, ändra filer och mappar efter önskemål, återimportera dem till 3D Topicscape)
      • MGMF – MindGenius Mind Mapping Software filformat – FreeMind mind map file (XML) – Mind Manager mind map fil – 3D Topicscape-fil, producerad när en inter-Topicscape ämneslänkfil exporteras till Windows som används för att tillåta rundresa (export Topicscape, ändra filer och mappar efter önskemål, återimportera till 3D Topicscape)
      • Färgpaletter Redigera

        • ACT – Adobe Color Table. Innehåller en rå färgpalett och består av 256 24-bitars RGB-färgvärden.
        • ASE – Adobe Swatch Exchange. Används av Adobe Photoshop, Illustrator och InDesign. [8]
        • GPL – GIMP palettfil. Använder en textrepresentation av färgnamn och RGB-värden. Olika grafiska redigerare med öppen källkod kan läsa detta format, [9] inklusive GIMP, Inkscape, Krita, [10]KolourPaint, Scribus, CinePaint och MyPaint. [11]
        • PAL – Microsoft RIFF palettfil

        Färghantering Redigera

        Rastergrafik Redigera

        Raster- eller bitmappsfiler lagrar bilder som en grupp av pixlar.

          – America Online proprietärt format
        • BLP – Blizzard Entertainment proprietärt texturformat – Microsoft Windows Bitmap-formaterad bild
        • BTI – Nintendo proprietära texturformat
        • CD5 – Chasys Draw IES-bild
        • CIT – Intergraph är ett monokromt bitmappsformat
        • CPT – Corel PHOTO-PAINT-bild
        • CR2 – Canon camera raw format bilder har detta på vissa Canon kameror om kvaliteten är valt i kamerainställningarna
        • CLIP – CLIP STUDIO PAINT-format
        • CPL – Windows kontrollpanelsfil – DirectX texturfil – Enhetsoberoende bitmappsgrafik – DjVu för skannade dokument
        • EGT – EGT Universal Document, används i EGT SmartSense för att komprimera PNG-filer till ännu en mindre fil
        • Exif – Exchangeable image file format (Exif) är en specifikation för bildformatet som används av digitalkameror – CompuServes Graphics Interchange Format
        • GRF – Zebra Technologies proprietära format – format för ikoner i macOS. Innehåller bitmappsbilder med flera upplösningar och bitdjup med alfakanal. – ett format som används för ikoner i Microsoft Windows. Innehåller små bitmappsbilder med flera upplösningar och bitdjup med 1-bitars transparens eller alfakanal.
        • IFF (.iff, .ilbm, .lbm) – ILBM – en enkelbilds MNG som använder JPEG-komprimering och möjligen en alfakanal , JFIF (.jpg eller .jpeg) – Joint Photographic Experts Group, ett bildformat med förlust som ofta används för att visa fotografier bilder – JPEG2000 – JPEG Stereo
        • KRA – Krita bildfil
        • LBM – Deluxe Paint bildfil
        • MAX – ScanSoft PaperPort-dokument
        • MIFF – ImageMagicks ursprungliga filformat
        • MNG – Multiple-image Network Graphics, den animerade versionen av PNG
        • MSP – ett format som används av gamla versioner av Microsoft Paint ersatt av BMP i Microsoft Windows 3.0 – En amerikansk regeringsstandard som vanligtvis används i intelligenssystem – Over The Air bitmapp, en specifikation designad av Nokia för svartvita bilder för mobiltelefoner – Bärbar bitmapp
        • PC1 – Lågupplöst, komprimerad Degas bildfil
        • PC2 – Medium upplösning, komprimerad Degas bildfil
        • PC3 – Högupplöst, komprimerad Degas bildfil
        • PCF – Pixel Coordination Format – ett förlustfritt format som används av ZSofts PC Paint, populärt under en tid på DOS-system.
        • PDN – Paint.NET-bildfil
        • PGM – Bärbar gråkarta
        • PI1 – Lågupplöst, okomprimerad Degas bildfil
        • PI2 – Medium upplösning, okomprimerad Degas bildfil även Portrait Innovations krypterat bildformat
        • PI3 – Högupplöst, okomprimerad Degas bildfil , PCT – Apple Macintosh PICT-bild – Portable Network Graphic (förlustfri, rekommenderas för visning och upplaga av grafiska bilder)
        • PNM – Bärbar anymap grafisk bitmappsbild
        • PNS – PNG Stereo
        • PPM – Portable Pixmap (Pixel Map) bild
        • PSB – Adobe Photoshop Stor bildfil (för stora filer)
        • PSD, PDD – Adobe Photoshop Drawing
        • PSP – Paint Shop Pro-bild
        • PX – Bildfil för bildredigerare för pixlar
        • PXM – Pixelmator bildfil
        • PXR – Pixar Image Datorbildfil
        • QFX – QuickLink Fax-bild – Allmän term för minimalt bearbetade bilddata (inhämtad av en digitalkamera)
        • RLE – en kodningsbild i körlängd – Scitex Continuous Tone-bildfil
        • SGI, RGB, INT, BW – Silicon Graphics Image (.tga, .targa, .icb, .vda, .vst, .pix) – Truevision TGA (Targa)-bild
        • TIFF (.tif eller .tiff) – Taggat bildfilformat (vanligtvis förlustfritt, men det finns många varianter, inklusive förluster) (.tif eller .tiff) – Tagga bildfilformat / elektronisk fotografering, ISO 12234-2 brukar användas som grund för andra format snarare än i sig.
        • VTF – Valve Texture Format
        • XBM – X Window System Bitmap
        • XCF – GIMP-bild (från Gimps ursprung vid Experimental Computing Facility vid University of California) – X Window System Pixmap
        • ZIF – Zoombart/Zoomify Image Format (ett webbvänligt, TIFF-baserat, zoombart bildformat)

        Vektorgrafik Redigera

        Vektorgrafik använder geometriska primitiver som punkter, linjer, kurvor och polygoner för att representera bilder.

          – 3D wireframe-grafik av Oscar Garcia – Additive Manufacturing File Format – Ability Draw – Adobe Illustrator Document – ​​Computer Graphics Metafile, en ISO-standard
        • CDR – CorelDRAW-dokument
        • CMX – CorelDRAW vektorbild
        • DP – Ritprogramfil för PERQ[12] – ASCII Drawing Interchange filformat, används i AutoCAD och andra CAD-program
        • E2D – 2-dimensionell vektorgrafik som används av editorn som ingår i JFire
        • EGT – EGT Universal Document, EGT Vector Draw-bilder används för att rita vektor till en webbplats – Encapsulated Postscript
        • FS – FlexiPro-fil
        • GBR – Gerber-fil
        • ODG – OpenDocument Drawing
          – Stereolitografiskt dataformat (se STL (filformat)) som används av olika CAD-system och stereolitografiska tryckmaskiner. Se ovan. Använder tillägget .wrl – Virtual Reality Modeling Language, för att skapa 3D-visningsbara webbbilder.

        3D-grafik Redigera

        3D-grafik är 3D-modeller som gör det möjligt att bygga modeller i realtid eller icke-realtid 3D-rendering.

        • 3DMF – QuickDraw 3D-metafil (.3dmf)
        • 3DM – OpenNURBS Initiative 3D-modell (används av Rhinoceros 3D) (.3dm)
        • 3MF – Microsoft 3D Manufacturing Format (.3mf) [3] – äldre 3D Studio Model (.3ds)
        • ABC – Alembic (datorgrafik)
        • AC – AC3D-modell (.ac) – Filformat för additiv tillverkning
        • AN8 – Anim8or Model (.an8)
        • AOI – Art of Illusion Model (.aoi)
        • ASM – PTC Creo-montering (.asm)
        • B3D – Blitz3D-modell (.b3d)
        • BLEND – Blender (.blend)
        • BLOCK – Blenderkrypterade blandningsfiler (.block)
        • BMD3 – NintendoGameCube förstaparts J3D proprietära modellformat (.bmd)
        • BDL4 – NintendoGameCube och Wii förstaparts J3D proprietära modellformat (2002, 2006–2010) (.bdl)
        • BRRES – NintendoWii förstaparts egenutvecklade modellformat 2010+ (.brres)
        • BFRES – NintendoWii U och senare Switch förstaparts proprietära modellformat
        • C4D – Cinema 4D (.c4d)
        • Cal3D – Cal3D (.cal3d) – röntgenkristallografi-voxlar (elektrondensitet)
        • CFL – komprimerat filbibliotek (.cfl)
        • COB – Caligari Object (.cob)
        • CORE3D – Coreona 3D Coreona 3D virtuell fil(.core3d)
        • CTM – OpenCTM (.ctm)
        • DAE – COLLADA (.dae)
        • DFF – RenderWare binär ström, vanligen använd av spel från Grand Theft Auto III-eran såväl som andra RenderWare-titlar
        • DPM – deepMesh (.dpm)
        • DTS – Torque Game Engine (.dts)
        • EGG – Panda3D Engine
        • FAKTA – elektrisk bild (.fac)
        • FBX – Autodesk FBX (.fbx)
        • G – BRL-CAD-geometri (.g)
        • GLB – en binär form av glTF som krävs för att laddas i Facebook 3D-inlägg. (.glb)
        • GLM – Ghoul Mesh (.glm) – JSON-standarden utvecklad av Khronos Group (.gltf)
        • IO - Bricklink Stud.io 2.0 modellfil (.io)
        • IOB – Imagine (3D-modelleringsprogram) (.iob)
        • JAS – Cheetah 3D-fil (.jas)
        • LDR - LDraw Model File (.ldr)
        • LWO – Lightwave Object (.lwo)
        • LWS – Ljusvågsscen (.lws)
        • LXF – LEGO Digital Designer Model-fil (.lxf)
        • LXO – Luxology Modo (programvara) fil (.lxo)
        • M3D – Model3D, universellt, motorneutralt format (.m3d)
        • MA – Autodesk Maya ASCII-fil (.ma)
        • MAX – Autodesk 3D Studio Max-fil (.max)
        • MB – Autodesk Maya Binary File (.mb)
        • MPD - LDraw Multi-Part Document Model File (.mpd) – Quake 2 modellformat (.md2) – Quake 3 modellformat (.md3) – Doom 3 modellformat (.md5)
        • MDX – Blizzard Entertainments eget modellformat (.mdx)
        • MESH – New York University(.m)
        • MESH – Meshwork Model (.mesh)
        • MM3D – Misfit Model 3d (.mm3d)
        • MPO – Multi-Picture Object – Denna JPEG-standard används för 3d-bilder, som med Nintendo 3DS – voxlar i kryo-elektronmikroskopi
        • NIF – Gamebryo NetImmerse-fil (.nif)
        • OBJ – Wavefront .obj-fil (.obj)
        • AV – AV Objektfilformat (.off)
        • OGEX – Open Game Engine Exchange (OpenGEX) format (.ogex) – Polygonfilformat / Stanford Triangle Format (.ply)
        • PRC – Adobe PRC (inbäddad i PDF-filer)
        • PRT – PTC Creo-del (.prt)
        • POV – POV-Ray-dokument (.pov)
        • R3D – Realsoft 3D (Real-3D) (.r3d)
        • RWX – RenderWare Object (.rwx)
        • SIA – Nevercenter Silo Object (.sia)
        • SIB – Nevercenter Silo Object (.sib)
        • SKP – Google Sketchup-fil (.skp)
        • SLDASM – SolidWorks Assembly Document (.sldasm)
        • SLDPRT – SolidWorks Part Document (.sldprt)
        • SMD – Valve Studiomdl Dataformat (.smd)
        • U3D – Universal 3D-format (.u3d)
        • USD – Universal Scen Description (.usd)
        • USDA – Universal Scene Description , läsbart textformat (.usda)
        • USDC – Universal Scene Description , binärt format (.usdc)
        • USDZ – Universal Scene Description Zip (.usdz)
        • VIM – Reviztos visuella informationsmodellformat (.vimproj)
        • VRML97 – VRML Virtual reality-modelleringsspråk (.wrl)
        • VUE – Vue-scenfil (.vue)
        • VWX – Vectorworks (.vwx)
        • WINGS – Wings3D (.wings)
        • W3D – Westwood 3D-modell (.w3d)
        • X – DirectX 3D-modell (.x)
        • X3D – Utökningsbar 3D (.x3d)
        • Z3D – Zmodeler (.z3d)
        • ZBMX - MecabricksBlender-tillägg (.zbmx)
          – ett format utformat för att lagra glesa matriser
        • MML – MathML – Mathematical Markup Language
        • ODF – OpenDocument Math Formula
        • SXM – OpenOffice.org XML (föråldrad) Math Formula
          – plugins för vissa fotoredigeringsprogram inklusive Adobe Photoshop, Paint Shop Pro, GIMP och Helicon Filter.
        • .a – Objective C native static library – (inget suffix för körbar bild, .o för objektfiler, .so för delade objektfiler) klassiskt UNIX-objektformat, nu ofta ersatt av ELF
        • APK – Android-applikationspaket
        • APP – En mapp som finns på macOS-system som innehåller programkod och resurser, som visas som en fil. – en körbar bild för RSTS/E-systemet, skapad med BASIC-PLUSSAMMANSTÄLLA kommando [13] – en Win32 PE-fil skapad med Borland Delphi eller C++Builder som innehåller ett paket. – en Macintosh-plugin skapad med Xcode eller make som innehåller körbar kod, datafiler och mappar för den koden. – används i Java (inget suffix för körbar bild, .o för objektfiler) – UNIX Common Object File Format, nu ofta ersatt av ELF – kommandon som används i DOS och CP/M – Delphi-kompilerad enhet – bibliotek som används i Windows och OS/ 2 för att lagra data, resurser och kod.
        • DOL – formatet som används av GameCube och Wii, förkortning för Dolphin, vilket var kodnamnet för GameCube. – arkiv av Java-företagsapplikationer – (inget suffix för körbar bild, .o för objektfiler, .so för delade objektfiler) som används i många moderna Unix- och Unix-liknande system, inklusive Solaris, andra System V Release 4-derivat, Linux, och BSD) (se paketet) (.exe – används i DOS) – exekverbar fil för apple IOS-applikationer. En annan form av zip-fil. – ett filformat som tillåter exekvering direkt från statiskt minne [14] – arkiv av Java-klassfiler – PKZIP-arkiv som kan köras av Mozillawebbläsare för att installera programvara. – (inget suffix för körbar bild, .o för objektfiler, .dylib och .bundle för delade objektfiler) Mach-baserade system, särskilt inbyggda format av macOS, iOS, watchOS och tvOS (.NLM) – den ursprungliga 32- bitbinärer kompilerade för Novells NetWare-operativsystem (version 3 och nyare) (.EXE – används vid multitasking ("europeisk") MS-DOS 4.0, 16-bitars Microsoft Windows och OS/2) – olänkade objektfiler direkt från kompilator
        • Obb – a fil som utvecklare skapar tillsammans med några APK-paket för att stödja applikationen. (.EXE, – används i Microsoft Windows och vissa andra system) – (klassiskt Mac OS för PowerPC-program som är kompatibla med macOS via en klassisk (Mac OS X) emulator) – används i Microsofts operativsystem tillsammans med en DLL-fil för att lagra programresurser – Körbar som används för S1ES-inlärningssystem.
        • .so – delat bibliotek, vanligtvis ELF
        • Value Added Process (.VAP) – de inbyggda 16-bitars binärfilerna kompilerade för Novells NetWare-operativsystem (version 2, NetWare 286, Advanced NetWare, etc.) – arkiv för Java-webbapplikationer – Xbox körbar
        • .XAP – Windows Phone-paket – (inget suffix för körbar bild, .o för objektfiler, .a för delade objektfiler) utökad COFF, används i AIX – Xbox 360 körbar
        • Objekttillägg
            – Visual Basic-tillägg – Objektkontrolltillägg – Windows Type Library
          • – Enhetsoberoende format
          • EGT – Universal Document kan användas för att lagra CSS-typstilar (*.egt) – Portable Document Format (.ps, .ps.gz) – Microsoft Access Report Snapshot
          • Konfigurationer, Metadata
              – Cascading Style Sheets
          • XSLT, XSL – XML-formatmall (.xslt, .xsl)
          • TPL – webbmall (.tpl)
            • MSG – Aktivitetshanteraren i Microsoft Outlook
            • ORG – Lotus Organizer PIM-paket
            • PST, OST – Microsoft Outlook e-postkommunikation
            • SC2 – Microsoft Schedule+ kalender
            • GSLIDES – Google Drive-presentation
            • KEY, KEYNOTE – Apple Keynote-presentation
            • OBS – Mathematica Bildspel
            • NBP – Mathematica Player bildspel
            • ODP – OpenDocument Presentation
            • OTP – OpenDocument Presentation mall
            • PEZ – Prezi Desktop Presentation
            • POT – Microsoft PowerPoint-mall
            • PPS – Microsoft PowerPoint Show
            • PPT – Microsoft PowerPoint-presentation
            • PPTX – Office Open XML-presentation
            • PRZ – Lotus Freelance Graphics
            • SDD – StarOffices StarImpress
            • SHF – ThinkFree Show
            • SHOW – Haansoft(Hancom) Presentationsmjukvarudokument
            • SHW – Skapa bildspel från Corel Presentations
            • SLP – Logix-4D Manager Visa kontrollprojekt
            • SSPSS – SongShow Plus Bildspel
            • STI – OpenOffice.org XML (föråldrad) presentationsmall
            • SXI – OpenOffice.org XML-presentation (föråldrad).
            • THMX – Microsoft PowerPoint temamall
            • SE – Dataton Watchout-presentation

            Filformat som används för hantering av bibliografisk information (citat).

              (Flexible Image Transport System) – standarddataformat för astronomi (.fits) – ett lagringsformat för visualisering utvecklat vid Lawrence Livermore National Laboratory – spektroskopisk data – binärt format för strukturerad data – Electro-Optic Space Situational Awareness format
            • OST (Open Spatio-Temporal) – utökningsbara, huvudsakligen bilder med relaterad data, eller bara ren data avsedd som ett öppet alternativ för mikroskopbilder – röntgenkristallografi voxels (elektrondensitet) – voxlar i kryo-elektronmikroskopi – spektroskopiska data med en optisk/infraröd övergång per rad i ASCII-filen (.hit)
            • .root – hierarkiskt plattformsoberoende komprimerat binärt format som används av ROOT – ett plattformsoberoende, precisionsbevarande binärt data I/O-format som kan hantera stora, flerdimensionella arrayer.
            • MYD – Everfine LEDSpec mjukvarufil för LED-mätningar

            Redigera flera domäner

              – Vanligt nätverksdataformat
            • HDR, [HDF], h4 eller h5 – Hierarkiskt dataformat – (Structured Data Exchange Format)
            • CDF – Common Data Format – CFD General Notation System – Full-Metadata Format

            Meteorologi Redigera

              – Rutnät i binärt, WMO-format för vädermodelldata – WMO-format för väderobservationsdata – UK Met Office-format för vädermodelldata
            • NASA-Ames – Enkelt textformat för observationsdata. Används först i flygplansstudier av atmosfären.

            Kemi Edit

            Matematik Edit

            Biologi Redigera

            • Molekylärbiologi och bioinformatik:
              • AB1 – I DNA-sekvensering, kromatogramfiler som används av instrument från Applied Biosystems
              • ACE – Ett sekvensmonteringsformat
              • ASN.1 – Abstract Syntax Notation One, är ett datarepresentationsformat för International Standards Organization (ISO) som används för att uppnå interoperabilitet mellan plattformar. NCBI använder ASN.1 för lagring och hämtning av data såsom nukleotid- och proteinsekvenser, strukturer, genom och PubMed-poster.
              • BAM – Binary Alignment/Map-format (komprimerat SAM-format)
              • BCF – Binärt komprimerat VCF-format
              • BED – webbläsarens utdragbara visningsformat används för att beskriva gener och andra egenskaper hos DNA-sekvenser
              • CAF – Common Assembly Format for sekvensmontering – komprimerat filformat för lagring av biologiska sekvenser anpassade till en referenssekvens
              • DDBJ – Det platta filformatet som används av DDBJ för att representera databasposter för nukleotid- och peptidsekvenser från DDBJ-databaser.
              • EMBL – Det platta filformatet som används av EMBL för att representera databasposter för nukleotid- och peptidsekvenser från EMBL-databaser.
              • FASTA – FASTA-formatet, för sekvensdata. Ibland även ges som FNA eller FAA (Fasta Nucleic Acid eller Fasta Amino Acid).
              • FASTQ – FASTQ-formatet, för sekvensdata med kvalitet. Ibland även ges som KVAL.
              • GCPROJ – Genome Compiler-projektet. Avancerat format för genetisk data som ska designas, delas och visualiseras.
              • GenBank – Det platta filformatet som används av NCBI för att representera databasposter för nukleotid- och peptidsekvenser från GenBank- och RefSeq-databaserna
              • GFF – Formatet Allmänt används för att beskriva gener och andra egenskaper hos DNA, RNA och proteinsekvenser
              • GTF – Genöverföringsformatet används för att hålla information om genstruktur
              • MAF – Multiple Alignment Format lagrar flera justeringar för helgenom till helgenomjämförelser [4]
              • NCBI ASN.1 – Strukturerat ASN.1-format som används vid National Center for Biotechnology Information för DNA- och proteindata
              • NEXUS – Nexus-filen kodar blandad information om genetiska sekvensdata i ett blockstrukturerat format
              • NeXML–XML-format för fylogenetiska träd
              • NWK – Newick-trädformatet är ett sätt att representera grafteoretiska träd med kantlängder med hjälp av parenteser och kommatecken och användbart för att hålla fylogenetiska träd.
              • PDB – strukturer av biomolekyler deponerade i Protein Data Bank, används också för att utbyta protein- och nukleinsyrastrukturer
              • PHD – Phred-utgång, från basprogramvaran Phred
              • PLN – Protein Line Notation används i proteax mjukvaruspecifikation – Sequence Alignment Map-format, i vilket resultaten från 1000 Genomes Project kommer att släppas
              • SBML – System Biology Markup Language används för att lagra biokemiska nätverksberäkningsmodeller
              • SCF – Staden-kromatogramfiler som används för att lagra data från DNA-sekvensering
              • SFF – Standard Flowgram Format
              • SRA – format som används av National Center for Biotechnology Information Short Read Archive för att lagra DNA-sekvensdata med hög genomströmning
              • Stockholm – Stockholmsformatet för att representera flera sekvensanpassningar
              • Swiss-Prot – Det platta filformatet som används för att representera databasposter för proteinsekvenser från Swiss-Prot-databasen
              • VCF – Variant Call Format, en standard skapad av 1000 Genomes Project som listar och kommenterar hela samlingen av mänskliga varianter (med undantag för cirka 1,6 miljoner varianter).

              Biomedicinsk bildbehandling Redigera

                (DICOM) (.dcm) (NIfTI)
                • .nii – stil med en fil (kombinerad data och metadata).
                  • .nii.gz – gzip-komprimerad, används transparent av viss programvara, särskilt FMRIB Software Library (FSL)
                  • .gii – enkelfils (kombinerad data och metadata) stil NIfTI-avkomma för hjärnytadata
                  • .MGH – okomprimerad
                  • .MGZ – zip-komprimerad

                  Biomedicinska signaler (tidsserier) Redigera

                  • ACQ – AcqKnowledge-format för Windows/PC från Biopac Systems Inc., Goleta, CA, USA
                  • ADICHT – LabChart-format från ADInstruments Pty Ltd, Bella Vista NSW, Australien – The BCI2000 project, Albany, NY, USA
                  • BDF – BioSemi-dataformat från BioSemi B.V. Amsterdam, Nederländerna
                  • BKR – EEG-dataformatet utvecklat vid University of Technology Graz, Österrike
                  • CFWB – Diagramdataformat från ADInstruments Pty Ltd, Bella Vista NSW, Australien
                  • DICOM – Waveform En förlängning av Dicom för att lagra vågformsdata
                  • ecgML – Ett märkningsspråk för datainsamling och analys av elektrokardiogram
                  • EDF/EDF+ – Europeiskt dataformat
                  • FEF – Filutbytesformat för vitala tecken, CEN TS 14271
                  • GDF v1.x – Det allmänna dataformatet för biomedicinska signaler, version 1.x v2.x – Det allmänna dataformatet för biomedicinska signaler, version 2.x
                  • HL7aECG – Health Level 7 v3 kommenterat EKG
                  • MFER – kodningsregler för medicinsk vågform
                  • OpenXDF – Open Exchange Data Format från Neurotronics, Inc., Gainesville, FL, USA
                  • SCP-ECG – Standard Communication Protocol for Computer assisted electrocardiography EN1064:2007
                  • SIGIF – Ett digitalt SIGnal Interchange Format med tillämpning inom neurofysiologi
                  • WFDB – Format för Physiobank – eXtensible Data Format

                  Andra biomedicinska format Redigera

                    (HL7) – ett ramverk för utbyte, integration, delning och hämtning av hälsoinformation elektroniskt – en familj av datautbytesformat för medicinska journaler

                  Biometriska format Redigera

                    – Common Biometric Format, baserat på CBEFF 2.0 (Common Biometric ExFramework). – Extended Biometric Format, baserat på CBF men med S/MIME-krypteringsstöd och semantiska tillägg – XML Common Biometric Format, baserat på XCBF 1.1 (OASIS XML Common Biometric Format) – XML Extended Biometric Format, baserat på CBFX men med W3C XML Encryption-stöd och semantiska tillägg
                  • ADB – Ada body
                  • ADS – Ada-specifikation
                  • AHK – AutoHotkey-skriptfil
                  • APPLESCRIPT- applescript – se SCPT
                  • AS – Adobe FlashActionScript-fil
                  • AU3 – AutoIt version 3
                  • BAT – Batchfil
                  • BAS – QBasic & QuickBASIC
                  • BTM — Batchfil
                  • KLASS — Kompilerad Java-binär
                  • CLJS – ClojureScript
                  • CMD – Batchfil
                  • Kaffe – CoffeeScript
                  • C – C
                  • CPP – C++
                  • CS - C#
                  • INO – Arduino sketch (program)
                  • ÄGG – Kyckling
                  • EGT – EGT Asterisk Application Source File, EGT Universal Document
                  • ERB – Embedded Ruby, Ruby on Rails Script File
                  • Heja heja
                  • HTA – HTML-applikation
                  • IBI – Icarus script
                  • ICI – ICI
                  • IJS – J script
                  • .ipynb – IPython Notebook
                  • ITCL – Itcl
                  • JS – JavaScript och JScript
                  • JSFL – Adobe JavaScript-språk
                  • .kt - Kotlin
                  • LUA – Lua
                  • M – Mathematica-paketfil
                  • MRC – mIRC Script
                  • NCF – NetWare Command File (skript för Novells NetWare OS)
                  • NUC – sammanställt script
                  • NUD – C++ Extern modul skriven i C++
                  • NÖT – Ekorre
                  • O — Kompilerad och optimerad C/C++ binär
                  • pde – Processing (programmeringsspråk), Processing script
                  • PHP – PHP
                  • PHP? – PHP (? = versionsnummer)
                  • PL – Perl
                  • PM – Perl-modul
                  • PS1 – Windows PowerShell-skalskript
                  • PS1XML – Windows PowerShell-format och typdefinitioner
                  • PSC1 – Windows PowerShell-konsolfil
                  • PSD1 – Windows PowerShell-datafil
                  • PSM1 – Windows PowerShell-modulfil
                  • PY – Python
                  • PYC – Python-bytekodfiler
                  • PYO – Python
                  • R – R-skript
                  • r – REBOL-skript
                  • RB – Ruby
                  • RDP – RDP-anslutning
                  • röd – Röda manus
                  • RS – Rust (programmeringsspråk)
                  • SB2/SB3 – Scratch
                  • SCPT – Applescript
                  • SCPTD – Se SCPT.
                  • SDL – State Description Language
                  • SH – Skalskript
                  • SYJS – SyMAT JavaScript
                  • SYPY – SyMAT Python
                  • TCL – Tcl
                  • TNS – Ti-Nspire kod/fil
                  • VBS – Visual Basic Script
                  • XPL – XPoc-skript/pipeline
                  • ebuild – Gentoo linuxs portage-paket.

                  Autentisering och allmänna krypteringsformat listas här.

                  • OpenPGP Message Format – används av Pretty Good Privacy, GNU Privacy Guard och annan OpenPGP-programvara kan innehålla nycklar, signerad data eller krypterad data kan vara binär eller text ("ASCII armored")

                  Certifikat och nycklar Redigera

                  • GXK – Galaxkey, en krypteringsplattform för auktoriserad, privat och konfidentiell e-postkommunikation [citat behövs] privat nyckel (.ssh) – Secure Shellprivate-nyckelformat genererat av ssh-keygen eller konverterat från PPK med PuTTYgen[15][16][17] offentlig nyckel (.pub) – Secure Shellpublic-nyckelformat genererat av ssh-keygen eller PuTTYgen [15][16][17] privat nyckel (.ppk) – Säker Shellprivat nyckel, i formatet som genereras av PuTTYgen istället för formatet som används av OpenSSH[15][16][17]
                  • nSign public key (.nSign) - nSign public key i ett anpassat format [18]

                  X.509 Redigera

                    (.cer, .crt, .der) – lagrar certifikat SignedData (.p7b, .p7c) – visas vanligtvis utan huvuddata, bara certifikat eller listor för återkallelse av certifikat (CRL) (.p12, .pfx) – kan lagra offentliga certifikat och privata nycklar
                • PEM – Privacy-enhanced Electronic Mail: fullformat används inte i stor utsträckning, men används ofta för att lagra Distinguished Encoding Rules i Base64-format
                • PFX – Microsofts föregångare till PKCS#12
                • Krypterade filer Redigera

                  Det här avsnittet visar filformat för krypterad allmän data, snarare än ett specifikt programs data.

                  • AXX – Krypterad fil, skapad med AxCrypt – En krypterad CAB, skenbart för att skydda e-postbilagor
                  • TC – Virtuell krypterad diskbehållare, skapad av TrueCrypt
                  • KODE – Krypterad fil, skapad med KodeFile
                  • nSignE - En krypterad privat nyckel, skapad av nSign [18]

                  Lösenordsfiler Redigera

                  Lösenordsfiler (ibland kallade nyckelringsfiler) innehåller listor över andra lösenord, vanligtvis krypterade.

                  • BPW – Krypterad lösenordsfil skapad av Bitser lösenordshanterare
                  • KDB – KeePass 1-databas
                  • KDBX – KeePass 2-databas
                  • ACQ – AcqKnowledge-format för Windows/PC från Biopac
                  • ADICHT – LabChart-format från ADInstruments
                  • BKR – EEG-dataformatet utvecklat vid University of Technology Graz
                  • BDF, CFG – Konfigurationsfil för Comtrade-data
                  • CFWB – Sjökortsdataformat från ADInstruments
                  • DAT – Rådatafil för Comtrade-data
                  • EDF – Europeiskt dataformat – Filutbytesformat för vitala tecken – Allmänna dataformat för biomedicinska signaler
                  • GMS – Gesture And Motion Signal-format
                  • IROCK – intelliRock Sensor Data File Format – Medicinsk vågformsformat kodningsregler
                  • SAC – Seismic Analysis Code, jordbävningsseismologidataformat [19] – Standard Communication Protocol for Computer assisted electrocardiography
                  • SEED, MSEED – Standard för utbyte av jordbävningsdata, seismologiska data och sensormetadata [20] – Reflektionsseismologidataformat
                  • SIGIF – SIGnal Interchange Format
                  • WIN, WIN32 – NIED/ERI seismiskt dataformat (.cnt) [21]

                  Förlustfri ljudredigering

                  Okomprimerad redigering

                    – Commodore-Amiga 8-bitars ljud (vanligtvis i en IFF-behållare) – Commodore-Amiga 16-bitars ljud (vanligtvis i en IFF-behållare), AIF, AIFC – Audio Interchange File Format – Enkelt ljudfilformat introducerat av Sun Microsystems – Broadcast Wave Format, en förlängning av WAVE – Compact Disc Digital Audio – Direct Stream Digital ljudfil, används även i Super Audio CD – Raw-exempel utan någon header eller synkronisering – Microsoft Wave

                  Komprimerad redigering

                  • RA, RM – RealAudio-format – Gratis förlustfri codec för Ogg-projektet
                  • LA – Förlustfritt ljud
                  • PAC – LPAC
                  • APE – Monkey's Audio
                  • OFR, OFS, OFF – OptimFROG
                  • RKA – RKAU
                  • SHN – Förkorta
                  • TAK – Toms förlustfria ljudkompressor [22]
                  • THD – Dolby TrueHD – Gratis förlustfri ljudcodec (True Audio)
                  • WV – WavPack
                  • WMA – Windows Media Audio 9 Lossless
                  • BRSTM – Binary Revolution Stream [23]
                  • DTS, DTSHD, DTSMA – DTS (ljudsystem)
                  • AST – Nintendo Audio Stream
                  • AW – Nintendo Audio Sample används i förstapartsspel
                  • PSF – Portable Sound Format, PlayStation-variant (ursprungligen PlayStation Sound Format)

                  Förlustigt ljudredigering

                    – Används vanligtvis för Dolby Digital-spår – För GSM- och UMTS-baserade mobiltelefoner – MPEGLayer 1 – MPEGLayer 2Layer 3
            • SPX – Speex (Ogg-projekt, specialiserat för röst, låga bithastigheter) – GSM Full Rate, ursprungligen utvecklad för användning i mobiltelefoner
            • WMA – Windows Media Audio – Avancerad ljudkodning (vanligtvis i en MPEG-4-behållare) – Musepack – Yamaha TwinVQ – Ljudfil (liknande MP3, med mer data lagrad i filen och något bättre komprimering designad för användning med OtsLabs OtsAV)
            • SWA – Macromedia Shockwave Audio (Samma komprimering som MP3 med ytterligare rubrikinformation specifik för Macromedia Director
            • VOX – Dialogisk ADPCM digitaliserad röst med låg samplingsfrekvens
            • VOC – Creative LabsSoundblaster Creative Voice 8-bitars & 16-bitars Utdataformat för RCA-ljudinspelare
            • DWD – DiamondWare digitaliserad
            • SMP – Turtlebeach SampleVision – Ogg Vorbis
            • Spårningsmoduler och relaterade redigering

                – Soundtracker och Protracker sample och melodimoduler
              • MT2 – MadTracker 2-modul – Scream Tracker 3-modul – Fast Tracker-modul – Impulse Tracker-modul
              • NSF – NES ljudformat
              • MID, MIDI – Standard MIDI-fil oftast bara noter och kontroller men ibland även sample dumps (.mid, .rmi)
              • FTM – FamiTracker Project-fil
              • BTM – BambooTracker Project-fil

              Notfiler Redigera

              • ABC – ABC Notation noter fil
              • DARMS – DARMS-filformat, även känt som Ford-Columbia-formatet
              • ETF – Enigma Transportation Format övergivet notutbytesformat
              • GP* – Guitar Pro noter och tabulaturfil
              • KERN – Kern File Format notfil
              • LY – LilyPond notfil
              • MEI – Music Encoding Initiative filformat som försöker koda alla musiknoter
              • MUS, MUSX – Finale notfil
              • MXL, XML – MusicXML standardformat för notutbyte
              • MSCX, MSCZ – MuseScore notfil
              • SMDL – Standardmusikbeskrivning Språk notfil
              • SIB – Sibelius notfil

              Andra filformat som hör till ljudredigering

              • NIFF – Notation Interchange File Format
              • PTB – Fliken Power Tab Editor
              • ASF – Advanced Systems Format
              • CUST – DeliPlayer anpassat ljudformat
              • GYM – GenesisYM2612 logg – Jam-musikformat
              • MNG – Bakgrundsmusik till spelserien Creatures, med start från Creatures 2
              • RMJ – RealJukebox Media används för RealPlayer
              • SID – Ljudgränssnittsenhet – Commodore 64 instruktioner för att spela SID-musik och ljudeffekter – Super NES ljudformat
              • TXM – Track yx media – Står för "Video Game Music", logga för flera olika marker
              • YM – Atari ST/Amstrad CPC YM2149 ljudchipsformat
              • PVD – Portable Voice Document som används för Oaisys & Mitel samtalsinspelningar
              • AIMPPL – AIMP spellistformat
              • ASX – Advanced Stream Redirector
              • RAM – Real Audio Metafile Endast för RealAudio-filer.
              • XPL – HDi-spellista
              • XSPF – XML Shareable Playlist Format
              • ZPL – Xbox Music (tidigare Zune) Spellistformat från Microsoft – Multimediaspellistfil – Multimediaspellista, ursprungligen utvecklad för användning med museArc
              • ALS – Ableton Live-set
              • ALC – Ableton Live-klipp
              • ALP – Ableton Live-paket
              • ATMOS, AUDIO, METADATA – Dolby Atmos Rendering och Mastering relaterad fil
              • AUP – Audacity-projektfil
              • BAND – GarageBand-projektfil
              • CEL – Adobe Audition loop-fil (Cool Edit Loj)
              • HLR – SteinbergCubase projektfil
              • CWP – Cakewalk Sonar projektfil
              • DRM – SteinbergCubase trumfil
              • DMKIT – Image-Lines Drumaxx trumset-fil
              • ENS – Native Instruments Reaktor Ensemble
              • FLP – Image LineFL Studio projektfil
              • GRIR – Native Instruments Komplete Guitar Rig Impulse Response
              • LOGIC – Logic Pro X-projektfil
              • MMP – LMMS-projektfil (alternativt MMPZ för komprimerade format)
              • MMR – MAGIX Music Maker-projektfil
              • MX6HS – Mixcraft 6 Home Studio-projektfil
              • NPR – SteinbergNuendo projektfil
              • OMF, OMFI – Open Media Framework Interchange OMFI efterträder OMF (Open Media Framework)
              • RIN – Soundways RIN-M-fil som innehåller ljudinspelningsdeltagares krediter och låtinformation
              • RPP, RPP-BAK – REAPER projektfil
              • REAPEAKS – REAPER peak (vågformscache) fil
              • SES – Adobe Audition multitrack sessionsfil
              • SFK – Sound Forge waveform cache-fil
              • SFL – Sound Forge ljudfil
              • SNG – MIDI-sekvensfil (MidiSoft, Korg, etc.) eller n-Track Studio-projektfil
              • STF – StudioFactory projektfil. Den innehåller alla nödvändiga patchar, samplingar, spår och inställningar för att spela upp filen
              • SND – Akai MPC ljudfil
              • SYN – SynFactory-projektfil. Den innehåller alla nödvändiga patchar, samplingar, spår och inställningar för att spela upp filen
              • UST – Utau Editor-sekvens exklusive wave-fil
              • VCLS – VocaListener-projektfil
              • VPR – Vocaloid 5 Editor-sekvens exklusive wave-fil
              • VSQ – Vocaloid 2 Editor-sekvens exklusive wave-fil
              • VSQX – Vocaloid 3 & 4 Editorsekvens exklusive wave-fil
              • ADA, ADB, 2.ADA – Ada (kropp) källa
              • ADS, 1.ADA – Ada (specifikation) källa
              • ASM, S – Assembly språkkälla
              • BAS – BASIC, FreeBASIC, Visual Basic, BASIC-PLUS källa, [13]PICAXE basic
              • BB – Blitz Basic Blitz3D
              • BMX – Blitz Basic BlitzMax
              • C – C källa
              • CLJ – Clojure källkod
              • CLS – Visual Basic-klass
              • COB, CBL – COBOL-källa
              • CPP, CC, CXX, C, CBP – C++ källa
              • CS – C#-källa
              • CSPROJ – C#-projekt (Visual Studio .NET)
              • D – D källa
              • DBA – DarkBASIC-källa
              • DBPro123 – DarkBASIC Professional-projekt
              • E – Eiffelkälla
              • EFS – EGT Forever Source File
              • EGT – EGT Asterisk källfil, kan vara J, C#, VB.net, EF 2.0 (EGT Forever)
              • EL – Emacs Lisp-källa
              • FOR, FTN, F, F77, F90 – Fortran-källa
              • FRM – Visual Basic-formulär
              • FRX – Visual Basic-formulärstash-fil (binär formulärfil)
              • FTH – Fjärde källan
              • GED – Game Maker Extension Redigerbar fil från och med version 7.0
              • GM6 – Game Maker Redigerbar fil från och med version 6.x
              • GMD – Game Maker Redigerbar fil upp till version 5.x
              • GMK – Game Maker Redigerbar fil från och med version 7.0
              • GML – Game Maker Language skriptfil
              • GO – Gå källa
              • H – C/C++ rubrikfil
              • HPP, HXX – C++ rubrikfil
              • HS – Haskell källa
              • I – SWIG-gränssnittsfil
              • INC – Turbo Pascal ingår källa
              • JAVA – Java-källa
              • L – lex källa
              • LGT – Logtalk-källa
              • LISP – Vanlig Lisp-källa
              • M – Objective-C-källa
              • M – MATLAB
              • M – Mathematica
              • M4 – m4 källa
              • ML – Standard ML och OCaml källa
              • MSQR – M² källfil, skapad av Mattia Marziali
              • N – Nemerle källa
              • OBS – Nuclear Basic source
              • P – Parserkälla
              • PAS, PP, P – Pascal-källa (DPR för projekt)
              • PHP, PHP3, PHP4, PHP5, PHPS, Phtml – PHP-källa
              • PIV – Pivot stickfigure-animator
              • PL, PM – Perl
              • PLI, PL1 – PL/I
              • PRG – Ashton-Tate dbII, dbIII och dbIV, db, db7, clipper, Microsoft Fox och FoxPro, harbour, xharbour och Xbase
              • PRO – IDL
              • POL – Apcera Policy Language doclet
              • PY – Python-källa
              • R – R källa
              • RÖD – Röd källa
              • RÖD – Röd/Systemkälla
              • RB – Rubinkälla
              • RESX – Resursfil för .NET-applikationer
              • RC, RC2 – Resursskriptfiler för att generera resurser för .NET-applikationer
              • RKT, RKTL – Racketkälla
              • SCALA – Scala-källa
              • SCI, SCE – Scilab
              • SCM – Schemekälla
              • SD7 – Seed7-källa
              • SKB, SKC – Sage Retrieve 4GL Common Area (Main and Amended backup)
              • SKD – Sage Retrieve 4GL Database
              • SKF, SKG – Sage Retrieve 4GL File Layouts (Huvud och ändrad säkerhetskopia)
              • SKI – Sage Retrieve 4GL Instruktioner
              • SKK – Sage Retrieve 4GL Report Generator
              • SKM – Sage Retrieve 4GL Menu
              • SKO – Sage Retrieve 4GL Program
              • SKP, SKQ – Sage Retrieve 4GL Print Layouts (Huvud och ändrad backup)
              • SKS, SKT – Sage Retrieve 4GL skärmlayouter (Huvud och ändrad säkerhetskopia)
              • SKZ – Sage Retrieve 4GL Security File
              • SLN – Visual Studio-lösning
              • SPIN – Spin source (för Parallax Propeller mikrokontroller)
              • STK – Stickfigure-fil för Pivot Stickfigure-animator
              • SWG – SWIG källkod
              • TCL – TCL-källkod
              • VAP – Visual Studio Analyzer-projekt
              • VB – Visual Basic.NET-källa
              • VBG – Visual Studio-kompatibel projektgrupp
              • VBP, VIP – Visual Basic-projekt
              • VBPROJ – Visual Basic .NET-projekt
              • VCPROJ – Visual C++-projekt
              • VDPROJ – Visual Studio-distributionsprojekt
              • XPL – XPoc-skript/pipeline
              • XQ – XQuery-fil
              • XSL – XSLT-formatmall
              • Y – yacc-källa
              • 123 – Lotus 1-2-3
              • AB2 – Abykus arbetsblad
              • AB3 – Abykus arbetsbok
              • AWS – Ability Spreadsheet
              • BCSV – Nintendos egenutvecklade tabellformat
              • CLF – ThinkFree Calc
              • CELL – Haansoft(Hancom) SpreadSheet mjukvarudokument
              • CSV – Kommaseparerade värden
              • GSHEET – Google Drive-kalkylblad
              • nummer – En Apple Numbers-kalkylbladsfil
              • gnumeric – Gnumericsspreadsheet, en gzipedXML-fil
              • LCW – Lucid 3-D
              • ODS – OpenDocument-kalkylblad
              • OTS – OpenDocument kalkylbladsmall
              • QPW – Quattro Pro kalkylblad
              • SDC – StarOffice StarCalc kalkylblad
              • SLK – SYLK (SYmbolic Link)
              • STC – OpenOffice.org XML (föråldrad) Kalkylbladsmall
              • SXC – OpenOffice.org XML (föråldrat) kalkylblad
              • TAB – tabbseparerade kolumner även TSV (Tab-Separated Values)
              • TXT – textfil
              • VC – Visicalc
              • WK1 – Lotus 1-2-3 upp till version 2.01
              • WK3 – Lotus 1-2-3 version 3.0
              • WK4 – Lotus 1-2-3 version 4.0
              • WKS – Lotus 1-2-3
              • WKS – Microsoft Works
              • WQ1 – Quattro Pro DOS-version
              • XLK – Säkerhetskopiering av Microsoft Excel-kalkylblad
              • XLS – Microsoft Excel-kalkylblad (97–2003)
              • XLSB – Microsoft Excel binär arbetsbok
              • XLSM – Microsoft Excel Macro-aktiverad arbetsbok
              • XLSX – Office Open XML-kalkylblad
              • XLR – Microsoft Works version 6.0
              • XLT – Microsoft Excel-kalkylbladsmall
              • XLTM – Microsoft Excel Macro-aktiverad kalkylbladsmall
              • XLW – Arbetsyta för Microsoft Excel-arbetsblad (version 4.0)
              • TSV – Tabbseparerade värden
              • CSV – Kommaseparerade värden – databanksformat tillgängligt för många ekonometriska applikationer – tillgängligt för många kalkylbladsapplikationer
                – mestadels avsett att innehålla redigeringsbeslut och renderingsinformation, men kan också innehålla komprimerad media essens – det vanligaste videoformatet för mobiltelefoner – Animerad GIF (enkel animering tills nyligen ofta undvikits på grund av patentproblem) – container (möjliggör alla former av komprimering att användas MPEG-4 är vanligt video i ASF-behållare kallas även Windows Media Video (WMV)) – Advanced Video Codec High Definition – container (ett skal, som gör att alla former av komprimering kan användas) (.bik) – Bink videofil. Ett videokomprimeringssystem utvecklat av RAD Game Tools
              • BRAW - ett videoformat som används av Blackmagics Ursa Mini Pro 12K-kameror. – aMSN webbkameraloggfil
              • COLLAB – Blackboard Collaborate-sessionsinspelning – videostandarddatafil (skapas automatiskt när vi försökte bränna som videofil på CD-skivan) – Windows XP Media Center Editions Windows Media Center-inspelade tv-format – Flash-video (kodad för att köras i en flash-animation)
              • M1V MPEG-1 – Video
              • M2V MPEG-2 – Video
              • NOA - sällsynt filmformat som används i vissa japanska eroges runt 2002
              • FLA – Macromedia Flash (för produktion)
              • FLR – (textfil som innehåller skript extraherade från SWF av en gratis ActionScript-dekompilator som heter FLARE)
              • SOL – Adobe Flash delat objekt ("Flash cookie")
              • STR – Sony Playstation video stream – videocontainerfilformat utvecklat av Apple (*.mkv) – Matroska är ett containerformat som gör att alla videoformat som MPEG-4 ASP eller AVC kan användas tillsammans med annat innehåll som undertexter och detaljerad metainformation
              • WRAP – MediaForge (*.wrap) – huvudsakligen enkel animering som innehåller PNG- och JPEG-objekt, ofta något mer komplex än animerad GIF (.mov) – behållare som gör det möjligt att använda någon form av komprimering Sorenson-codec är den vanligaste QTCH är filtypen för cachade video- och ljudströmmar (.mpeg, .mpg, .mpe)
              • THP – Nintendos eget film-/videoformat
                , förkortat "MP4" – multimediabehållare (används oftast för Sonys PlayStation Portable och Apples iPod)
                – Material Exchange Format (standardiserat omslagsformat för audio/visuellt material utvecklat av SMPTE)
              • ROQ – används av Quake 3 – Nullsoft Streaming Video (mediabehållare designad för att strömma videoinnehåll över Internet) – container, multimedia
              • RM – RealMedia – Samsung-videoformat för bärbara spelare – SAMI Caption-fil (HTML som undertext för filmfiler) (.smk) – Smacker-videofil. Ett videokomprimeringssystem utvecklat av RAD Game Tools – Macromedia Flash (för visning) – Windows Media Video (se ASF) – Windows Vistas och senare Windows Media Center-inspelade tv-format – rå videoformatupplösning (horisontell x vertikal) och exempelstruktur 4: 2:2 eller 4:2:0 måste vara känd explicit – videofilformat för webbvideo med HTML5

              Videoredigering, produktion Edit

              • BRAW – Blackmagic Design RAW-videofilnamn
              • FCP – Final Cut Pro-projektfil
              • MSWMM – Windows Movie Maker-projektfil
              • PPJ & PRPROJ– Adobe Premiere Pro videoredigeringsfil
              • IMOVIEPROJ – iMovie-projektfil
              • VEG & VEG-BAK – Sony Vegas projektfil
              • SUF – Sony kamerakonfigurationsfil (setup.suf) producerad av XDCAM-EX videokameror
              • WLMP – Windows Live Movie Maker-projektfil
              • KDENLIVE – Kdenlive-projektfil
              • VPJ – VideoPad-projektfil
              • MOTN – Apple Motion-projektfil
              • IMOVIEMOBILE – iMovie-projektfil för iOS-användare
              • WFP / WVE — WondershareFilmora Project
              • WLMP – Windows Live Movie Maker-projekt
              • PDS - Cyberlink PowerDirector-projekt

              Lista över vanliga filformat för data för videospel på system som stöder filsystem, oftast PC-spel.

              • Minecraft — filer som används av Mojang för att utveckla Minecraft
                • MCADDON – format som används av Bedrock Edition av Minecraft för tilläggsresurspaket för spelet
                • MCFUNCTION – format som används av Minecraft för att lagra funktioner
                • MCMETA – format som används av Minecraft för att lagra data för anpassningsbara texturpaket för spelet
                • MCPACK – format som används av Bedrock Edition av Minecraft för texturpaket i spelet med kompletta tillägg för spelet
                • MCR – format som används av Minecraft för att lagra data för spelvärldar före version 1.2
                • MCTEMPLATE – format som används av Bedrock Edition av Minecraft för världsmallar
                • MCWORLD – format som används av Bedrock Edition av Minecraft för spelvärldar
                • NBS – format som används av Note Block Studio, ett verktyg som kan användas för att göra notblockslåtar för Minecraft.
                • GBX - Allt användarskapat innehåll lagras i denna filtyp.
                  • REPLAY.GBX - Lagrar reprisen av ett lopp.
                  • CHALLENGE.GBX/MAP.GBX - Lagrar spår/kartor.
                  • SYSTEMCONFIG.GBX - Launcher info.
                  • TRACKMANIAVEHICLE.GBX - Info om en viss biltyp.
                  • VEHICLETUNINGS.GBX - Fordonsfysik.
                  • SOLID.GBX - En blockmodell.
                  • ITEM.GBX - Custom Maniaplanet-objekt.
                  • BLOCK.GBX - Custom Maniaplanet block.
                  • TEXTURE.GBX - Info om en textur som används i material.
                  • MATERIAL.GBX - Info om ett material såsom yttyp som används i Solids.
                  • TMEDCLASSIC.GBX - Blockinfo.
                  • GHOST.GBX - Spelarspöken i Trackmania och TrackMania Turbo.
                  • CONTROLSTYLE.GBX - Menyfiler.
                  • SCORES.GBX - Lagrar information om spelarens bästa tider.
                  • PROFILE.GBX - Lagrar en spelares information såsom deras inloggning.
                  • DEH – DeHackEd-filer för att mutera spelets körbara fil (inte officiellt en del av DOOM-motorn)
                  • DSG – Sparat spel
                  • LMP – En klump är en post i en DOOM-vadd.
                  • LMP – Sparad demoinspelning
                  • MUS – Musikfil (finns vanligtvis i en WAD-fil) – Datalagring (innehåller musik, kartor och texturer)
                    – (För binär rymdpartitionering) kompilerat kartformat – Rå kartformat som används av redaktörer som GtkRadiant eller QuArK
                • MDL/MD2/MD3/MD5 – Modell för ett föremål som används i spelet /PK2 – Datalagring /PK4 – används av Quake II-, Quake III Arena- respektive Quake 4-spelmotorerna för att lagra speldata, texturer etc. De är faktiskt .zip-filer.
                • .dat – inte specifik filtyp, ofta generisk tillägg för "data"-filer för en mängd olika applikationer
                  • används ibland för allmänna data som finns i .PK3/PK4-filerna
                  • .fontdat – en .dat-fil som används för att formatera spelteckensnitt
                  • U – Overkligt manusformat
                  • UAX – Animationsformat för Unreal Engine 2
                  • UMX – Kartformat för Unreal Tournament
                  • UMX – Musikformat för Unreal Engine 1
                  • UNR – Kartformat för Unreal
                  • UPK – Paketformat för tillagat innehåll i Unreal Engine 3
                  • USX – Ljudformat för Unreal Engine 1 och Unreal Engine 2
                  • UT2 – Kartformat för Unreal Tournament 2003 och Unreal Tournament 2004
                  • UT3 – Kartformat för Unreal Tournament 3
                  • UTX – Texturformat för Unreal Engine 1 och Unreal Engine 2
                  • UXX – Cacheformat dessa är filer som en klient laddat ner från servern (som kan konverteras till vanliga format)
                  • DMO – Spara spelet
                  • GRP – Datalagring
                  • MAP – Karta (vanligtvis konstruerad med BUILD.EXE)
                  • SV – Spara spelet
                  • ITM – Objektfil
                  • SQF – Format som används för allmän redigering
                  • SQM – Format som används för uppdragsfiler
                  • PBO – Binariserad fil som används för kompilerade modeller
                  • LIP – Format som skapas från WAV-filer för att skapa exakt läppsynkronisering i spelet för karaktärsanimationer.
                  • VMF – Valve Hammer Map editor rå kartfil
                  • VMX - Valve Hammer Map editor backup kartfil
                  • BSP – Source Engine kompilerad kartfil
                  • MDL – Source Engine-modellformat
                  • SMD – Source Engine okompilerat modellformat
                  • PCF – Source Engine-partikeleffektfil
                  • HL2 – Half-Life 2-sparformat
                  • DEM – Source Engine-demoformat
                  • VPK – Source Engine-paketformat
                  • VTF – Texturformat för källmotor
                  • VMT – Materialformat för källmotor.
                  • CGB - Pokemon Black and White/Pokemon Black 2 and White 2 C-Gear-skins.
                  • ARC - används för att lagra New Super Mario Bros. Wii-nivådata
                  • B – används för Grand Theft Auto-sparade spelfiler
                  • BOL – används för nivåer på Poing!PC
                  • DBPF – The Sims 2, DBPF, paket
                  • DIVA – Projekt DIVA-timinger, elementkoordinater, MP3-referenser, anteckningar, animationsposer och noter.
                  • ESM, ESP – Master- och plugin-dataarkiv för Creation Engine
                  • HAMBU - format som används av Aidan's Funhouse-spelet RGTW för att lagra kartdata [24]
                  • HE0, HE2, HE4 HE-spel Arkiv
                  • GCF – format som används av Steams innehållshanteringssystem för filarkiv
                  • IMG – format som används av Renderware-baserat Grand Theft Auto spel för datalagring
                  • LOVE – format som används av LOVE2D Engine [25]
                  • MAP – format som används av Halo: Combat Evolved för arkivkomprimering, Doom³ och olika andra spel
                  • MCA – format som används av Minecraft för att lagra data för spelvärldar [26]
                  • NBT – format som används av Minecraft för att lagra programvariabler tillsammans med deras (Java) typidentifierare
                  • OEC – format som används av OE-Cake för lagring av scendata
                  • OSB - osu! storyboard-data
                  • OSC - osu!stream kombinerad strömdata
                  • OSF2 - gratis osu!stream-låtfil
                  • OSR – osu! spela upp data
                  • OSU – OSU! beatmap-data
                  • OSZ2 - betald osu!stream-låtfil
                  • P3D – format för panda3d av Disney
                  • PLAGUEINC - format som används av Plague Inc. för att lagra anpassad scenarioinformation [27]
                  • POD – format som används av Terminal Reality
                  • RCT – Används för mallar och spara filer i RollerCoaster Tycoon-spel
                  • REP – används av Blizzard Entertainment för scenariorepriser i StarCraft. , DBPF (.dat, .SC4Lot, .SC4Model) – Alla spelplugins använder detta format, vanligtvis med olika filtillägg
                  • SMZIP – ZIP-baserat paket för StepMania-låtar, teman och announcer-paket.
                  • SOLITAIRETHEME8 - Ett solitaire-tema för Windows-patiens
                  • USLD – format som används av Unison Shift för att lagra nivålayouter.
                  • VVVVVV – format som används av VVVVVV
                  • CPS – format som används av The Powder Toy, Powder Toy spara
                  • STM – format som används av The Powder Toy, Powder Toy-stämpel
                  • PKG – format som används av Bungie för PC Beta of Destiny 2, för nästan alla spelets tillgångar.
                  • CHR – format som används av Team Salvato, för karaktärsfilerna i Doki Doki Literature Club!
                  • Z5 – format som används av Z-machine för berättelsefiler i interaktiv fiktion.
                  • scworld – format som används av Survivalcraft för att lagra sandlådevärldar.
                  • scskin – format som används av Survivalcraft för att lagra spelarskins.
                  • scbtex – format som används av Survivalcraft för att lagra blocktexturer.
                  • fängelse – format som används av Prison Architect för att rädda fängelser
                  • escape – format som används av Prison Architect för att rädda flyktförsök

                  Lista över de vanligaste filnamnstilläggen som används när ett spels ROM-bild eller lagringsmedium kopieras från en original läsminne (ROM)-enhet till ett externt minne som hårddisk för säkerhetskopiering eller för att göra spelet spelbart med en emulator . När det gäller kassettbaserad programvara, om det plattformsspecifika tillägget inte används används filnamnstilläggen ".rom" eller ".bin" vanligtvis för att klargöra att filen innehåller en kopia av innehållet i en ROM. ROM-, disk- eller bandbilder består vanligtvis inte av en fil eller ROM, snarare en hel fil eller ROM-struktur som finns i en fil på backupmediet. [28]

                  • A26 – Atari 2600 (.a26)
                  • A52 – Atari 5200 (.a52)
                  • A78 – Atari 7800 (.a78)
                  • LNX – Atari Lynx (.lnx)
                  • JAG,J64 – Atari Jaguar (.jag, .j64)
                  • ISO, WBFS, WAD, WDF – Wii och WiiU (.iso, .wbfs, .wad, .wdf)
                  • GCM, ISO – GameCube (.gcm, .iso)
                  • min - Pokémon mini (.min)
                  • NDS – Nintendo DS (.nds)
                  • 3DS – Nintendo 3DS (.3ds)
                  • CIA – Installationsfil (.cia)
                  • SE – Game Boy (.gb) (detta gäller den ursprungliga Game Boy och Game Boy Color)
                  • GBC – Game Boy Color (.gbc)
                  • GBA – Game Boy Advance (.gba)
                  • GBA – Game Boy Advance (.gba)
                  • SAV – Game Boy Advance sparade datafiler (.sav)
                  • SGM – Visual Boy Advance Save States (.sgm)
                  • N64, V64, Z64, U64, USA, JAP, PAL, EUR, BIN – Nintendo 64 (.n64, .v64, .z64, .u64, .usa, .jap, .pal, .eur, .bin)
                  • PJ – Project 64 Save States (.pj)
                  • NES – Nintendo Entertainment System (.nes)
                  • FDS – Famicom Disk System (.fds)
                  • JST – Jnes Save States (.jst)
                  • FC? – FCEUX Save States (.fc#, där # är vilket tecken som helst, vanligtvis ett tal)
                  • GG – Game Gear (.gg)
                  • SMS – Master System (.sms)
                  • SG – SG-1000 (.sg)
                  • SMD,BIN – Mega Drive/Genesis (.smd eller .bin)
                  • 32X – Sega 32X (.32x)
                  • SMC,078,SFC – Super NES (.smc, .078 eller .sfc) (.078 är för delade ROM, som är sällsynta)
                  • FIG – Super Famicom (japanska utgåvor är sällan .fig, ovanstående tillägg är vanligare)
                  • SRM – Super NES sparade datafiler (.srm)
                  • ZST – ZSNES Spara stater (.zst, .zs1-.zs9, .z10-.z99)
                  • FRZ – Snes9X Save States (.frz, .000-.008)
                  • PCE – TurboGrafx-16/PC Engine (.pce)
                  • NPC, NGP – Neo Geo Pocket (.npc, .ngp)
                  • NGC – Neo Geo Pocket Color (.ngc)
                  • VB – Virtual Boy (.vb)
                  • INT – Intellivision (.int)
                  • MIN – Pokémon Mini (.min)
                  • VEC – Vectrex (.vec)
                  • BIN – Odyssey² (.bin)
                  • WS – WonderSwan (.ws)
                  • WSC – WonderSwan Color (.wsc)
                  • TZX – ZX Spectrum (.tzx) (för exakta kopior av ZX Spectrum-spel)
                  • TAP – för bandbilder utan kopieringsskydd
                  • Z80,SNA – (för ögonblicksbilder av emulatorns RAM)
                  • DSK – (för diskbilder)
                  • TAP – Commodore 64 (.tap) (för bandbilder inklusive kopieringsskydd)
                  • T64 – (för bandbilder utan kopieringsskydd, betydligt mindre än .tap-filer)
                  • D64 – (för diskbilder)
                  • CRT – (för patronbilder)
                  • ADF – Amiga (.adf) (för 880K diskettbilder)
                  • ADZ – GZip-komprimerad version av ovanstående.
                  • DMS – Disk Masher System, som tidigare använts som ett diskarkiveringssystem som är inbyggt i Amiga, som också stöds av emulatorer.

                  Microsoft Virtual PC, Virtual Server Edit

                  • VFD – Virtual Floppy Disk (.vfd)
                  • VHD – virtuell hårddisk (.vhd)
                  • VUD – Virtual Undo Disk (.vud)
                  • VMC – Virtual Machine Configuration (.vmc)
                  • VSV – Virtual Machine Saved State (.vsv)

                  EMC VMware ESX, GSX, Workstation, Player Edit

                  • LOG – Virtual Machine Logfile (.log) , DSK – Virtual Machine Disk (.vmdk, .dsk)
                  • NVRAM – Virtual Machine BIOS (.nvram)
                  • VMEM – växlingsfil för virtuell maskin (.vmem)
                  • VMSD – Virtual Machine ögonblicksbild metadata (.vmsd)
                  • VMSN – ögonblicksbild av virtuell maskin (.vmsn)
                  • VMSS,STD – Virtual Machine avstängt tillstånd (.vmss, .std)
                  • VMTM – Teamdata för virtuell maskin (.vmtm)
                  • VMX,CFG – Virtuell maskinkonfiguration (.vmx, .cfg)
                  • VMXF – Virtual Machine-teamkonfiguration (.vmxf)

                  VirtualBox Redigera

                  • VDI – VirtualBox Virtual Disk Image (.vdi)
                  • Vbox-extpack – VirtualBox-förlängningspaket. (.vbox-extpack)

                  Parallels Workstation Edit

                  • HDD – Virtual Machine-hårddisk (.hdd)
                  • PVS – Virtual Machine-inställningar/konfiguration (.pvs)
                  • SAV – Sparat läge för virtuell maskin (.sav)

                  QEMU Edit

                  • COW – Copy-on-write
                  • QCOW – QEMU copy-on-write Qcow
                  • QCOW2 – QEMU copy-on-write – version 2 Qcow
                  • QED – QEMU förbättrat diskformat
                      – Document Type Definition (standard), MÅSTE vara offentlig och gratis (.html, .htm) – HyperText Markup Language (.xhtml, .xht) – eXtensible HyperText Markup Language (.mht, .mhtml) – Arkiverad HTML, lagra all data på en webbsida (text, bilder etc.) i en stor fil (.maff) – webbarkiv baserat på ZIP
                  • (.asp) – Microsoft Active Server Page – (.aspx) – Microsoft Active Server Page. NET – AOLserver Dynamic Page
              • BML – (.bml) – Better Markup Language (mall) – (.cfm) – ColdFusion – (.cgi)
              • iHTML – (.ihtml) – Inline HTML – (.jsp) JavaServer-sidor – (.las, .lasso, .lassoapp) – En fil skapad eller serverad med Lasso-programmeringsspråket
              • PL – Perl (.pl) – (.php, .php?, .phtml) – ? är versionsnummer (tidigare förkortat Personlig hemsida, ändrades senare till PHP: Hypertext Preprocessor) – (.shtml) – HTML med Server Side Includes (Apache) – (.stm) – HTML med Server Side Includes (Apache)
                • – (.atom, .xml) – Ett annat syndikeringsformat. – (.eml) – Format som används av flera stationära e-postklienter. – (.jsonld) – En JSON-baserad serialisering för länkad data. – (.kprx) – En XML-baserad serialisering för arbetsflödesdefinition genererad av K2. – (.ps) – En XML-baserad serialisering för testautomatiseringsskript som kallas PowerScripts för K2-baserade applikationer. – (.metalink, .met) – Ett format för att lista metadata om nedladdningar, såsom speglar, kontrollsummor och annan information. – (.rss, .xml) – Syndikeringsformat. – (.markdown, .md) – Syntax för vanlig textformatering, som populärt används för att formatera "readme"-filer.
                • Shuttle – (.se) – Ett annat lättviktigt märkningsspråk.
                • AXD – cookietillägg som finns i temporär internetmapp
                • BDF – Binary Data Format – rådata från återställda block av oallokerat utrymme på en hårddisk
                • CBP – CD Box Labeler Pro, CentraBuilder, Code::Blocks Project File, Conlab Project
                • CEX – SolidWorks Enterprise PDM Vault-fil
                • COL – NintendoGameCube proprietär kollisionsfil (.col)
                • CREDX – CredX Dat-fil
                • DDB – Genererar kod för Vocaloid-sångares röst (se .DDI)
                • DDI – Vocaloidphoneme-bibliotek (japanska, engelska, koreanska, spanska, kinesiska, katalanska)
                • DUPX – DuupeChecks projektfil för databashanteringsverktyg
                • FTM – Family Tree Maker datafil
                • FTMB – Family Tree Maker backup-fil
                • GA3 – Graphical Analysis 3 (.ged) – (GEnealogical Data COMmunication) format för att utbyta släktforskningsdata mellan olika släktforskningsprogram
                • HLP – Windows hjälpfil
                • IGC – flygspår nedladdade från GPS-enheter i FAI:s föreskrivna format
                • INF – liknande format som INI-fil som används för att installera drivrutiner under Windows, bland annat. – JAM-meddelandebasformat för BBS:er
                • KMC – tester gjorda med KatzReviews MegaCrammer
                • KCL – NintendoGameCube/Wii proprietär kollisionsfil (.kcl)
                • LNK – MicrosoftWindows-format för hyperlänkar till körbara filer
                • LSM – LSMaker-skriptfil (program som använder .jpg i lager för att skapa specialeffekter speciellt utformade för att återge ljussvärd från Stjärnornas krig universum) (.lsm)
                • NARC – Arkivformat som används i Nintendo DS-spel.
                • OER – AU OER Tool, Open Educational Resource editor
                • PA – Används för att tilldela ljudeffekter till material i KCL-filer (.pa)
                • PIF – Används för att köra MS-DOS-program under Windows
                • POR – Så kallade "portabla" SPSS-filer, läsbara av PSPP
                • PXZ – Komprimerad fil för att utbyta mediaelement med PSALMO
                • RISE – Fil som innehåller RISE-genererad informationsmodellutveckling – Windows Screen Saver-fil
                • TOPC – TopicCrunch SEO Project-fil som innehåller nyckelord, domän och sökmotorinställningar (ASCII)
                • VPROJ – VSDC Video Editor-fil
                • XLF – Utah State University Extensible LADAR-format
                • XMC – Assisted contact lists format, baserat på XML och används på dagis och skolor
                • ZED – My Heritage Family Tree – en textfil som innehåller en DNS-zon

                Markörer Redigera

                Allmänna dataformat Redigera

                Dessa filformat är ganska väl definierade av långvarig användning eller en allmän standard, men innehållet i varje fil är ofta mycket specifikt för viss programvara eller har utökats med ytterligare standarder för specifika användningar.

                Textbaserad redigering

                • CSV – kommaseparerade värden
                • HTML – hypertextmarkeringsspråk
                • CSS – cascading style sheets – en konfigurationstextfil vars format är väsentligt lika mellan applikationer – JavaScript Object Notation är ett öppet använt dataformat som nu används av många språk, inte bara JavaScript
                • TSV – tabbseparerade värden – ett öppet dataformat – ett öppet dataformat – ett öppet textformat för tekniska dokument som huvudsakligen används i programmeringsspråket Python (.md) – ett öppet lättviktigt märkningsspråk för att skapa enkel men rik text, ofta använt att formatera README-filer – ett öppet, mänskligt läsbart markeringsdokumentformat som semantiskt motsvarar DocBook

                Generiska filtillägg Redigera

                Det här är filnamnstillägg och breda typer som ofta återanvänds med olika format eller inget specifikt format av olika program.


                Del III – Hur är det med antibiotika?

                Fager var ett intressant fenomen som inte fick lika stor uppmärksamhet på grund av utvecklingen av antibiotika. Kolera blev lätt att behandla med antibiotika och tanken på att använda fager för att kontrollera infektion förlorade fördel. Antibiotika fungerar genom att skada delar av cellen som människor inte har, till exempel cellväggen. Vissa bakterier är naturligt resistenta mot antibiotika, vilket utgör ett problem för långvarig användning. När antibiotika används är det mer sannolikt att de bakterier som är resistenta överlever. De reproducerar och skapar en ny generation som också är motståndskraftig. Med tiden förlorar antibiotika sin effektivitet. Ökningen av antibiotikaresistenta bakteriestammar är ett stort problem för dagens vetenskapsmän.

                Grafen visar resultatet av ett experiment där tillväxten av en bakteriepopulation övervakades över tid. Tillväxt övervakades genom att mäta kulturens grumlighet (ju grumligare en kultur, desto fler celler finns närvarande). Efter 1 timme delades bakterierna upp i 4 olika kolvar. Bakterierna i var och en av dessa kolvar utsattes för olika behandling (se nedan), och bakterierna inkuberades och deras tillväxt övervakades.


                13. Vilka behandlingar var minst effektiva? Vilka var de mest effektiva?

                14. Användning av antibiotika kan förkorta sjukdomsförloppet. Patienter kan ges antibiotika oralt utöver rehydreringsprotokoll. Patienter kan börja må bättre efter en dag, men de bör fortfarande ta antibiotika. Varför?

                15. Tror du att kolera kan bli resistent mot fager? Varför eller varför inte? Tänk i ditt svar på skillnaderna mellan fagterapi och antibiotika.

                Slutlig individuell uppsats: Tänk på titeln på detta fall. Formulera ett kostnadsfritt svar som besvarar frågan, med hjälp av detaljer från det här fallet. Det finns faktiskt flera svar, syntetisera de viktigaste punkterna i fallet.


                Koleratoxin

                Koleratoxin (CT eller CTX) är ett protein enterotoxin som utsöndras av giftiga arter av bakterien Vibrio cholerae [1] . CT är orsaken till kolera, ofta från smutsigt vatten. CT överförs mellan patienter via fekal-oral väg, därför finns det ofta i länder med dåliga sanitära förhållanden. Koleratoxinet påverkar epitelcellerna i tarmen genom att störa cellens signalväg, toxinet orsakar överaktivering av signalvägen som styr aktiviteten av kloridkanalproteiner. Toxinet aktiverar kloridkanalproteinerna för att öppna och tillåta förflyttning av kloridjoner ut ur cellen i frånvaro av signalmolekylen. CT kännetecknas av dess förmåga att orsaka svår diarré, vilket ofta leder till uttorkning [2]. Under extrema omständigheter kan kolera leda till döden.

                V. cholerae

                V. cholerae är en kommaformad, gramnegativ bakterie och har ett flagellum vid cellens pol. V. cholerae, känd för att ligga i dvala i vatten- och livsmedelsförråd som har förorenats av mänskliga exkrementer är ett problem för storskaliga utbrott [3] . En gång V. cholerae kommer in i sin mänskliga värd, driver bakterien sig själv genom ileums slemhinnor och fäster sig vid epitelslemhinnan [4]  frisätter CT och aktiverar på så sätt en kaskad av cellsignaleringsvägar som leder till massiv vätskeförlust från ileum och tolvfingertarmen [5] . V. cholerae utsöndrar enterotoxinet CT på ett mycket effektivt sätt med mer än 90 % av toxinet extracellulärt. CT, när den väl utsöndras i ett system, initierar sin toxiska verkan genom att binda till cellmembranreceptorer med hög affinitet som identifierats som gangliosid- eller GM1-receptorer [6].

                Toxinets struktur

                CT är en medlem av AB5-familjen av toxiner och består av subenheter, en alfapolypeptid och fem betapolypeptider som är associerade via icke-kovalenta bindningar [7]. A-subenheten som är belägen i mitten av toxinet medan de fem beta-subenheterna är arrangerade i en pentamerisk ring och ansvarar för att binda toxinet till en cells membran [8] , som väger 11 kDa vardera och är gjorda av en kedja på 103 aminosyror, binder till fem gangliosid GM1-receptorer på plasmamembranet och utlöser endocytos av toxinet, medan alfa-subenheten är uppbyggd av en A1- och A2-kedja, alfa-subenheten består av en kedja av 240 aminosyror. A1 är enzymatisk och gör det mesta av arbetet, väl inne i cellen. A2 är en förlängd alfaspiral som förbinder alfasubenheten med Beta-subenheten. Alfa-subenheten klyvs isär en gång inuti cellen via trypsin som bryter disulfidbindningarna mellan A1 och A2 [9] , vilket gör att A1-kedjan kan dissociera och börja sin katalytiska aktivitet, vilket lämnar A2-domänen som hade förankrat A1-kedjan till Beta-underenhet [10] .

                Infektionsmekanism

                Placeringen av CTX:s funktion finns i lumen i tunntarmen [11] ., där bakterien, i ett försök att infektera celler, V. cholerae producerar en invasin [12] . Mag-tarmkanalen (GI) är belagd med ett slemfoder i syfte att förhindra patogener som CT från att komma in i endotelcellerna i tarmslemhinnan [13] [14].

                Neuraminidas produceras av koleraceller som en invasion, neuraminidas är en del av en grupp enzymer som ansvarar för att ta bort kolhydraten sialinsyra [15]. från GI-cellers ytmembran åsidosätter detta GI-kanalens slemförsvar och gör att B-subenheten binder till glykolipiden monosialosylgangliosid (GM1): receptorn för CTX [16].

                När bindningen av B-subenheten är komplett med GM1 är rollen för denna del av CTX relativt fullständig. CTA1 kan därefter komma in i cellen och passera genom membranet.

                Hur CT orsakar sjukdom

                Efter toxinernas inträde i cellen och alfa-protomerklyvningen, transporteras A1 till det endoplasmatiska retikulumet (ER) där det associeras med disulfid-isomeras (PDI). Detta utlöser utvecklingen av A1-kedjan och gör det följaktligen möjligt för den att kapa ER-associationsnedbrytningsmekanismen för att komma in i cytosolen genom retrotranslokation. Normalt är proteiner som kommer in i cytosolen på detta sätt ubiquitinerade och bryts sedan ned av proteasomen, men A1-subenheten undviker detta öde genom snabb återveckning [17].

                Enzymet katalyserar sedan överföringen av ADP-ribos från intracellulär NAD+ [18]. till G-proteinets alfa-subenhet (stimulerande G-protein), vilket aktiverar den speciella subenheten av G-proteinet [19]. A1 kan nu ribosylera alfa-subenheten av ett G-protein associerat med en tarmepitelcell, vilket förhindrar hydrolys av GTP bundet till samma G-protein. Detta låser G-proteinet i ett aktivt tillstånd, vilket leder till obestämd stimulering av adenylylcyklas, vilket orsakar en ökning av cAMP-koncentrationen. Detta orsakar fosforylering och aktivering av cystisk fibros transmembrankonduktansregulator (CFTR-protein) vilket leder till det ATP-medierade utflödet av kloridjoner som pumpas ut ur enterocyten [20]. Detta gör att vatten, natrium och kalium lämnar cellen och kommer in i tarmens lumen, vilket leder till den svåra diarrén [21]. Detta beror på att vattenpotentialen drastiskt sänks i lumen på grund av utflödet av joner. Vatten rinner därför ut från epitelcellerna som omger tunntarmen och in i lumen.

                Behandling av kolera

                Orala rehydreringslösningar (ORS) används för att behandla kolera, på grund av deras förmåga att fylla på både förlorat vatten och elektrolyter som förloras genom utsöndring efter intag av koleratoxinet. Deras komponenter är osmotiskt lika dem i friskt mänskligt blod, kanske mest signifikant natrium och glukos. Detta beror på att natrium kan transporteras in i blodet via natrium-glukos cotransporter-proteinet på cellmembranen, vilket flyttar natrium ner i sin koncentrationsgradient.


                Mångfald, struktur och storlek hos N2O-producerande mikrobiella samhällen i jordar – vad är viktigt för deras funktion?

                Gesche Braker, Ralf Conrad, i Advances in Applied Microbiology, 2011

                A Ammoniak oxidator gemenskaper

                Den funktionella gruppen av ammoniakoxiderande bakterier (AOB) representeras av organismer anslutna till β- och γ-proteobakterier (Purkhold et al., 2000). Medan y-proteobakteriella AOB är marina Nitrosococcus spp., β-proteobakteriell AOB består av släktena Nitrosospira och Nitrosomonas (Prosser, 2007). Nitrosospira och Nitrosomonas spp. omfatta en monofyletisk grupp av organismer som tillhör minst nio distinkta linjer varav några är specifika för en given livsmiljö (Bernhard och Bollmann, 2010). Till exempel, även om det är mindre lätt att odla från jord än Nitrosomonas spp., Nitrosospira spp. (kluster 2, 3 och 4) representerar de vanligaste AOB-samhällena från terrestra livsmiljöer ( Bruns et al., 1999 Kowalchuk och Stephen, 2001 Stephen et al., 1996). Förmågan att oxidera ammoniak antogs länge uteslutande förekomma bland autotrofa bakteriella ammoniakoxidatorer (AOB), men arkeala ammoniakoxidatorer (AOA) har identifierats som nya aktörer i N-cykeln under de senaste 5 åren. Första beviset på att arkéer har den genetiska potentialen för ammoniakoxidation, det vill säga en amoA gen med homologi med dess bakteriella motsvarigheter, kom från analysen av Sargassohavet och jordmetagenomer (Treusch et al., 2005 Venter et al., 2004). Genomsekvenserna indikerade att respektive organismer var anslutna till den mesofila Crenarchaeota nyligen föreslagit som ny fil av Thaumarcheaota ( Brochier-Armanet et al., 2008 Spang et al., 2010). Under tiden bekräftades rena kulturer bära arkéer amoA, det är, Nitrosopumilus maritimus (Könneke et al., 2005) och Nitrososphaera gargensis ( Hatzenpichler et al., 2008). De amoA genen hittades också i arvsmassan hos oodlade Crenarchaeum symbiosum, symbionten av en marin svamp (Hallam et al., 2006). Nya omfattande datamängder understryker deras miljörelevans och visar att de är allestädes närvarande och utgör den dominerande fraktionen av ammoniakoxidationsmedel i många terrestra livsmiljöer ( Erguder et al., 2009 Leininger et al., 2006 ).

                De amoA genen kodar för en underenhet av nyckelenzymet i bakteriell och arkeal ammoniakoxidation, enzymet ammoniakmonooxygenas (AMO) som kodas av amoABC operon. AmoA är subenheten med platsen för ammoniakoxidation. Två till tre kopior av AMO-operonet finns i ammoniakoxidationsmedel som tillhör β-proteobakterier som alla är funktionella och upprätthåller tillväxt medan γ-proteobakterier innehåller endast en kopia ( Norton et al., 2002). AMO är ett mångsidigt enzym eftersom det inte bara oxiderar ammoniak utan även en rad andra substrat, till exempel CH4. Dessutom enzymet såväl som amoA genen visar likhet med partikelformigt CH4 monooxygenas och respektive gen pmoA (Arp och Stein, 2003). Intressant nog verkar AMO från heterotrofa nitrifierare dela partiella sekvenslikheter med AMO från autotrofa nitrifierare ( Hayatsu et al., 2008). De amoA genen har använts flitigt som en funktionell genmarkör för att studera bakteriella ammoniakoxidationsmedel ( Rotthauwe et al., 1997). Dess fylogeni överensstämmer i allmänhet med den för β-proteobakteriella ammoniakoxidationsmedel definierade baserat på 16S rRNA-gener (Aakra et al., 2001 Purkhold et al., 2000, 2003) och tillåter en specifik finskalig upplösning av närbesläktade populationer ( Rotthauwe et al., 1997). Förmodade homologer av amoABC förekommer även i ammoniakoxiderande archaea (AOA) även om de endast uppvisar låg likhet (38–51 % aminosyrasekvenslikhet) med deras bakteriella motsvarigheter (Könneke et al., 2005 ).

                Det andra steget, oxidationen av hydroxylamin till nitrit, katalyseras av hao genkodat hydroxylaminoxidoreduktas (HAO). Liknande amoABC, hao finns också i tre exemplar i ammoniakoxidationsmedel, däremot är detta enzym unikt för autotrofa AOB utan likhet med de som finns i heterotrofa nitrifierare (Jetten et al., 1997 Moir et al., 1996) och verkar sakna AOA (Walker et al., 2010 ).

                Förutom de enzymer som är involverade i oxidationen av ammoniak till nitrit, kan ammoniakoxiderande bakterier också innehålla enzymer involverade i nitritreduktion, vilket möjliggör denitrifiering av nitrifierare. Homologer av nirK och norB gener förekommer i Nitrosomonas spp. och Nitrosospira spp. såväl som i Nitrosococcus spp., arter som kan nitrifiera denitrifiering. Dessutom, nirK hittades även bland AOA ( Bartossek et al., 2010 Treusch et al., 2005). Men den nirK transkriptionskopienummer av AOA i jordar kopplades från denitrifieringsaktivitet (Bartossek et al., 2010), och inget genkodande NO-reduktas hittades genom genomsekvensering (Walker et al., 2010). Därför är det oklart om AOA kan producera N2O överhuvudtaget.


                Forskning som rapporteras i detta manuskript stöddes av National Library of Medicine vid National Institutes of Health under prisnummer G08LM010720. Innehållet är enbart författarnas ansvar och representerar inte nödvändigtvis de officiella åsikterna från National Institutes of Health. Detta material är också baserat på arbete som stöds av National Science Foundation under Grant No. DBI-1062520. Eventuella åsikter, resultat och slutsatser eller rekommendationer som uttrycks i detta material är författarens/författarnas och återspeglar inte nödvändigtvis National Science Foundations åsikter. Vi tackar BioNLP Shared Task-organisatören för att ha gjort de kommenterade korporna allmänt tillgängliga. Vi tackar Dr Catalina O. Tudor för användbar diskussion och kommentarer till detta manuskript.

                Konkurrerande intressen

                Författarna förklarar att de inte har några konkurrerande intressen.

                Författarnas bidrag

                YP genomförde ramstudierna som beskrivs här, genomförde experimenten och utarbetade manuskriptet. MT deltog i utformningen av studien och har varit med och utarbetat manuskriptet. CW koordinerade studien och har varit med och reviderat manuskriptet kritiskt för viktigt intellektuellt innehåll. KV skapade studien och deltog i dess utformning och koordinering och hjälpte till med att utarbeta manuskriptet. Alla författare läste och godkände det slutliga manuskriptet.


                Titta på videon: Vad är grejen med hur man utser regering efter ett val? (Juli 2022).


Kommentarer:

  1. Farnell

    Ge råd om vad man ska köpa som present till en pojkvän till sin sjuttonåring? Inom tjugo dollar?

  2. Karlis

    Bravo, vilka korrekta ord..., briljant idé

  3. Tihalt

    Det ja!

  4. Ritchie

    Jag började läsa med en skeptisk attityd, men i slutändan var jag glad - författaren är helt enkelt magnifik!



Skriv ett meddelande