Information

Betydelsen av nyckelordet "läser" i termer av RNA-seq eller nästa generations sekvensering

Betydelsen av nyckelordet



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Jag är en grundexamen i datavetenskap och för närvarande är jag intresserad av bioinformatik. Idag har jag börjat läsa en artikel om klustring och klassificering av icke-kodande RNA finns här och jag har sett ett ord RNA-seq avläst. Även om jag sökte mycket för att lära mig om, kan jag inte hitta definitionen av det, de saker jag hittade handlade om prestationsfrågor av teknik snarare än förklaring av ordet. Så, finns det någon som helt enkelt kan förklara mig vad som är innebörden av detta ord såväl som RNA-seq-teknik?


Vid RNA-sekvensering fragmenteras RNA:t, DNA syntetiseras komplementärt till RNA-fragmenten, vilket följs av en komplementär strängsyntes. Fragmentering kan också göras efter cDNA-syntesen. Detta DNA amplifieras sedan för att bilda ett kluster som sekvenseras. De flesta Next-Gen-sekvenseringsmetoder sekvenserar ett kort segment av DNA:t (det har förbättrats med experimentell och teknisk optimering).

En läsning hänvisar till sekvensen av ett kluster som erhålls efter slutet av sekvenseringsprocessen, vilket i slutändan är sekvensen av en sektion av ett unikt fragment. Om ett RNA uttrycks i höga kopior kommer det att komma fler läsningar från det; läsningar kan också vara överflödiga.


Artighet