Information

Vad betyder min?

Vad betyder min?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Jag läste det

"trp operon ligger på 27 min på E.coli-kromosomen."

Vad betyder "min"?


Min betyder minuter. Minuter räknas för avbrottspunkter sedan början av DNA-överföring i F-pili-medierad konjugation. Punkten "0" är inte associerad med ori, men är nära thr. Den totala kromosomstorleken är 100 min (tiden det tar för konjugering).

Ser:


Mikrobiologi

Våra redaktörer kommer att granska vad du har skickat in och avgöra om artikeln ska ändras.

Mikrobiologi, studie av mikroorganismer, eller mikrober, en mångsidig grupp av i allmänhet små enkla livsformer som inkluderar bakterier, arkéer, alger, svampar, protozoer och virus. Fältet handlar om struktur, funktion och klassificering av sådana organismer och med sätt att både utnyttja och kontrollera deras aktiviteter.

1600-talets upptäckt av levande former som existerade osynliga för blotta ögat var en betydande milstolpe i vetenskapens historia, för från 1200-talet och framåt hade det postulerats att "osynliga" varelser var ansvariga för förfall och sjukdomar. Ordet mikrob myntades under den sista fjärdedelen av 1800-talet för att beskriva dessa organismer, som alla ansågs vara släkt. När mikrobiologin så småningom utvecklades till en specialiserad vetenskap, fann man att mikrober är en mycket stor grupp av extremt olika organismer.

Det dagliga livet är oupplösligt sammanvävt med mikroorganismer. Förutom att befolka både de inre och yttre ytorna av människokroppen, finns mikrober i överflöd i jorden, i haven och i luften. Rikliga, även om de vanligtvis inte märks, ger mikroorganismer gott om bevis på deras närvaro - ibland ogynnsamt, som när de orsakar sönderfall av material eller sprider sjukdomar, och ibland positivt, som när de jäser socker till vin och öl, får bröd att jäsa, smaksätter ostar, och producera värdefulla produkter som antibiotika och insulin. Mikroorganismer är av oöverskådligt värde för jordens ekologi, de sönderdelar djur- och växtrester och omvandlar dem till enklare ämnen som kan återvinnas i andra organismer.


Praktisk nytta av räckvidd

I många fall är dock data tätt klustrade och om antalet observationer är mycket stort kan det ge en bra känsla av datafördelning. Tänk till exempel på en enorm undersökning av IQ-nivåerna för universitetsstudenter som består av 10 000 studenter med olika bakgrunder. I det här fallet kan intervallet vara ett användbart verktyg för att mäta spridningen av IQ-värden bland universitetsstudenter.

Ibland definierar vi intervall på ett sådant sätt att vi eliminerar extremvärdena och extrempunkterna i datamängden. Till exempel definieras inter-kvartilintervallet i statistik som skillnaden mellan den tredje och första kvartilen. Du kan omedelbart se hur denna nya definition av intervall är mer robust än den tidigare. Här spelar extremvärdena ingen roll och denna definition tar hänsyn till hela distributionen av data och inte bara maximi- och minimivärdena.

Det bör påpekas att intervallet, trots flera begränsningar, kan vara en användbar indikation i många fall. Som studerande i statistik bör du förstå vilka typer av data som är bäst lämpade att definieras utifrån räckvidd. Om det finns för många extremvärden kanske det inte är en bra idé. Men räckvidden ger en snabb och enkel att uppskatta indikation på spridningen av data.


Manlig Urethra

Det manliga urinröret består också av tre segment men är mycket längre än honans - cirka 22 cm. Den första delen av det manliga urinröret är känt som prostataurinröret och börjar vid blåshalsen och fortsätter tills det möter prostatakörteln. Ejakulationskanaler som innehåller en blandning av sperma producerad av testiklarna, alkalisk vätska som produceras av prostatakanalerna och sädesvätska som produceras av sädesblåskörtlar töms i denna del av det manliga urinröret. På bilden nedan indikeras spermatransport i blått och urinröret i brunt.

Den membranösa urinröret färdas genom EUS, sedan genom bäckenbotten och den djupa perinealpåsen. Denna del av urinröret är smal och mindre smidig jämfört med de andra två sektionerna så det är mer sannolikt att det blockeras av stenar. Medan den yttre urinrörssfinktern hos honan involverar både urinröret och slidan, omger den hos hanen endast urinröret.

Det svampiga urinröret eller penis urinröret färdas genom mitten av penis, genom bulben och corpus spongiosum, och slutar vid meatus eller yttre urinrörsöppning. Bulbourethral eller Cowpers körtlar matas in i denna del av urinröret och producerar och tillhandahåller extra vätska för att göra utlösning lättare. Där urinröret går genom ollonet vidgas det. Denna vidgade sektion kallas navicular fossa.

Blodtillförseln till urinröret i prostata tillhandahålls av den nedre vesikalartären. Den membranösa urinröret och det svampiga urinröret försörjs av grenar av den inre pudendalartären.

Prostatakörteln omger urinröret, och prostataförstoring – antingen godartad eller malign – kan trycka ihop de motsatta lumenväggarna i urinröret, vilket orsakar stenos. Allvarlig förstoring kräver ofta en kirurgisk prostatektomi.


Orsaker till D äröverensstämmelserna

Förmodligen har Martin et al. (2010) antog inte medvetet olämpliga kladeomskrifter (kompositioner). Det är därför bra att fundera över varför de kan ha antagit dessa begränsningar. Även om Martin et al. (2010) nämnde inte nodbaserade och grenbaserade fylogenetiska definitioner, de citerade följande från PhyloCode Konst. 2.2:

(3) "En nodbaserad klad är en klad som har sitt ursprung i en viss nod på ett fylogenetiskt träd, där noden representerar en härstamning vid ögonblicket av en splittringshändelse."

(4) "En grenbaserad klade är en klad som har sitt ursprung i en viss gren (internod) på ett fylogenetiskt träd, där grenen representerar en härstamning mellan två delande händelser."

Även om Martin et al. (2010, s. 10) föreslog att PhyloCode är oklart huruvida dess regler är avsedda att tillämpas i samband med släktträd kontra relationsträd, visar definitionerna ovan tydligt ett linjeträdsperspektiv (även om betydelsen av en nod i ett släktträd som beskrivs i PhyloCode är inte identisk med den som beskrivs av Martin et al. 2010 se nedan). Således likställer (3) uttryckligen en nod med en släktlinje vid ögonblicket av en släktuppdelningshändelse (snarare än en hel art = en släktlinje mellan två delande händelser, åtminstone under en grenad modell av artbildning [i motsats till spirande och filetisk transformation] modeller se Foote 1996]), och (4) uttryckligen likställer en gren med en släktlinje mellan två splittande händelser (snarare än ett förfader-ättlingförhållande). Om man skulle förbise dessa uttalanden, som Martin et al. (2010) uppenbarligen gjorde det, och överväg bara karaktäriseringarna "en nodbaserad klad är en klad som har sitt ursprung med en viss nod på ett fylogenetiskt träd" och "en grenbaserad klad är en klad som har sitt ursprung med en viss gren på ett fylogenetiskt träd, ” man kan frestas att tillämpa karakteriseringar (3) och (4) i samband med släktträd (snarare än härstamning), vilket uppenbarligen inte var avsett av författarna till PhyloCode (Cantino och de Queiroz 2010).

Martin et al. (2010) drog felaktigt slutsatsen att en grenbaserad omskrift på ett släktträd är parafyletisk eftersom den endast inkluderar en av de två ättlingarna till den förfader som gruppen har sitt ursprung i. Faktum är att inkonsekvensen är värre än de antydde, eftersom konceptet med en grenbaserad klade (en klad som har sitt ursprung i en viss gren på ett fylogenetiskt träd) inte är vettigt i sammanhanget med ett relationsträd. Anledningen är att på ett relationsträd är grenen som kladden antas ha sitt ursprung i en relation snarare än en förfader (d.v.s. en association snarare än en enhet). Icke desto mindre har Martin et al. (2010) tillämpade på ett olämpligt sätt konceptet med en grenbaserad klad i sammanhanget av ett relationsträd, vilket ledde dem till den felaktiga slutsatsen att både grenen (den mellan nod 1 och 3) och nod vid dess bas (1) ska ingå i omskriften men de andra ättlingarna till 1 inte (se fig. 2a) — grenen eftersom kladden i fråga är grenbaserad (har sitt ursprung i en gren), och dess basalnod eftersom enligt "den matematiska definition av en graf. . . man kan inte ha en kant utan båda dess ändpunkter” (Martin et al. 2010, s. 10).

Martin et al. (2010) drog också felaktigt slutsatsen att en nodbaserad omskrivning på ett härstamningsträd är polyfyletisk eftersom den inte inkluderar den förfader som gruppen har sitt ursprung i. Denna felaktiga slutsats är inte bara ett resultat av att tillämpa det nodbaserade konceptet i ett olämpligt sammanhang utan också från en subtil skillnad mellan betydelserna av noder i släktträden av Martin et al. (2010) i motsats till de av PhyloCode (Cantino och de Queiroz 2010). För Martin et al. (2010, s. 4) representerar en nod i ett härstamningsträd en artbildningshändelse i motsats till PhyloCode (se definition [3]), representerar en nod en härstamning vid ögonblicket av en artbildningshändelse (uppenbarligen en förenkling, givet att artbildning är en process). I detta sammanhang har Martin et al. (2010) drog förmodligen slutsatsen att den omskrivna gruppen är polyfyletisk eftersom dess basala nod (den mellan grenarna 2, 4 och 5) är en artbildningshändelse snarare än en förfader, och förfadern (representerad av gren 2) inte ingår i omskrift (se fig. la). Däremot är en härstamning vid tidpunkten för en artbildningshändelse en förfader (även om den bara är en del av hela förfädernas art), och därför konceptet med en nodbaserad klad som definieras i PhyloCode inkluderar förfadern så att gruppen är monofyletisk.

Det är också värt att notera att det finns en motsättning mellan beteckningarna av enheterna som nodbaserade och grenbaserade clades och Martin et al.s slutsatser att de omskrivna grupperna inte är monofyletiska. En clade är monofyletisk per definition.


Sammanfattning

Vad är pre-med? "Pre-med" är en term som studenter använder för att visa att de planerar att gå på läkarskola och tar rätt klasser för att göra det. Det finns inga officiella pre-med majors istället studenter som är pre-med kan huvudämne i vilket ämne de vill och bara ta de klasser som behövs för att söka till medicin skolan.

Det finns flera förberedande krav som krävs för att komma in på medicinskolan. De viktigaste av dessa är de klasser du tar. Varje läkarskola har sina egna krav, men du kan förvänta dig att ta minst ett år av biologi, allmän kemi, organisk kemi och fysik (alla med laborationer), tillsammans med lektioner i biokemi, matematik och engelska.

Det finns egentligen inga "bästa" pre-med majors, men det finns några huvudämnen som är mer populära bland pre-med studenter och gör det lättare för dig att nå pre-med krav. Dessa inkluderar mänsklig biologi, psykologi, biologi och kemi.


Användbarheten av olika sorters definitioner

Martin et al. (2010, s. 10) föreslog att den PhyloCode anta endast en enda sorts träd och motsvarande typ av definition. Jag har visat att deras förslag baserades på ett felaktigt påstående att "nodbaserade" namn är oförenliga med "grenbaserade" träd och vice versa. Icke desto mindre, med tanke på att minimum-clade (”nod-baserad”) och maximum-clade (”branch-based”) definitioner används för att applicera namn på enheter av samma fundamentala slag (clade), och att båda typerna av definitioner kan vara tillämpas i sammanhanget av både relationsträd (”nodbaserade”) och härstamningsträd (”grenbaserade”) kan man ändå frestas att dra slutsatsen att en enda typ av definition är tillräcklig. Åtminstone för personer som likställer de förfäder som specificeras av fylogenetiska definitioner med hela arter (snarare än delar av arter), kan det tyckas att minimum- och maximum-kladedefinitioner helt enkelt är olika metoder för att specificera samma clades och förfäder (Fig. 4). (se Frost och Kluge 1994 Sereno 1999). En sådan slutsats, även om den är korrekt i sammanhanget av fullständig och felfri kunskap om fylogeni, är alltför förenklad i sammanhanget av verkliga (dvs ofullständiga och åtminstone potentiellt felaktiga) fylogenetiska hypoteser, vilket vill säga att det finns pragmatiska skäl för att använda båda typerna av definitioner även i sammanhanget av en enda sorts träd. I resten av det här avsnittet kommer jag för att förenkla diskussionen utgå ifrån att anfadern som en klade har sitt ursprung i är en hel art.

Om förfadern som en clade härstammar från anses vara en hel art (snarare än den sista delen av en art), kan det tyckas som om definitioner av minimum och maximum clade helt enkelt är olika metoder för att specificera samma clades och förfäder. För relationsträdet som illustreras i a) hänvisar den sista gemensamma förfadern till A och B (minimumkladdefinition) och den tidigaste förfadern till A som inte är en förfader till C (maximalkladdefinition) till samma klad, medlemmarna i som representeras av svarta noder. Detsamma gäller för släktträdet som illustreras i b), där medlemmarna i den angivna kladden representeras av tjockare grenar. Även om denna slutsats om likvärdighet skulle vara korrekt om alla arter som någonsin har funnits och deras fylogenetiska samband var kända med säkerhet, illustreras dess begränsningar i sammanhanget av ofullständig och provisorisk kunskap i figurerna 5–7.

Om förfadern som en clade härstammar från anses vara en hel art (snarare än den sista delen av en art), kan det tyckas som om definitioner av minimum och maximum clade helt enkelt är olika metoder för att specificera samma clades och förfäder. För relationsträdet som illustreras i a) hänvisar den sista gemensamma förfadern till A och B (minimumkladdefinition) och den tidigaste förfadern till A som inte är en förfader till C (maximalkladdefinition) till samma klad, medlemmarna i som representeras av svarta noder. Detsamma gäller för släktträdet som illustreras i b), där medlemmarna i den angivna kladden representeras av tjockare grenar. Även om denna slutsats om likvärdighet skulle vara korrekt om alla arter som någonsin har funnits och deras fylogenetiska samband var kända med säkerhet, illustreras dess begränsningar i sammanhanget av ofullständig och provisorisk kunskap i figurerna 5–7.

Krona och totala klader är två betydelsefulla kategorier av klader definierade med avseende på den befintliga biotan (recensionerad av de Queiroz 2007). A kronklädsel är en klad där båda (alla) linjer som härrör från en viss splittringshändelse har bevarade ättlingar (vilket inte är att säga att de inte också har utdöda) en total klädsel är en kladd som består av en kronklad och alla utdöda arter (stamgruppsarter) som är närmare besläktade med den kronkladden än med någon annan kronklad eller existerande art (se Hennig 1965, 1969, 1981 Jefferies 1979 Lauterbach 1989 Meier och Richter 1992 de Queiroz 2007). (Med tanke på att stamarten är en del av [och likvärdig med] kladden som har sitt ursprung i den [ Hennig 1966] kan en art som ännu inte gett upphov till någon dotterart betraktas som en klad som består av den ena arten, och därmed en enda bevarad art som inte har gett upphov till någon dotterart kan betraktas som en kronklad. Utifrån samma utgångspunkt, en förfader-per-se definition är en fylogenetisk definition som tar formen "kladen som har sitt ursprung i D", där D är en art som är känd från exemplar [i motsats till en som enbart antas från ett träd], vare sig den är utdöd eller bevarad.)

Ett faktum med verkliga fylogenetiska hypoteser (i motsats till hypotetiska, som i fig. 4) är att de nästan undantagslöst är baserade på ofullständig artprovtagning, särskilt med avseende på utdöda arter. Men för att definiera namnet på en kronoklad med hjälp av en definition av maximum-clade ("grenbaserad"), skulle det vara nödvändigt att känna till minst en art (och i vissa fall kommer det att ha funnits bara en) av den omedelbara ( ofta utdöd) systergrupp till ifrågavarande kronoklad ( fig. 5). En sådan art (X i Fig. 5) skulle vara en nödvändig (och tillräcklig) extern specificator i en maximikladedefinition av namnet på kronkladen – till exempel max (A inte X) i exemplet (Fig. 5 ). Därför skulle en sådan art inte bara ha upptäckts, den skulle också ha antagits vara systergruppen till kronkladden som ska namnges. Om en annan extern specificering (såsom Y eller Z i Fig. 5) användes istället, skulle namnet inte gälla kronklädseln. Däremot är kännedom om den omedelbara systerarten till en kronklad inte nödvändig för att definiera namnet på den kronkladden med en minimum-clade (”nodbaserad”) definition. Sålunda, i figur 5, skulle följande formel som definierar minsta kladd tillämpa namnet på kronkladden oavsett kunskap om någon utdöd art: min (A och B). Med tanke på att den omedelbara (ofta utdöda) systerarten av en kronklad vanligtvis inte kommer att vara känd, kommer det i allmänhet att vara mer genomförbart att definiera namnen på kronkladerna med hjälp av minimum-clade ("nodbaserade") definitioner.

Begränsningar för maximum-clade (“branch-based”) och användbarheten av minimum-clade (“nod-baserade”) definitioner för att definiera namnen på crown clades. För att definiera namnet på kronkladden som är sammansatt av arterna A och B med hjälp av en maximikladedefinition, måste en medlem av den omedelbara systergruppen till kronkladen – i detta fall utdöd art X – användas som en extern specificator i definierande formel (t.ex. max [A inte X]). Om art X inte har upptäckts och namnet på en annan medlem av stamgruppen (t.ex. Y eller Z) används istället, kommer namnet inte att hänvisa till kronklädseln. Däremot kan den minimala kladden som definierar formeln min (A och B) användas för att applicera ett namn på kronkladden utan kunskap om X eller någon annan medlem av stamgruppen. Trädet som illustreras här är ett härstamningsträd, och de förfäder som clades härstammar från anses vara hela arter (snarare än delar därav). Den vertikala komponenten i diagrammet representerar tid, där nutiden representeras av nivån på terminalnoderna i grenarna A, B och C. Medlemmar av kronklädseln som ska namnges indikeras med tjockare grenar.

Begränsningar för maximum-clade (“branch-based”) och användbarheten av minimum-clade (“nod-baserade”) definitioner för att definiera namnen på crown clades. För att definiera namnet på kronkladden som är sammansatt av arterna A och B med hjälp av en maximikladedefinition, måste en medlem av den omedelbara systergruppen till kronkladen – i detta fall utdöd art X – användas som en extern specificator i definierande formel (t.ex. max [A inte X]). Om art X inte har upptäckts och namnet på en annan medlem av stamgruppen (t.ex. Y eller Z) används istället, kommer namnet inte att hänvisa till kronklädseln. Däremot kan den minimala kladden som definierar formeln min (A och B) användas för att applicera ett namn på kronkladden utan kunskap om X eller någon annan medlem av stamgruppen. Trädet som illustreras här är ett härstamningsträd, och de förfäder som clades härstammar från anses vara hela arter (snarare än delar därav). Den vertikala komponenten i diagrammet representerar tid, där nutiden representeras av nivån på terminalnoderna i grenarna A, B och C. Medlemmar av kronklädseln som ska namnges indikeras med tjockare grenar.

Omvänt, för att definiera namnet på en total clade med hjälp av en minimum-clade ("nodbaserad") definition, skulle det vara nödvändigt att känna till minst en art (och i vissa fall kommer det bara att ha funnits en) som representerar den utdöda kladden som ett resultat av den allra första divergensen inom den totala kladden i fråga (fig. 6). En sådan art (Z i Fig. 6) skulle vara en av de nödvändiga interna specifikationerna i minimum-clade-definitionen - till exempel: min (A och Z) i exemplet (Fig. 6). Därför skulle en sådan art inte bara ha upptäckts, den skulle också ha kunnat antas vara en representant för den utdöda kladden till följd av den allra första divergensen inom den totala kladden som ska namnges. Om en annan intern specificator (som X eller Y i Fig. 6) användes istället, skulle namnet inte gälla för den totala kladden. Däremot är kunskap om en art som representerar den utdöda kladden som är ett resultat av den allra första divergensen inom en total klad inte nödvändig för att definiera namnet på den totala kladden med en definition av maximal clade (”grenbaserad”). Således, i figur 6, skulle följande maximikladedefinierande formel tillämpa namnet på den totala kladden oavsett kunskap om någon utdöd art: max (A inte C). Med tanke på att en art som representerar den utdöda kladden som är ett resultat av den allra första divergensen inom en total klad ofta inte kommer att vara känd, kommer det i allmänhet att vara mer genomförbart att definiera namnen på totala klader med definitioner av maximalt clade ("grenbaserade").

Begränsningar av minimum-clade (”nod-baserad”) och användbarheten av maximum-clade (”branch-based”) definitioner för att definiera namnen på total clades. För att definiera namnet på den totala kladden som motsvarar kronkladen som är sammansatt av arterna A och B med hjälp av en minimikladedefinition, måste en medlem av den utdöda gruppen som representerar den första divergensen inom den totala kladden – i detta fall utdöd art Z – måste användas som en intern specificator i den definierande formeln (t.ex. min [A och Z]). Om art Z inte har upptäckts och namnet på en annan medlem av stamgruppen (t.ex. X eller Y) används istället, kommer namnet inte att referera till den totala kladden. Däremot kan den maximala kladden som definierar formeln max (A inte C) användas för att applicera ett namn på den totala kladden utan kunskap om Z eller någon annan medlem av stamgruppen. Trädet som illustreras här är ett härstamningsträd och de förfäder som clades härstammar från anses vara hela arter (snarare än delar därav). Den vertikala komponenten i diagrammet representerar tid, där nutiden representeras av nivån på terminalnoderna i grenarna A, B och C. Medlemmar av den totala kladden som ska namnges indikeras med tjockare grenar.

Begränsningar av minimum-clade (”nod-baserad”) och användbarheten av maximum-clade (”branch-based”) definitioner för att definiera namnen på total clades. För att definiera namnet på den totala kladden som motsvarar kronkladen som är sammansatt av arterna A och B med hjälp av en minimikladedefinition, måste en medlem av den utdöda gruppen som representerar den första divergensen inom den totala kladden – i detta fall utdöd art Z – måste användas som en intern specificator i den definierande formeln (t.ex. min [A och Z]). Om art Z inte har upptäckts och namnet på en annan medlem av stamgruppen (t.ex. X eller Y) används istället, kommer namnet inte att referera till den totala kladden. Däremot kan den maximala kladden som definierar formeln max (A inte C) användas för att applicera ett namn på den totala kladden utan kunskap om Z eller någon annan medlem av stamgruppen. Trädet som illustreras här är ett härstamningsträd och de förfäder som clades härstammar från anses vara hela arter (snarare än delar därav). Den vertikala komponenten i diagrammet representerar tid, där nutiden representeras av nivån på terminalnoderna i grenarna A, B och C. Medlemmar av den totala kladden som ska namnges indikeras med tjockare grenar.

Att namnge krona kontra totala clades är inte det enda sammanhang där minimum-clade (”nodbaserad”) och maximum-clade (”grenbaserad”) definitioner uppvisar viktiga och användbara skillnader. Dessutom har de två typerna av fylogenetiska definitioner olika konsekvenser i samband med revideringar av fylogenetiska hypoteser som gäller clades mer generellt. I följande exempel gäller samma slutsatser oavsett om kladdarna är kronklader, totala klader, båda eller ingetdera. Tänk på följande definitioner: Athena = min (A och B) Minerva = max (A inte C). I sammanhanget av figur 7a gäller de två namnen samma klad (åtminstone om förfäderna som de angivna kladerna har sitt ursprung i anses vara hela arter snarare än delar därav): den som består av A och B och deras antagna gemensamma förfader. I samband med denna fylogenetiska hypotes, namnen Athena och Minerva är (heterodefinitionella) synonymer. Däremot, i sammanhanget i figur 7b och c, gäller namnen för olika klader och är därför inte längre synonymer. I fallet med figur 7b, Athena är sammansatt av A och B och deras antagna gemensamma förfader, medan Minerva består av A, B och D och två antagna förfäder. Däremot, i fallet med figur 7c, Athena består av A, B, C och två antagna förfäder, medan Minerva består av endast A, vilket vänder på de hierarkiska förhållandena för de namngivna kladerna från föregående fall (fig. 7b).

Olika konsekvenser av minimum-clade (”nod-baserad”) och maximum-clade (”branch-based”) definitioner i samband med alternativa fylogenetiska hypoteser. Följande definitioner tillämpas i samband med de tre fylogenetiska hypoteserna som illustreras i a–c: Athena = min (A och B) Minerva = max (A inte C). I samband med fylogenetisk hypotes a), båda Athena och Minerva hänvisar till samma kladd (namnen är synonyma). I samband med hypotes b), Minerva hänvisar till en mer inkluderande kladd än vad som gör Athena. I samband med hypotes c), Athena hänvisar till en mer inkluderande kladd än vad som gör Minerva. Alla tre träden är relationsträd (grenar representerar relationer noder representerar arter). Gråfyllda cirklar = medlemmar av Athena endast svartfyllda cirklar = medlemmar av Minerva endast grå- och svartfyllda cirklar = medlemmar av båda Athena och Minerva ouppfyllda cirklar = medlemmar av ingendera Athena inte heller Minerva.

Olika konsekvenser av minimum-clade (”nod-baserad”) och maximum-clade (”branch-based”) definitioner i samband med alternativa fylogenetiska hypoteser. Följande definitioner tillämpas i samband med de tre fylogenetiska hypoteserna som illustreras i a–c: Athena = min (A och B) Minerva = max (A inte C). I samband med fylogenetisk hypotes a), båda Athena och Minerva hänvisar till samma kladd (namnen är synonyma). I samband med hypotes b), Minerva hänvisar till en mer inkluderande kladd än vad som gör Athena. I samband med hypotes c), Athena hänvisar till en mer inkluderande kladd än vad som gör Minerva. Alla tre träden är relationsträd (grenar representerar relationer noder representerar arter). Gråfyllda cirklar = medlemmar av Athena endast svartfyllda cirklar = medlemmar av Minerva endast grå- och svartfyllda cirklar = medlemmar av båda Athena och Minerva ouppfyllda cirklar = medlemmar av ingendera Athena inte heller Minerva.

Dessa exempel visar att olika typer av fylogenetiska definitioner har olika konsekvenser i samband med alternativa fylogenetiska hypoteser. Vilken typ av definition som väljs bör därför bero på hur kladden som ska namnges konceptualiseras - det vill säga på den avsedda betydelsen (referensen) av namnet. Till exempel, om man avser att den namngivna kladden alltid ska inkludera både A och B oavsett deras exakta fylogenetiska samband, men om det är acceptabelt att andra taxa, såsom C, ska inkluderas eller exkluderas, då min (A och B) borde användas. Om man däremot avser att den namngivna kladden ska inkludera A och exkludera C under alla hypoteser om samband, så ska max (A inte C) användas istället. Andra typer av definitioner är möjliga, inklusive sådana som gör särskilda namn otillämpliga i samband med specificerade fylogenetiska hypoteser (Lee 1998 de Queiroz och Donoghue 2012).


Var minimalistisk komma från?

De första uppteckningarna av ordet minimalistisk på engelska kommer från tidigt 1900-tal. Minimalistisk och dess relaterade former är alla byggda på adjektivet minimal, vilket betyder "minst möjligt". Minimal kommer ytterst från latinet minimus, som betyder "minst".

De Minimalism konströrelsen utvecklades på 1960-talet. Rörelsen värderade radikal enkelhet (som en målning av en enda färg) för att förhindra att yttre mening påtvingas konstverket. Inom design och arkitektur, en minimalistisk utseende består ofta av en neutral färgpalett och lite utsmyckning. Någon som leder en minimalistisk livsstil har vanligtvis begränsade ägodelar, enligt mottot "less is more."

En ännu mer specifik användning av ordet Minimalistisk är att hänvisa till en medlem av en fraktion av ryska revolutionärer i början av 1900-talet. Däremot kallades medlemmar av en mer extrem fraktion Maximalister. Termen maximalist kan användas på ett mer generellt sätt som motsatsen till minimalistisk, men detta är ovanligt.


» Se de viktigaste biologikraven för 2020-2021

Alla majors i biologiska vetenskaper måste deklarera en koncentration. Koncentrationen ger studenterna möjlighet att specialisera sig i en viss biologisk disciplin eller, när det gäller den allmänna biologikoncentrationen, ta kurser på högre nivå från flera områden inom biologi. Koncentrationer väljs från listan nedan.

  • Animal Physiology (Titta på den här videon för att lära dig mer om Animal Physiology *välj SSO-alternativet för att öppna videon)
    Direktör för grundstudier
    Mark Roberson
  • Biokemi (Titta på den här videon för att lära dig mer om biokemi)
  • Direktör för grundstudier
    Tudorita Tumbar
  • Biodiversitet och systematik(Titta på den här videon för att lära dig mer om biologisk mångfald och systematik)
    Översikt över biologisk mångfald och systematik
    Direktör för grundstudier
    M. Alejandra Gandolfo
  • Computational Biology (video kommer snart)
    Översikt över beräkningsbiologi
    Direktör för grundstudier
    Charles Aquadro
  • Ekologi och evolutionsbiologi (video kommer snart)
    Direktör för grundstudier
    Andre Kessler
  • Allmän biologi (video kommer snart)
    Direktör för grundstudier
    Beth Howland
  • Genetik, genomik och utveckling (video kommer snart)
    Direktör för grundstudier
    Kristina Blake-Hodek
  • Human Nutrition (Titta på den här videon för att lära dig mer om Human Nutrition)
    Direktör för grundstudier
    Marie Caudill
  • Insektsbiologi (video kommer snart)
    Direktör för grundstudier
    John Sanderson
  • Marinbiologi (Titta på den här videon för att lära dig mer om marinbiologi)
    Direktör för grundstudier
    Ian Hewson
  • Mikrobiologi (Titta på den här videon för att lära dig mer om mikrobiologi)
    Direktör för grundstudier
    Ian Hewson
  • Molekylär och cellbiologi (Titta på den här videon för att lära dig mer om molekylär och cellbiologi)
    Direktör för grundstudier
    Tudorita Tumbar
  • Neurobiologi och beteende (Titta på den här videon för att lära dig mer om neurobiologi och beteende)
    Direktör för grundstudier
    David Deitcher
  • Växtbiologi (Titta på den här videon för att lära dig mer om växtbiologi)
    Översikt över växtbiologi
    Direktör för grundstudier
    M. Alejandra Gandolfo

Avdelningarna för biologisk statistik och beräkningsbiologi, ekologi och evolutionsbiologi, entomologi, mikrobiologi, molekylärbiologi och genetik, neurobiologi och beteende, växtbiologi och biomedicinska vetenskaper deltar i majoriteten, liksom avdelningen för näringsvetenskaper.


Vad betyder termen "samtalshastighet" i SNP-analys? - (2008-04-04)

Hej alla,
Jag läste detta papper om en genomomfattande associationsstudie om bröstcancer. I metodiken uteslöt de vissa prover på grundval av "call rate of SNP" och kan du ge några referenser online.
tack

From what I understand a "call" is basically the genotype assignment. I pulled this quote from the background of the paper referenced below (open access paper).

If a SNP's probe intensity values do not pass the detection filter score (DS) or the RAS scores fall outside the boundaries of the statistical model then the SNP is assigned a "NoCall" value. The overall call rate of a sample is equal to the number of SNPs receiving an AA, AB, or BB genotype call divided by the total number of SNPs on the chip.

SNiPer: Improved SNP genotype calling for Affymetrix 10K GeneChip microarray data
Matthew J Huentelman*, David W Craig*, Albert D Shieh*, Jason J Corneveaux, Diane Hu-Lince, John V Pearson and Dietrich A Stephan

From what I understand a "call" is basically the genotype assignment. I pulled this quote from the background of the paper referenced below (open access paper).

If a SNP's probe intensity values do not pass the detection filter score (DS) or the RAS scores fall outside the boundaries of the statistical model then the SNP is assigned a "NoCall" value. The overall call rate of a sample is equal to the number of SNPs receiving an AA, AB, or BB genotype call divided by the total number of SNPs on the chip.

SNiPer: Improved SNP genotype calling for Affymetrix 10K GeneChip microarray data
Matthew J Huentelman*, David W Craig*, Albert D Shieh*, Jason J Corneveaux, Diane Hu-Lince, John V Pearson and Dietrich A Stephan

Thankyou for your prompt reply. i am afraid many of these terms (DS, RAS, SNP probes intensity value) are new to me. can you recommend some basic literature i can read to understand them?

Sorry for the delay in responding - I was not getting notified when there is a response to a post.


Titta på videon: Melissa Horn - Jag saknar dig mindre och mindre (Augusti 2022).